Rhododendron vialii: 131322859
Help
Entry
131322859 CDS
T09330
Name
(RefSeq) heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1-like
KO
K14411
RNA-binding protein Musashi
Organism
rvl
Rhododendron vialii
Pathway
rvl03015
mRNA surveillance pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
rvl00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
131322859
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
rvl03019
]
131322859
Messenger RNA biogenesis [BR:
rvl03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Other transport factors
131322859
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
RRM_7
RRM_PARP14_3
RRM_PARP14_1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
131322859
NCBI-ProteinID:
XP_058210374
LinkDB
All DBs
Position
4a:34578914..34583654
Genome browser
AA seq
463 aa
AA seq
DB search
MDSDQGKLFIGGISWETDEGKLSDYFGNYGDVLQTVVMRDKITGRPRGFGFVVFADPSVL
DRVLQEKHTIDGRTVEAKRAMSRDEHQTASRAGNGNSARNFGGGGNYRTKKIFVGGLPAT
LTEEGFRQYFESYGNVTDVVVMYDQATQRPRGFGFVSFDSEEAVDRVLHKTFHDLNGKQV
EVKRALPKDANPSGGGRSTAGGGAGGGGGYQAGYGASGGNSGSFDGRMDSNRYMQSQNAG
GGFPAYGSSGYSASGYGYGPANNSMGYGGYGGYGAANPGYGGAAATAYGNPNAPSPGYGT
GPPGPARNSWSSQASSGYGAAGYVNASAWGGSATGGPGSAPTGQSPGGASGYGNQGYGYG
GYGGLDGSYANQAAYGAVGGRAGSVPSSNASASGGEMQGSGGAYRGGGGYGDANGTSGYG
NQGWNDPSQTSGSYGAQANGPHGGPVGYGGGYGGAPTRQAQQQ
NT seq
1392 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggattcggaccagggcaagctcttcatcgggggcatctcgtgggaaacggacgaaggc
aaactgagcgactacttcggtaactacggcgacgttttgcagaccgtggtgatgagggac
aagatcaccggcaggcccagagggttcgggttcgtggtcttcgcggatccttcggtcctc
gatagggtccttcaagaaaaacacaccatcgacggtagaacggttgaggctaagagagcg
atgtcaagagatgaacaccagactgcctctagagctggaaatggtaactctgctagaaat
tttggaggtggtggaaattataggaccaagaaaatatttgttgggggcttgccagcaact
ttgactgaggaaggatttcgacaatattttgaatcttatggtaatgttacagatgttgtg
gtcatgtatgatcaggccacccagcggcctcgtggatttgggtttgtttcttttgatagc
gaagaagcagtcgatagggtattgcacaagacattccacgacttgaatggtaaacaggtg
gaagtaaagcgtgctcttcccaaagacgccaaccccagcggcggtggccgttccacggct
ggtggtggtgcaggtggtggcggaggttatcaggctggttatggtgcttctggcggaaat
tcaggatcttttgatggccgaatggattcaaacagatacatgcagtctcaaaatgctgga
ggtggttttccggcttatggttcttctggatatagtgcttctggttatgggtacggtccc
gccaataacagcatgggttatggcggttatggcggttatggtgctgccaatccggggtat
ggaggtgcagctgctacagcttacggaaaccctaatgcacctagtcctggttatggaacc
ggtccaccgggtcctgcacgaaattcttggagctcccaggcttcctcagggtatggtgct
gccggttatgtgaatgcctctgcttggggtggtagtgcaaccggtgggcccggttctgca
cccacgggtcaatctccaggtggggcttctgggtatggaaaccaaggttatgggtatggt
gggtatggtggattggacgggtcttatgcaaatcaagctgcttatggtgctgttggtggt
cgtgccggaagtgtccccagtagtaatgcttctgccagtgggggagagatgcaaggcagt
ggtggggcctacaggggaggtggtggctatggtgatgccaatgggacttcagggtatgga
aatcaaggatggaatgatccttctcaaacatctggaagttatggagctcaggcaaatggg
cctcatggcgggccagttggatatggtggtgggtatggcggtgccccgactcgacaggct
caacagcagtga
DBGET
integrated database retrieval system
