Staphylococcus aureus RF122: SAB1289c
Help
Entry
SAB1289c CDS
T00303
Name
(GenBank) truncated cell surface fibronectin-binding protein
Organism
sab
Staphylococcus aureus RF122
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
GA
FIVAR
DUF1542
Rib
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CAI80978
LinkDB
All DBs
Position
complement(1403175..1408925)
Genome browser
AA seq
1916 aa
AA seq
DB search
MNTTKAALHGDVKLQNDKDHAKQTVSQLAHLNNAQKHMEDTLIDSETTRTAVKQYLTEAQ
ALDQLMNTLQQSIADKDATRASSAYVNAKPNKKQAYDEAVQNAESIIAGLNNPTINKGNV
SSATQAVTTSKNGLDGVERLAQDKQTAGNSLNHLDQLTPAQQQALENQINNATTRDKVAE
IIAQAQALNEAMKALKESIKDQPQTEASSKFINEDQAQKDAYTQAVQHAKDLINKTTDPT
LVKSVIDQATQAVNDAKNNLHGDQKLAQDKQHAVTDLNQLNGLNNPQRQALESQINNAGT
RDEVAQKLAEAKALDQAMQALRNSIQDQQQTEAASKFINEDKPQKDAYQTAVQHAKDLIN
QTGNPTLDKSQVEQLKQAVTTAKDNLHGDQKLARDQQQAVTTVNTLPNLNHAQQQALTDA
INAAPTRTEVAQHVQTATELDHAMETLKNKVDQVNTDKAQPNYTEASTDKKEAVDQALQA
AESITDPTNGSNANKDAVEQALTKLQEKVNELNGNERVAEAKTQAKQTIDQLTHLNAEQI
ATAKQNIDQATKLQPIAELVDQATQLNQSMDQLQQAVNEHANVEQTVDYTQADSDKQNAY
KQAIAAAENVLKQNANKQQVDQALQNILNAKQALNGDERVALAKTNGKHDIDQLNALNNA
QQDGFKGRIDQSNDLNQIQQIVDEAKALNRAMNQLSQEITGNEGRTKGSTNYVNADTQVK
QVYDEAVDKAKQALDKSTGQNLTAEQVIKLNDAVTAAKKALNGEERLNNRKSEALQRLNQ
LTHLNNAQRQLAIQQINNAETLNKASRAINRATKLDNAMGAVHQYIDEQHLGVISSTNYI
NADDNLKANYDNAIANAAHELDKVQGNAIAKAEAEQLKQNIIDAQNALNGDQNLANAKDK
ANALVNSLNGLNQQQQDLAHKAINNADTVSDVTDIVNNQIDLNDAMETLKHLVDNEIPNA
EQTVNYQNADDNAKTNFDDAKRLANTLLNSDNTNVNDINGAIQAVNDAIQNLNGDQRLQD
AKDKAIQSINQALTYKLKEIEASNATEQDKLIAKNKAEELANSIINNINKATSNQGVSQV
QTAGKQAIEQVHANEIPKAKIDANKDADKQVQALIDEIDRNPNLTDKEKQALKDRINQIL
QQGHNDINNAMTKEEIEQAKDRLAQALQDIKDLVKAKEDAKQDVDKRVQALIDEIDQNPN
LTDKEKQALKDRINQILQQGHNDINNAMTKEEIEQAKERLAQALQDIKDLVKAKEDAKNK
IKALANAKRDQINSNPDLTPEQKAKALKEIDEAEKRALQNVENAQTIDQLNRGLNLGLDD
IRNTHVWEVDDQPAVNEISEATPEQLLVNGELIVHRDDIITEQDVLAHINLIDQLTAEVI
DTPSTATISDSLTAKVEVTLLDGSKVIVNVPVKVVEKELSVVKQQAIESIENAAQQKINE
INNSVTLTLEQKEAAIAEVNKLKQQAIDHINNAPDVHSVEEIQQQEQAHIEQFNPEQFTI
EQAKSNAIKSIEDAIQQMIDEIKARTDLTDKEKQEAIAKLNQLKEQAIQAIQRAQSIDEI
TEQLEQFKAQMKAANPLAKELAKRKQEAISRIKDFSNEKMNSIRNSEIGSADEKQAAMNR
INEIVLETIRDINNAHTLQQVEAALNNGIARISAVQIVTSDRAKQSLSNGNESNSHLTIG
YGTANHPFNSSTIGHKKKLDEDDDIDPLHMRHFSNNFGNVIKNAIGVVGISGLLASFWFF
IAKRRRKEDEEEELEIRDNNKDSIKETLDDTKHLPLLFAKRHRKEEEEDVTVEEKDSLNN
GESLDKVKHTPFFLPKRRRKEEEEDVEVTNENTDEKVLKDNEHSPLLIAKRRKDKEEDVE
TTSIESKDEDVPLLLAKKKNQKDNQSKDKKSASKNTSKKVTAKKKKKKSKKNNLFL
NT seq
5751 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgaatacaacgaaagcagcattacatggtgatgtgaagttacaaaatgataaagatcat
gctaaacaaacggttagtcaattagcacatctaaacaatgcacaaaaacatatggaagat
acgttaattgatagtgaaacaactagaacagcagttaagcaatatttgactgaagcacaa
gcattagatcaacttatgaatacattacaacaaagtattgctgacaaagatgcaacacgt
gcgagcagtgcatatgtcaatgcaaaaccgaataaaaaacaagcatatgatgaagcagtt
caaaatgctgagtctatcattgcaggattaaataatccgactatcaataaaggaaatgta
tcaagtgcgacacaagcagtgacgacatctaaaaatggtttagatggtgttgaacgatta
gctcaagataagcaaacagctggaaattctctaaatcatttagatcaattaacaccagct
caacaacaagcgttagaaaatcaaattaataatgcaacaactcgtgataaagtggctgaa
atcattgcacaagcgcaagcattaaatgaagcaatgaaagcattaaaagaaagtattaaa
gatcaaccacaaactgaagcaagtagtaaatttattaacgaggatcaagcgcaaaaagat
gcttatacgcaagcagtacaacacgcgaaagatttgattaacaaaacaactgatcctaca
ttagttaaatcagtaattgatcaagcaacacaagcagtgaatgacgctaaaaacaactta
catggtgatcaaaaattagctcaagataagcaacatgcagttactgatttaaatcaatta
aatggtttaaataatccgcaacgtcaagctcttgaaagtcaaataaacaacgcaggaact
cgtgatgaagtagcgcaaaaattagctgaagcaaaagcgcttgatcaagcaatgcaagca
ttacgtaatagtattcaagatcaacaacaaacagaagcggctagcaagtttatcaatgaa
gataaaccacaaaaggatgcttatcaaacagcggttcagcatgcaaaagatttaattaac
caaacaggtaatccaacacttgataaatcacaagttgaacaattgaaacaagcagtaaca
actgcaaaagataacctacatggtgatcaaaaacttgctcgtgatcaacaacaagcagta
acaactgtaaatacattgccaaacttaaatcatgcacaacaacaagcattaactgatgct
ataaatgcagcgcctacaagaacagaggttgcacaacatgttcaaactgctactgaactt
gatcacgcgatggaaacattgaaaaataaagttgatcaagtgaatacagataaggctcaa
ccaaattacactgaagcgtcaactgataaaaaagaagcagtagatcaagcgttacaagct
gcagaaagcattacagatccaactaatggttcaaatgcgaataaagacgcagtagaacaa
gcattaactaagcttcaagaaaaagtaaatgagttaaatggtaatgagagagtcgctgaa
gctaaaacacaagcgaaacaaactattgaccaattaacacatttaaatgcagaacaaatt
gcaactgctaaacaaaatattgatcaagcgacgaaacttcaaccaattgctgaattagta
gatcaagcaacgcaattgaatcaatctatggatcaattacagcaagcagttaatgaacat
gctaatgttgagcaaactgtagattacacacaagcagattcagataagcaaaatgcttat
aaacaagctattgctgctgctgaaaatgtattaaaacaaaatgcgaataagcaacaagtg
gatcaagcacttcaaaacattttaaatgcaaaacaagcattaaatggtgatgaacgtgta
gcacttgctaaaacaaatggtaaacatgacatcgaccaattgaatgcattaaacaatgct
caacaagatggatttaaaggtcgcatcgatcaatcaaacgatttaaatcaaatccaacaa
attgtagatgaggctaaggcacttaatcgtgcaatgaatcaattgtcacaagaaatcact
ggcaatgaaggacgcacgaaaggtagcacgaactatgtcaatgcagatacacaagttaaa
caagtgtatgatgaagcggttgataaagcgaaacaagcacttgataaatcgacaggtcaa
aacttaactgcagaacaagttatcaaattaaatgatgcagtcactgcagctaagaaagca
ttaaatggtgaagaaagacttaataatcgtaagtctgaggcattacaaagactgaatcaa
ttaacacatctaaacaatgctcaaagacaattagcaatccaacaaattaataatgctgaa
acgctaaataaagcatctcgagcaattaatagagcaactaagttagataatgcaatgggt
gcagtacaccaatatattgacgaacagcaccttggtgttatcagcagcacaaattacatc
aatgcagatgataatttgaaagcaaattatgataatgcaattgcgaatgcagcacatgag
ttagataaagtgcaaggtaatgcaattgcaaaagctgaagcagagcaattgaaacaaaat
attatcgatgctcaaaatgcattaaatggagaccaaaaccttgcaaatgccaaagataaa
gcaaatgcgcttgttaattcgttaaatggattaaatcaacagcaacaagatcttgcacat
aaagcaattaacaatgccgatactgtatcagatgtaacagatattgttaataatcaaatt
gacttaaatgatgcaatggaaacattgaaacatttagttgacaatgaaattccaaatgca
gagcaaactgtcaattaccaaaacgctgacgataatgctaaaacaaacttcgatgatgct
aaacgtctagcaaatacattgctaaatagtgataacacaaatgtgaatgatatcaatggc
gcaattcaagcagtcaatgatgcaatccaaaatcttaacggtgatcaacgactacaagat
gctaaagacaaggcgattcaatcgattaatcaagcattaacttataagctaaaagaaatc
gaagcttcaaatgcgacggagcaagacaagcttattgcgaaaaataaagcagaagaattg
gcaaacagcatcattaataacattaataaagcaacaagtaatcagggtgtatctcaagtt
caaacagctggcaaacaagctattgaacaagtccatgccaatgaaataccgaaagctaaa
attgatgcaaataaagatgctgataagcaagttcaagcattaattgacgaaattgatcga
aatccaaatctaacagataaggaaaaacaagcacttaaagaccgtattaatcaaatactt
caacaaggtcataacgacattaacaatgcgatgactaaagaagaaattgaacaagcaaaa
gaccgtttagcacaagcattacaagatatcaaagatttagtgaaagctaaagaagatgcg
aagcaagatgttgataaacgtgtacaagctttaattgatgaaatcgatcaaaatccaaat
ctaacagataaggaaaaacaagcacttaaagaccgtattaatcaaatacttcaacaaggt
cataacgacattaacaatgcgatgactaaagaagaaattgaacaggcaaaagagcgttta
gcacaagcattacaagacatcaaagatttagtgaaagctaaagaagatgcgaaaaataaa
ataaaagccttagctaatgcgaagcgtgatcaaatcaattcaaatccagatttaacacct
gagcaaaaagcaaaagcgctcaaagaaattgacgaagctgaaaaacgagcactacaaaac
gttgagaatgctcaaactatagatcaattaaatcgaggattaaacttaggtttagatgac
attagaaatacgcatgtatgggaggttgacgatcaacctgctgtaaatgaaatttctgaa
gcaacacctgaacaattgcttgttaatggtgaactaatcgtacatcgtgatgacatcatt
acagagcaagatgttttagcacacattaacttaatagatcagcttacagcagaagttatc
gatacaccatcaactgcaacgatttctgatagcttaacagcaaaagttgaagttacattg
cttgatggatcaaaagtgattgttaatgttcctgtaaaagttgtagaaaaagaattgtca
gtagtcaaacaacaggcaattgaatcaattgaaaatgcggcacaacaaaagattaatgaa
atcaataatagtgtgacattaacactggaacaaaaagaagcagcaattgcagaagttaat
aagcttaaacaacaagcaattgatcatattaacaatgcacctgatgttcattcagttgaa
gaaattcaacaacaagaacaagcgcatattgaacaatttaatccagaacaatttacgatt
gaacaagcaaaatcaaatgcaattaaatcgattgaagatgcaattcaacaaatgattgat
gaaatcaaagctcgtactgatctaacagataaagagaagcaagaagcaattgctaagtta
aatcaattaaaagaacaagcaattcaagcgattcaacgtgcgcaaagcatcgatgaaata
actgagcaattggaacaatttaaagctcaaatgaaagcagctaatccattagcaaaagaa
ctagctaaacgcaagcaagaagctattagtagaattaaagacttttcaaatgaaaaaatg
aatagtattcgaaatagtgaaattggctcagctgatgaaaaacaagcagcaatgaatcga
attaacgaaattgtgcttgaaacaattagagatattaataatgcgcatacattacagcaa
gttgaggctgcattgaacaatggtattgctcgaatttcagcagtacaaattgtaacatct
gatcgtgctaaacaatcattaagtaatggaaatgaatctaatagccatttaacaattggt
tatggaactgcaaatcatccatttaacagttcgactattggacataaaaagaaacttgat
gaagatgatgacattgatccacttcatatgcgtcactttagtaataatttcggtaatgtt
attaaaaacgctattggtgtggtgggtatctctggcttactagctagtttctggttcttc
attgccaaacgtcgtcgtaaagaagatgaagaagaagaattagaaataagagataataat
aaagattcaataaaagagactttagacgatacaaaacatttaccacttttatttgcgaaa
cgtcacagaaaagaagaggaagaagatgttactgttgaagaaaaagattcgctaaataat
ggcgagtcactcgataaagttaaacatacgccgttcttcttaccaaaacgccgtcgtaaa
gaagaggaagaagatgtggaagttacaaatgaaaacacagatgaaaaagtgttgaaagat
aacgaacattcaccactcttaatcgcaaaacgacgcaaagataaagaggaagatgttgaa
acaactagtattgaatctaaagatgaggacgttcctttattattggctaaaaagaaaaat
caaaaagataaccaatcgaaagacaaaaagtcagcatcaaaaaatacttctaaaaaggta
acagctaaaaagaagaaaaagaaatctaagaaaaataatttgtttctttga
DBGET
integrated database retrieval system