KEGG   Shewanella acanthi: K0H61_01825
Entry
K0H61_01825       CDS       T09152                                 
Name
(GenBank) transporter substrate-binding domain-containing protein
Organism
sach  Shewanella acanthi
SSDB
Motif
Pfam: SBP_bac_3 Response_reg HATPase_c HisKA Peripla_BP_4 PAS_9 Hpt PAS PAS_8 Peripla_BP_1 PAS_4 PucR 7TM_transglut
Other DBs
NCBI-ProteinID: QYJ80506
LinkDB
Position
418373..423394
AA seq 1673 aa
MHNKQVSGMSYWSTLSRCYLLIVSVILASLSVFTCVAMAIDDESKVSASKLSQLTPAQKL
SHRHRVTLILEADRPYWRQVEKFASSAAEDLNIQLEVVYGDDTPETLMALGRKAIQSGVS
GLIFVPIQGMGDELLTEANQQQIPVVTINSNFKLASLFLRQQNPNWIGRVAVNDDALGQQ
LLDNMLEGESLVKRLNLLLLVGTKDNLDVQKRTLEVENVVKNQFPDASFRVAYTDWGVES
TEQAYLKAMKLDPDINTVVTMNSEMALTVSALAQAAKPLPAPQIGSLTWNLPLAEAIQNG
QVSAGVGGVEFQGAFALVLMFDHLNGIDIHSKGFEFLIAPLIINQHNYNDYFELLEFDTL
KPEFTKASLALNPRLRHIDYRPLSLIPDMDLHRFLTILTTQERAFIKQHPNIRVGVDPSS
APIDFIDENGVHRGMMADYLAEISRITPLTFQTYNEGSWAKAVEDFTRQEVDMLSLASPG
ADREQSMLFTAPIEQYPPVIVTLIEGEHPKSLEQLKGKRISVVADDVSHKQLVKDHPEIE
LVLFDRLDKALGAVDSGEVDAAFVHFPTAAYLLQTAKFNRLRIAAVSDYRFGVSMGIRKD
WPELQRILNKALAQISDEKAREIQNRWVNVQYDLGLQKQEVYNWLVRIIVGVLLVVLFFG
LRNWRLNRDLARRIDKEEQLSLSMHKFQALFESAVDPCLIINKTGTILECNTALLAMLKF
ENKQALIGKSVQIYYPEESVDGDKSSRFAERLQNVLDHGQYKFESQLLTTTGEIVDVEAQ
FKRIEINGEQYILGSYHDLADRKLMSALLERERDLLKNVLGKSPIGVWICIGGICRYVNE
KLTEMTGLEVGQSVYPLFIDPDVYDNRIRELALDKESTIFETQLFDRDGEPRDVLITAYY
TVQDGQNANLCWALDITEAKGIQLELADAKDAAEAANQAKSDFLANMSHEIRTPMNAILG
MSYLVLQTELSSKQRDYVGKVHQAAGNLLGILNDILDFSKIEADKMKIEWTEFDLDDVLS
NLANVISYKVEEKQMNFLFDLPPELPRYFYGDSLRLGQILINYCNNAIKFSEPMSKVILS
CQVEQREAQVDITFCVEDFGIGIPEHKLAVLFGSFEQVDASTSREYGGTGLGLAICRRLA
SLMGGEVWCESEEGKGSHFYLKLTLEMVDYHAPRSPFKALAGVSVNLVGLDPRLDKLLTD
HGNSAKMSVSSINEEQVIDSLNQHQESSSQDKELGAAPVLICDYSAFNEGVRTALVNAPK
AKMLLLGTLAEQEESRQLIESHTQLMFQTKPITPIAVGNALLMLLDLDKEGDVQLTQEHS
LHGLKTQLAGAEVLLVEDNELNQELAVELLRQAGMVVTVANNGLEAVELVQKRAFDCVLM
DCQMPVMDGYEATKRIRAIDAFSKLPILAMTAHAMTGDIEKALDVGMNDQITKPVHVKDL
YAVMARWITPKQRKPVPVSAKKSVGGITLPQIDGLNTQKGLALCDRNEALYSQLLGLFIN
TGDTLLSQLQQASKANDISALMLCLHTLKGVGANLGAVDLSRQAAELESRCRTEEPPLTK
DFVAQLLALQVDLQCMVSGLGTWSRQQTLRKVEFELSDEALGSLLTQLQQSLRDYNTNAL
DLVDKLIQAPQLQSQRGLLKQLKMDVELFDFEPAMEGLNALMTELNLSTEDRS
NT seq 5022 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgcacaataaacaagttagtggtatgtcgtattggtcaacactatcaagatgctatttg
ctgattgtcagtgtcatattggcgagtctaagtgtttttacctgcgttgcaatggccatt
gatgatgaatctaaagtcagtgcaagtaagctgtcacagctgactccagcacaaaagcta
tctcatcggcatcgggtgaccctgatcttggaggcggatagaccctactggcgacaagta
gagaaatttgcctccagtgccgcagaagatctcaatattcagctagaggttgtgtatggc
gatgatacccccgagactctgatggcgcttggacgaaaggcgattcaatctggtgtgtca
gggcttatttttgtgcctattcagggcatgggggacgagctactcactgaggcgaatcaa
cagcaaattcccgtcgttactatcaattccaatttcaaactcgcatctttattccttcga
caacagaatcccaactggataggtcgggtcgccgttaacgacgatgccctcggtcagcaa
ttactcgacaatatgctggagggtgagagcttagtgaagcggctgaatttgctactatta
gtcggtactaaagacaatttggacgtgcagaaacgtaccttagaggttgagaacgtcgtt
aaaaaccagtttcctgatgctagttttagggtggcttatacagattggggcgttgagagc
accgagcaagcctatttgaaggcgatgaaattagaccccgatattaatactgtggttacc
atgaattccgaaatggccctcactgtctcagcgcttgcgcaggcggctaaacctcttccc
gcccctcaaattggctcattaacgtggaatttacccctagctgaggcaattcaaaatggt
caggttagtgccggtgtgggcggagttgaatttcaaggggccttcgcgctggtgttaatg
tttgatcatttaaatggtattgatattcacagtaagggctttgagtttttaatcgccccg
ttgatcattaatcaacataattacaatgattacttcgagttacttgagtttgatacgtta
aagccagaatttactaaggcatcgcttgcccttaatcctcgccttcgtcatatcgattat
cgccctttgagcttgatccctgatatggatttacatcgttttttaaccatattaacgaca
caggaaagagcttttattaaacaacatcctaatattcgagtgggtgttgatccctcctct
gcaccaattgattttattgatgaaaacggtgtgcatcgaggcatgatggcggattatctc
gccgaaattagccgtattaccccgttgacgtttcaaacctataacgaggggagttgggca
aaagcggtagaggatttcactcgtcaggaggtcgatatgctctccttggcttcgcccggt
gcggatcgtgagcaatcgatgttattcaccgccccaatagagcaatacccgccagtgatt
gtgacgctaattgaaggtgagcatcccaagagcttggaacaattaaagggaaaaaggatc
agtgtcgttgcggatgatgtatcacataaacaactcgtaaaagaccacccagaaatcgaa
ctcgtgctgtttgatcgtttagataaagcccttggtgcagttgactcgggcgaggtcgat
gccgcctttgtacattttccaacggcagcttacttacttcaaaccgcgaaatttaatcga
ttgcgtattgctgccgttagtgattaccgctttggagtgtctatgggcattcgcaaggac
tggcccgagttacaacggatcttgaataaggctctggcccaaatctcagatgaaaaagcc
cgtgaaattcaaaatcgatgggtgaatgtgcaatacgatcttgggcttcaaaagcaagag
gtttacaactggttagtacgtatcattgtgggtgtgctgttagtggtgttgtttttcggt
cttcgtaattggcgcttgaatcgtgatttagccagacgaatcgataaggaagagcagctc
agcttgagcatgcataagtttcaggccttgttcgaatccgccgtcgacccctgtttgatc
atcaataaaacaggcaccattctcgaatgtaatacggcactgttagcaatgctgaaattt
gagaataagcaggcattaataggcaaaagtgttcagatctattatccagaggagagcgtc
gatggagataagtcgtcgcgttttgctgagcgattgcagaatgtgttagaccatggccaa
tataaatttgagtcgcaactgctgaccaccactggcgaaatcgttgacgttgaggcgcaa
ttcaaacggatagaaatcaacggagagcaatatattctggggtcttaccacgatctggca
gatcgtaagttgatgagtgctctgcttgaacgagagcgtgatcttttgaaaaacgtcctc
gggaaaagtccaataggagtgtggatttgtatcggtgggatctgtcgctatgtaaatgag
aaactcacagagatgacggggctcgaagtgggacagtcggtttatccgctttttatcgat
cctgatgtttatgacaatcgtattagggaacttgccttagataaagaaagtaccattttt
gagactcaactgtttgaccgtgatggtgaaccaagggatgtattgattacggcctattac
acagtgcaggacgggcaaaatgctaacctgtgttgggcgctggatatcacagaagctaag
ggtattcagctggagttagccgatgcaaaagatgctgccgaggcagctaaccaagctaag
tcagattttctcgctaatatgtcacacgaaattcgcacgccaatgaatgccatcttaggt
atgtcctatttagtattgcagacagaattgtcgagtaagcagcgggattatgttggtaag
gtgcatcaagcggcgggtaatttactgggtatactcaacgatattctcgacttctctaaa
atcgaagccgacaagatgaagattgaatggactgagtttgatttggacgatgtgctctct
aatttggccaatgtaatcagctataaggtcgaagagaaacagatgaattttctctttgat
cttccccctgaacttccacgctatttctatggcgatagcctgcgtttagggcagatcctc
attaattactgtaacaatgcgattaagttttccgagcctatgagtaaggtcattcttagt
tgccaagttgaacaaagggaagcccaagtcgacatcacgttttgtgttgaagactttggt
atagggatccctgagcataaattggcagtgttatttggctcttttgaacaagtcgatgcg
tctacctcccgtgaatatggcggaacaggtttaggtttggcgatttgtcgtcgtctggcg
agtttgatggggggggaagtgtggtgtgagagtgaggagggaaagggcagccatttttat
ctcaaactgaccttggaaatggtggattaccatgcaccccgttcaccatttaaggcatta
gccggagtcagcgttaatttggtcggtctagatcctaggctggataaattacttaccgat
catggcaattcggcaaagatgtccgttagcagtattaatgaggaacaggtgattgattca
ctcaaccaacaccaagaatcgtcgtcgcaggacaaggaattaggcgctgcacctgtactt
atctgtgactatagtgcgttcaatgagggagtgcgcactgctttagttaatgcgcctaag
gcgaaaatgttgttattaggcacattagcggagcaggaagagtcgaggcaattaattgaa
agtcatacacagcttatgtttcagactaaacccatcacgccaatcgctgtgggtaatgct
ttattgatgctacttgatctcgacaaggagggtgatgtgcaactcactcaggagcattct
ctgcatggtttaaagactcagctggcgggggctgaagtactcttagttgaggataacgaa
cttaatcaagagcttgctgtggagctattacgccaagcagggatggttgtaacggtcgcg
aataatggacttgaggcggtcgaattagtacaaaaacgagccttcgactgcgtgttgatg
gattgccaaatgccggtaatggatggttatgaggcgacaaagcgcattcgtgctatcgat
gcattctccaaattacccatacttgccatgactgcccatgccatgacgggagatattgaa
aaggcattggatgtcggcatgaacgatcagatcactaaacctgtacatgtaaaggatctc
tacgctgtgatggcccgttggattacccctaaacagcgtaaacccgttcccgtgagcgct
aaaaaatctgtaggtggaataacgcttcctcaaatcgatggtcttaatacccagaaggga
ctggcgctttgcgatcgcaatgaggcgctctacagccaacttttaggcttatttatcaat
accggtgacacgttactgtctcaactacaacaagcttctaaagcaaatgatatcagtgcg
ttaatgctgtgtttgcatacgctaaaaggcgtgggcgccaatcttggcgctgtggatttg
agtcgacaagccgcagaattagaaagccgttgtcgaaccgaagaaccaccgttaacaaag
gattttgtagcgcaattactcgcgctgcaggttgatttgcagtgcatggtgagtggcctt
ggtacttggtcacgccagcaaacgcttcgtaaagttgagtttgaactgtccgatgaagct
ttaggctccttgctaactcaactccaacagagtttaagggattacaacacaaacgctttg
gatctagtggataaacttattcaggctccacaattgcaatcccaaaggggcttgctaaaa
caattgaaaatggatgtggaactctttgattttgaacctgccatggaggggcttaacgcg
ttaatgactgaacttaatctgtccactgaggataggagctaa

DBGET integrated database retrieval system