Rhododendron vialii: 131316644
Help
Entry
131316644 CDS
T09330
Name
(RefSeq) heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1
KO
K14411
RNA-binding protein Musashi
Organism
rvl
Rhododendron vialii
Pathway
rvl03015
mRNA surveillance pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
rvl00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
131316644
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
rvl03019
]
131316644
Messenger RNA biogenesis [BR:
rvl03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Other transport factors
131316644
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
RRM_7
RRM_PARP14_3
RRM_PARP14_1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
131316644
NCBI-ProteinID:
XP_058202060
LinkDB
All DBs
Position
2a:complement(5275058..5282212)
Genome browser
AA seq
438 aa
AA seq
DB search
MDSDQGKLFIGGISWETTEEKLKDYFESYGAVLQTVIMRDKLTGKPRGFGFVVFADPSVL
DRVLQDAHTIDGRTVEAKRALSRGEQQPSSRSGHNNNARNFGSGGETKTKKIFVGGLPPT
LSEEGFRQYFESYGNVTDVVVMYDQQTQRPRGFGFVSFDDEDAVDRVLHKTFHDLDGKQV
EVKRALPKDSNPGGGGSGRSMGGGAGGGGGGYQGYSASGGNSGSYDGRVDSSNRYMQSQN
TGGGFPPYASSGYNAPGYGYGPSNNSMGYGGYGSYGGPGAAGYGNPNVPSAGYGSGPPGA
PRSSWSSQAPSGYGAVGPTGQSPGGGASGYGAQGYGYGGYGGSDGSYANQAAYGAVGGRA
GSVPNSNAPGSGAGEMQGGGGGYMGGSYGDANGNVGYGNQGWTSQASGNYGAQANSQGGP
VGYGSGYGGAPTRQAQQQ
NT seq
1317 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggactcagaccagggaaagctcttcatcggcgggatttcgtgggagaccaccgaggag
aagctgaaggactacttcgagtcctacggcgcggtcttgcagaccgttatcatgagagac
aagctcactgggaagccaagggggtttgggttcgtcgtgtttgcagatccgtcggtcctc
gatagggttcttcaggacgcgcacaccattgacggccgaactgttgaggctaagagggcc
ttatcaaggggtgaacaacagccttcctccaggtctggacataataataatgctagaaac
tttggaagtggcggagaaaccaagaccaagaaaatatttgttggaggcttgccacctact
ttgagcgaggaaggatttcgtcagtattttgagtcttatggtaatgtgacggatgtggta
gttatgtatgatcagcaaacccaacgacctcgtggatttgggtttgtttcctttgatgac
gaggatgcagtcgatagggttttgcacaagacattccatgatttagacggtaagcaagtg
gaagtcaagcgtgctctgcctaaagattccaaccctggcggtggtggcagtggccgttcc
atgggtggaggtgctgggggtggtggtggtggttatcagggttacagtgcttctggcggc
aactctggttcttatgatggtcgagtggattcttccaacaggtacatgcaatcgcagaat
actggaggtgggttcccaccttatgcttcttctgggtataatgctcctggttatggatat
ggtccttcaaataacagcatgggttatggtggttatggaagttatggtggccccggagct
gcgggatacggaaacccaaatgtccctagtgctggttatggaagtggtccaccgggggcc
ccacggagttcatggagctctcaggctccctctggctatggtgctgttggacccacgggt
caatctcctggcggaggagcttctgggtatggcgcccaagggtatggttatggtgggtat
ggtgggtcagatgggtcttatgcaaatcaagccgcgtatggtgctgttggagggcgcgca
gggagtgtcccaaatagcaatgctcctggtagtggtgctggagagatgcagggtggtggt
gggggctacatgggaggtagctatggcgatgccaatgggaatgtagggtatggaaatcaa
ggatggacctctcaagcttctggaaattatggagctcaggcaaattcgcaaggcgggcca
gttggatatggtagtggttatggtggtgctccaacacgacaggctcaacagcaatga
DBGET
integrated database retrieval system
