Staphylococcus aureus RF122: SAB0835
Help
Entry
SAB0835 CDS
T00303
Name
(GenBank) ATP-dependent nuclease subunit B
KO
K16899
ATP-dependent helicase/nuclease subunit B [EC:
5.6.2.4
3.1.-.-]
Organism
sab
Staphylococcus aureus RF122
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
sab00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
sab03400
]
SAB0835
Enzymes [BR:
sab01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.4 DNA 3'-5' helicase
SAB0835
DNA repair and recombination proteins [BR:
sab03400
]
Prokaryotic type
DSBR (double strand breaks repair)
HR (homologous recombination)
AddAB pathway proteins
SAB0835
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ADDB_N
PDDEXK_1
UvrD_C
AAA_30
Glycoprot_B_PH1
Anamorsin_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CAI80523
UniProt:
Q2YWU2
LinkDB
All DBs
Position
900358..903834
Genome browser
AA seq
1158 aa
AA seq
DB search
MTLHAYLGRAGTGKSTKMLTEIKQKMKADPLGDPIILIAPTQSTFQLEQAFVNDPELNGS
LRTEVLHFERLSHRIFQEVGSYSEQKLSKAATEMMIYNIVQEQQKYLKLYQSQAKYYGFS
EKLTEQIQDFKKYAVTPEHLESFIADKNMQTRTKNKLEDIALIYREFEQRIQNEFITGED
ALQYFIDCMPKSEWLKCADIYIDGFHNFSTIEYLIIKGLIKYAKSVTIILTTDGNHDQFS
LFRKPSEVLRHIEEIANELNISIERQYFKQSYRFNNQDLKHLEQEFDALQINRVACQGHI
NILESATMREEINEIARRIIVDIRDKQLRYQDIAILYRDESYAYLFDSILPLYNIPYNID
TKRSMTHHPVMEMIRSLIEVIQSNWQVNPMLRLLKTDVLTASYLKSAYLVDLLENFVLER
GIYGKRWLDDELFNVEHFSKMGRKAHKLTEDERNTFEQVVKLKKDVIDKILHFEKQMSQA
ATVKDFATAFYESMEYFELPNQLMTERDELDLNGYHEKAEEIDQIWNGLIQILDDLVLVF
GDEPMSMERFLEVFDIGLEQLEFVVIPQTLDQVSIGTMDLAKVDNKQHVYLVGMNDGTMP
QPVTASSLITDEEKKYFEQQANVELSPTSDILQMDEAFVCYVAMTRAKGNVTFSYSLMGS
SGDDKEISPFLNQIQSLFNQLEITNLPQYHEVNPLSLMQHAKQTKITLFEALRAWLDDEI
VADSWLDAYQVIRDSDHLNQGLDYLMSALTFDNETVKLGETLSKDLYGKEINASVSRFEG
YQQCPFKHYASHGLKLNERTKYELQNFDLGDIFHSVLKYISERINGDFKQLDLKKIRQLT
NEALEEILPKVQFNLLNSSAYYRYLSRRIGAIVETTLSALKYQGTYSKFMPKHFETSFRR
KPRTNDELIAQTLTTTQGIPINIRGQIDRIDTYTKNDTSFVNIIDYKSSEGSATLDLTKV
YYGMQMQMMTYMDIVLQNKQRLGLTDIVKPGGLLYFHVHEPRIKFKSWADIDEDKLEQDL
IKKFKLSGLVNADQTVIDALDIRLEPKFTSDIVPVGLNKDGSLSKRGSQVADEATIYKFI
QHNKENFIETASNIMDGHTEVAPLKYKQKLPCAFCSYQSVCHVDGMIDSKRYRTVDETIN
PIEAIQNINIDDEFGGEQ
NT seq
3477 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacattacatgcttatttaggtagagcgggaacaggtaagtctacgaaaatgttgacc
gaaataaaacaaaaaatgaaagcagatccgcttggagatccaatcattttaattgcgcca
actcaaagtacatttcaattagaacaagcctttgtcaatgatccggaattaaatggtagt
ttaagaacagaagtgttgcactttgaacgattaagtcatcgtattttccaagaagttggt
agttatagcgaacaaaagttatctaaagctgcaacggaaatgatgatttataacattgtt
caagaacaacaaaagtatttaaaactttatcaatcacaagcaaaatattatgggtttagt
gaaaaattaacagaacaaattcaagattttaaaaaatatgcagtaacgcctgaacattta
gaaagctttattgctgataaaaatatgcaaactcgaactaaaaataagttagaggatatt
gctttaatataccgagagttcgaacaacgcattcaaaacgagtttattacgggtgaggat
gcattacaatattttattgattgtatgccgaaatcagagtggctaaaatgtgctgatata
tatattgatggatttcacaacttttcaacgattgagtatttgataatcaaaggattaatt
aaatatgcgaagagtgtcacaattatattgacgacagatggtaaccacgatcaattcagt
ttatttaggaaaccatcggaagtgttacgacatattgaagaaatagcaaatgaactcaat
atttctattgaacgtcaatatttcaagcaatcatatcgctttaataatcaagatttaaag
catcttgaacaagaatttgatgcacttcaaatcaatcgagtggcatgtcaaggtcatatc
aatattttagaatctgcgactatgagagaggaaataaatgaaattgcacgacgtatcatc
gttgatattcgtgataagcaattacgatatcaagatattgctattttatatcgtgacgag
tcttatgcttatttatttgattccatattaccgctttataatattccttataacattgat
acaaagcgttcgatgacacatcatccggtcatggaaatgattcgttcattgattgaagtt
attcaatctaattggcaagttaatccaatgctacgcttattaaagactgatgtgttaacg
gcatcatatctaaaaagtgcatacttagttgatttacttgaaaattttgtacttgaacgt
ggtatatacggtaaacgttggttagatgatgagctatttaatgtcgaacattttagcaaa
atggggcgtaaagcgcataaactgaccgaagatgaacgtaacacatttgaacaagtcgtt
aagttaaagaaagatgtcattgataaaattttacattttgaaaagcaaatgtcacaagca
gcaactgtaaaagactttgcaactgctttttatgaaagtatggaatattttgaactgcca
aatcaattgatgacagagcgagatgaacttgatttaaatggttatcatgaaaaggcggaa
gaaattgatcaaatatggaatggcttaattcaaatccttgatgacttagttctagtattt
ggagatgaaccaatgtcgatggaacgtttcttagaagtatttgatattggtttagaacaa
ctagaatttgttgtgattccgcaaacattggaccaagttagtattggtacgatggatttg
gctaaagttgacaataagcaacatgtttacttagttggaatgaatgatggaacgatgcca
caaccagtaactgcgtcaagcttgattacagatgaagaaaagaaatattttgaacagcag
gctaatgtcgagttaagtccaacatcagatattttacagatggatgaagcatttgtttgt
tatgttgctatgactagagctaaggggaatgttacattttcttatagtctaatgggatca
agtggtgatgataaggaaatcagcccatttttaaatcaaattcaatcattgttcaaccaa
ttggaaattactaaccttcctcaataccatgaagttaacccattgtcactaatgcaacat
gctaagcaaaccaaaattacattatttgaagcattgcgtgcttggttagatgatgaaatt
gtggctgatagttggttagatgcttatcaagtaattagagatagcgatcatttaaatcaa
ggtttagattatttaatgtcagcattaacgtttgacaatgaaactgtaaaattaggtgaa
acgttgtctaaagatttatatggtaaggaaatcaatgccagtgtatctcgatttgaaggt
tatcaacaatgcccatttaaacactatgcctcacatggtctgaaactaaatgagcgaacg
aagtatgaacttcaaaactttgatttaggtgatattttccattccgttttaaaatatata
tctgaacgtattaatggcgattttaaacaattagacctgaaaaaaataagacaattaacg
aatgaagcattggaagaaattttacctaaagttcagtttaatttattaaattcttcagct
tactatcgttatttatcaagacgcattggcgctattgtagaaacaacactaagcgcatta
aaatatcaaggcacgtattcaaagtttatgccaaaacattttgagacaagttttagaagg
aaaccaagaacaaatgacgaattaattgcacaaacattaacgacaactcaaggtattcca
attaatattagagggcaaattgaccgtatcgatacgtatacaaagaatgatacaagtttt
gttaatatcattgactataaatcctctgaaggtagtgcgacacttgatttaacaaaagta
tattatggtatgcaaatgcaaatgatgacatacatggatatcgttttacaaaataaacaa
cgccttggattaacagatattgtgaaaccaggcggattattatatttccatgtacatgaa
cctagaattaaatttaaatcatgggctgatattgatgaagataaactagaacaagattta
attaaaaagtttaagctgagtggtttagtgaatgcagaccaaactgttattgatgcattg
gatattcgtttagaacctaaattcacttcagatattgtgccagttggtttgaataaagat
ggttctttgagtaaacgaggcagccaagttgcagatgaagcaacgatttataaattcatc
caacataacaaagaaaattttatagaaacagcttcaaatattatggatggacatactgaa
gttgcaccattaaagtacaaacaaaaattgccatgtgctttttgtagttatcaatcggta
tgtcatgtagatggcatgattgatagtaagcgatatcgaactgtagatgaaacaataaat
ccaattgaagcaattcaaaatattaacattgatgatgaatttgggggtgagcaatag
DBGET
integrated database retrieval system
