Rhododendron vialii: 131314678
Help
Entry
131314678 CDS
T09330
Name
(RefSeq) pumilio homolog 2-like
KO
K17943
pumilio RNA-binding family
Organism
rvl
Rhododendron vialii
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
NABP
PUF
PUF_NOP9
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
131314678
NCBI-ProteinID:
XP_058199479
LinkDB
All DBs
Position
13a:complement(8521006..8528119)
Genome browser
AA seq
1019 aa
AA seq
DB search
MLSEMGRRPVLGGNEGGGSFGDELEKEISLLLREQRRQDGDDDREKELNLYRSGSAPPTV
EGSLSAVGGLFNHGGAAGGAAAFSGFSNRKSGNGFVSEEEIRSDPAYLSYYYSNPNLNPR
LPPPLVSKEDWRSSQRLQGGSSALGGIGDRRKVSRNDSGGGSGSGRSMFSMPPGFRSKKV
ERESESESEKVHASGEWGVDGLIGLPGLGLGGKQKSFAEIFQDDSGHASPAAGYPSRPAS
RNAFENAEIMGSVESELAHLRSELSSSNSRRSNVNVQSSSAVQNGGPPASYSYAAALGTS
LSRSTTPDPQIARAPSPCLAPIGGDRVNASEKRSVNSPNSFNGMSTSLTETADLVAALSG
VKLSNGVTGEENHLPPQIEPVIDDHNNYLFNLQSGQNNAEQHPYAKNFESGLNNSLVFDR
QVDHITAASPNKSYLKGSAASTLNSKGSLPSHYQHLDSPNSSFLDYGLGGYSMNTTMPSM
MGGHLGTSNLPPLYENVAAASAMGVAGMDPRFLASGFSLSPGASESQNQAPLVDPMYLQY
LRTAEYAAALNDPSMDRNYIGDSYTDLLQKAYMGSLLSPHKSQYVLPTGTKPGGSNHHRY
YGNPAYGVGFSYPGSPLASPVGPGSPMRHGELNMRIPSIMKNMGGSVMGHSWHLQAGYNM
DDAFASSLLEEFKSNKAKCFELSEIAGHVVDFSADQYGSRFIQQKLETATTEEKNMVFEE
INVQALTLMTDVFGNYVIQKFFEHGLVSQKRELAGKLFGHVLSLSLQMYGCRVIQKAIEV
VDMDQKIKMVEELDGHVMRCVRDQNGNHVIQKCIECVPEEHIQFIITTFYDQVVTLSTHP
YGCRVIQRILEHCRDPKTQSKVMDEVLGSVSMLAQDQYGNYVIQHVLEHGKPHERSTIIK
ELAGKIVQMSQQKFASNVVEKCLTFGGPSERQLLVDEMLGLTDENEPLQAMMKDQFANYV
VQKVLETCDDHHRELILSRIKVHLNALKKYTYGKHIVARVEKLVAAGERRIAVQSPHLA
NT seq
3060 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttgtctgaaatgggtaggaggccggttcttggtggtaacgaaggaggtggatctttt
ggagatgaattggagaaagaaatcagcttgttgctccgcgagcagaggcgacaggacggc
gacgatgatcgcgaaaaggagctgaatttgtacaggagtggctcagctcctcccactgtg
gagggctcactgagtgctgttggtggtttgtttaatcacggtggtgctgccggtggtgct
gccgccttttcagggttttccaataggaaaagtggtaatgggtttgtgtcagaggaagag
attaggtccgatcctgcttatttatcgtattactattcgaatccgaacttgaaccctagg
ctgccgcctcctttggtatctaaggaggactggcggtcctcccagaggttgcaaggaggg
agttcggcgttgggcgggattggggatagaagaaaagtgagtaggaatgatagtggtggt
ggtagtggtagtggaagatccatgttttcaatgccgccagggtttaggtcaaagaaagta
gagagggagagtgagagtgagtcggaaaaagtccatgcttcgggagagtggggtgttgat
ggactgattgggttgcctggtttaggacttggtgggaagcagaagagctttgctgaaata
tttcaggatgattcggggcatgcatctcctgctgctgggtacccttcccggcctgcaagt
cgtaatgcttttgaaaatgccgaaattatgggttctgttgaatctgagctggctcatttg
cgtagcgaattgtcgtcctcaaatagtaggcgttccaatgtaaatgttcagagctcatct
gctgttcaaaatggtggcccacctgcgtcatattcttatgctgctgcgttgggcacttcc
ttgtctcgaagcaccacacctgatccccaaattgctagggctcctagtccttgccttgct
cctattggtggagatagggtaaacgcgtctgaaaagagaagtgttaatagtcccaactca
tttaacggcatgtctacttccttgacagagactgcagatctggtcgctgctttgtctggt
gtaaagctttcaaatggcgtgacaggtgaagagaaccatctgcccccccagattgaaccg
gttatcgacgatcacaacaattatctcttcaatttgcaaagtggtcagaataatgctgag
cagcatccgtacgctaagaattttgaatcagggcttaataactccttggtatttgatagg
caagttgaccatataactgctgcttctcccaataaatcgtacctaaaaggatctgctgct
tctactcttaacagcaaaggaagtttaccttctcactatcagcatttggatagtcctaat
tcatcgtttttggactatggattaggggggtactccatgaacaccacaatgccctcaatg
atgggtggccatttaggcacttctaatctgccacctttatacgaaaatgttgctgccgca
tcggccatgggtgtcgccggaatggacccaagatttttggcttctggttttagtctgagc
cccggagcttcagaatcacaaaatcaggcgcctcttgtggatcctatgtatcttcagtac
ttgaggaccgctgagtatgctgcagctcttaatgacccctctatggataggaattacatt
ggagactcgtacacggatttacttcaaaaagcttatatgggttctttgctatcacctcat
aaatcacagtatgttcttcccacaggcacaaagcccggtggttcgaatcaccaccggtac
tatggtaatcctgcatatggtgttggtttctcttatcccggaagccccttggctagtcct
gttggacctggtagtcctatgaggcatggtgaactcaatatgcggatcccttctataatg
aaaaacatgggtgggagtgtaatgggacactcctggcacttacaggctggttataacatg
gacgatgcctttgcatcctctttactggaagagtttaagagcaataaagccaagtgtttt
gaactttcggaaatcgctggtcatgttgttgatttcagtgcggatcagtatgggagccgc
ttcatccaacagaagctcgaaaccgcaacgacagaggagaaaaacatggtttttgaggaa
atcaacgtacaagctcttactttgatgactgatgtgtttggtaattatgtgattcaaaag
ttttttgagcatggacttgtgtcccagaaaagagaactggctggcaagctttttgggcat
gtgttgtcacttagccttcaaatgtatggttgtcgagtcatccagaaggctatagaagtg
gttgatatggatcaaaagataaaaatggtagaagagctcgatggtcatgtcatgcgctgt
gtgcgtgatcagaatgggaaccatgtcattcagaagtgtattgaatgtgttcctgaagaa
catattcagtttattattacaacattttacgatcaagttgtgactctttccacccatcca
tatgggtgtcgtgtgatacagaggatattggaacactgcagggatccaaagacccagagt
aaagtgatggatgaagttttaggatctgttagcatgttagcacaagatcagtatggcaat
tatgttatacagcatgttctggagcatggaaagccacatgagcgatcgacaataatcaag
gaattagccgggaagatagttcaaatgagccagcagaagtttgcctccaatgttgtggag
aaatgtttaacttttggtggtccttctgaacgtcagctcctggtcgatgagatgcttgga
cttactgatgagaatgaaccccttcaggcaatgatgaaagatcaatttgccaattatgtt
gtgcaaaaagttctggaaacttgtgatgatcaccatcgtgaactgatcctatcgcgaatt
aaggttcatctgaatgcactgaagaaatacacttacggaaagcatattgttgctcgggta
gagaagcttgttgcagctggagaaaggagaattgcagttcagtctccgcaccttgcttag
DBGET
integrated database retrieval system