KEGG   Rhododendron vialii: 131310752
Entry
131310752         CDS       T09330                                 
Name
(RefSeq) heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1-like
  KO
K12741  heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1/A3
Organism
rvl  Rhododendron vialii
Pathway
rvl03040  Spliceosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:rvl00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09121 Transcription
   03040 Spliceosome
    131310752
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03019 Messenger RNA biogenesis [BR:rvl03019]
    131310752
   03041 Spliceosome [BR:rvl03041]
    131310752
Messenger RNA biogenesis [BR:rvl03019]
 Eukaryotic type
  mRNA surveillance and transport factors
   Transport factors
    Other transport factors
     131310752
   mRNA cycle factors
    Common to processing body (P body) and stress granule
     131310752
Spliceosome [BR:rvl03041]
 Common components
  Common spliceosomal components
   hnRNP proteins
    131310752
SSDB
Motif
Pfam: RRM_1 RRM_7 RRM_PARP14_3 Nup35_RRM_2 NID DUF7661
Other DBs
NCBI-GeneID: 131310752
NCBI-ProteinID: XP_058193924
LinkDB
Position
12a:34337878..34341989
AA seq 447 aa
MDGGGGFAEQHYDSVAFNDGIEEEEEEQYDDEQYGEEQTQQQFSSGRRGIESYGNNVDGS
AGNDIGHRHRGGDSSSGKLFIGGVAWETSEERFTNYFLKYGEITDSVIMVDKLTGRSRGF
GFVTFADPAVADRVLEQEHVIDGRAVEVKRTVPREEMQGQGAQRTRKIFVGGIPTFLTED
ELREYFSSYGSVAEHQIMIDRDTGRSRGFGFVTFESEDTVERIFSDGKTHELGGKQVEIK
KAVPKRAGSDYTYDVRTRHGGSSSKSYGGFGRGAAEYGGGGYGGKMSRQSGPYDGYGGYG
SYGGGNYGGGAYGGYGGYGYGGFGFWGPMYNNTSGYGGGDYGTPGGYGGGSGSTGYGGGK
GYGGGGAGYGGSGGGRGFGGGAGYGGGGGKGYDGGAGYGGGGGRGYGGVGGGGGGRGYGG
GGSSGYGGNKGYGNGGGASGRFHPYQK
NT seq 1344 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggacggtggtggcggtttcgctgaacaacactatgattcggtcgcctttaacgacggc
atagaagaggaagaagaagaacaatacgatgatgaacaatacggtgaggaacaaacccaa
caacagttctcatcgggccgtcgtgggatcgagtcatatggtaacaacgtagatggtagt
gcaggcaatgacataggacaccggcatcgtggtggtgattcttcttcaggaaaactcttt
attggaggcgtcgcgtgggagacatccgaagagagatttaccaattacttcctcaagtat
ggagagatcacagattctgtgattatggtggataagcttacaggaagatcacggggattt
ggatttgtgacatttgctgacccagcagttgctgacagggttttggagcaagaacatgtt
atagatggcagagcggtggaagtgaaaagaacagtccctagggaggaaatgcagggtcaa
ggagcacaaagaacaaggaaaatcttcgttggtggcataccaacatttttgactgaagat
gagctgagggagtatttttcttcctatggtagcgttgcagagcaccagattatgattgat
cgtgacactgggcggtcaagaggctttgggtttgttacctttgagagcgaagatactgtt
gagaggattttctctgatggcaaaactcatgaacttggtggcaaacaagtggaaataaag
aaggccgtgccgaaaagagctggaagtgactatacttatgatgttaggacacgtcacggt
gggagttcttcaaagtcctatggtggctttggcagaggtgcagctgaatatggaggtggt
ggatacggtggaaaaatgagcagacaatctggtccctatgatgggtatggtggttatggc
agttatggtgggggaaactacggtggtggagcatatggtggctacggtggatatggctat
ggtggatttgggttttgggggcctatgtataataataccagtggttatggaggtggtgat
tatggtacccctggtggttatggtgggggcagcggtagcactgggtatggtggtggtaaa
ggttatggaggtggtggtgctgggtatggtggcagcggcggcggtagaggattcggaggt
ggtgctgggtatggtggtggtggaggtaaaggatatgatggcggtgctgggtatggtggc
ggcggtggtagaggatatggtggcgttggcggcggcggtggtggcagaggatacggtggt
ggtggtagtagtggatatggtggcaataaaggatatggaaatggtggtggtgcaagcgga
aggttccatccttaccagaagtga

DBGET integrated database retrieval system