Shewanella acanthi: K0H61_02995
Help
Entry
K0H61_02995 CDS
T09152
Name
(GenBank) phage tail tape measure protein
Organism
sach
Shewanella acanthi
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PhageMin_Tail
YqzH
DUF7041
PTSIIB_sorb
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QYJ79430
LinkDB
All DBs
Position
672779..677059
Genome browser
AA seq
1426 aa
AA seq
DB search
MSFKDQEVNLIIQGKDLFSAEAKKSEQALQELGRESEKLNEQLDDLKQQQEAIRAIGELT
DSISRNSQAFSDNSVALDQLKREQKQAATEVKTLESAQREAAASTANVEAEYQQTAAQLA
QYDSQVAATRAEVERLSATQGKGAQASQAQAAALSKAKNDLQQLETTQRSTAASAEKLSN
ELEQERRGLNQLNAAVDEASRKKAEYALKVKTASSDLTQLGTSISRNKQELGKQQAVLQK
AGVDMERLGDASKELKVKQAAAEQALKGVNEKLTVHNALLQNNKTVAAASTAQTALTTTA
VQTLAKAYAALLSAQQAVAAVKTGVENYGELEAAITKVEKTTGNARETVIKMAAELKELG
EKVTPTSTNELLRMAEVAGQLGTKSTEDILSLVAASDALGLSTNLAGDEAATMLARILGM
TQEGIPQIHSLSSAVVALGNDFAVTEADIVQMTKEIVSGTREINLGSAAAAAFGTTLAEL
GQPAERSRSAMQRLGAEINNASKKGGESLETLMRITGQTAKQIEQDLGEAPEKVLVKFLE
GLQKVKGEGKLVSDSLKAMHIEGSEATGVLTVLADGTDRLKTALALSNQAYADGNYHMKE
AAKAYADQESAIGRLENKFHNLTTSIGEVFSNSVNSSIRGTGEAIDDVRDYAVKLAEYLP
ELIGGFKDVLEAAGNFTSLFTDGAFDVVLHKMDEMALSANYLSSVFNTLTLGIQGTAYAA
LSLSENIESLAGIDTSNLQKKIADIGVQMSKTKESIRKDVDDINEINKRLAGESSIAYKT
FNDTMDKYGFAISKLSEDQQKQIRSILEANKYNAEQEDLYRKLTLAINRANSEIEIEAAL
KENAAKASKEKSEADAKGLDVTTKQTLTLAENATALKAQALSLDEAKKKAAELHDNYDKG
LISTETYNNMLTLLNESVKANSAEIGNNNKAQKSQTELTTEFLAKRKELQAQYEQGLITE
QELTYAQQDLARAYDASVASANASAGTTEVLSDAQLGLQEKILTTEKAIRELQKALEDEN
QTSADLAITKAKLAKEEANLADLKLQAAELAKIENANYSELLIMQAQYQVQLDALDRSFR
AGLITKQEYESQSQLLKGSLDEINKVLGTNTDKTTENTKATEENTKATEENTAAGIENAK
ALAEQISSIDDFRGSAIATRSVMVALNTEYDYSNATIEEMTDRLAQLDNQIEGADQKRER
RELNNAIRMRNWVNQVETGSLSLQELGRIADLANNSVVRLSDNQLVPLNKAIEEARAKFQ
SLADEINQTTLDIQDRLDAALGNETAITERKFASELKEVESLIETAKSYGDSQLIKKLQK
SLSDLKQAQALERKATQAQQAADEAAKAKSEASTKAASAAASSTTQTSQPTTTTTPAPTA
SASASSSADTVVLKLQVGGNSFDASMKRSLVTELVAEIKRLQSVGG
NT seq
4281 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagctttaaagatcaagaagtgaatttaatcattcagggtaaagatttattttcggct
gaggcgaaaaagtctgagcaagccttacaggagttggggcgcgagagtgaaaagcttaat
gagcaactggatgatttaaaacaacagcaagaggctatccgtgctattggcgaactaacg
gattctattagccgtaactcgcaggcatttagcgataacagtgttgcccttgatcaatta
aagcgtgaacaaaaacaagccgcgacagaagtcaaaacgcttgagtctgcccaacgtgaa
gcggcggcatctaccgctaatgtcgaagcggagtatcaacaaacggccgcacagctagcg
caatatgatagccaagtggcggctacccgtgccgaagttgagcgcttaagcgcgacccaa
ggaaaaggtgcgcaggcaagtcaagcacaggccgccgccttatctaaagcgaagaatgat
ttacaacagcttgaaaccactcaacggagtaccgccgccagcgctgagaagcttagcaac
gaactcgaacaggagcgccgcggccttaatcaacttaatgccgccgtcgatgaggcgagc
cgtaaaaaggcggagtatgcgcttaaggttaaaactgccagcagtgatctgacacaactt
ggtacgtccatcagccgcaataagcaagaactcggtaagcagcaagccgtgttgcaaaag
gctggcgtggatatggagcgccttggcgatgccagcaaagagcttaaggtaaaacaagcg
gcagccgagcaagcgctaaaaggcgttaatgaaaaactcactgtccataatgcgttgttg
caaaacaataaaacggtggcggcagcgtcaacggcgcaaactgcactgaccaccaccgcc
gtacaaaccttagctaaggcttatgcggcgctgctgtcggcgcagcaagcggtggcagcg
gtaaaaacaggggttgagaattacggtgagctagaagctgcgattactaaggttgaaaaa
accacaggtaacgcccgtgaaaccgtgatcaaaatggccgccgagcttaaggagcttggt
gaaaaggtgaccccaaccagcaccaatgaattgctgcgaatggccgaagtcgcaggccag
ttagggactaaatcgaccgaggatattttaagtttggtcgcggcgtcggatgccctaggg
ttatcgaccaacttagccggtgatgaagcggccactatgttggcgcgtatcctcggtatg
acccaagaggggatcccgcagatccatagtttgtcctctgcggttgttgcgttgggtaat
gattttgcggttaccgaagctgatattgtgcaaatgacgaaggagatcgtctctggcacc
cgcgagattaacttaggcagcgccgcagctgccgcctttggtacgacattagccgagcta
ggccaaccagctgagcgttcgcgcagcgctatgcaacgccttggcgctgagattaataac
gccagcaaaaaaggcggcgagtcgcttgaaaccttaatgcggatcacaggccaaaccgcc
aaacagattgagcaagatcttggggaagcccctgaaaaggtgttggttaaattccttgaa
gggctgcaaaaggtaaagggcgaaggaaaattagtctctgattcgcttaaggccatgcac
attgaaggatcggaggctacaggggtattaacggttttagccgatggtacagatcgcttg
aaaacagcgttagcgctgagtaaccaagcgtatgccgatggcaattaccatatgaaggag
gccgccaaagcctatgcagatcaagagtcggctattgggcggttagaaaacaagtttcat
aacttaaccacaagtattggtgaggtgttttcaaactcggtgaatagctccatccgtggt
acgggtgaggcgattgatgatgtgcgtgattacgctgttaagcttgctgaatatctacct
gaattaatcggtggatttaaggatgtattagaagcggctggtaattttaccagtttattc
acggacggcgcgtttgatgttgtgctgcataaaatggatgaaatggcgcttagcgcgaac
tatttatcctctgtgtttaatacattgactttgggtatacaagggactgcttacgctgcg
ttatcgctgtcagaaaatattgaatcgttagcaggcattgacacctcaaatttacagaaa
aaaatcgccgatattggcgtgcaaatgtcaaaaaccaaagagtcgattcgtaaagatgtt
gatgatattaatgaaataaataaacgcttagcgggcgagtcctccattgcctataagacg
tttaatgacacgatggataagtatgggtttgcgattagcaagctcagcgaagatcagcaa
aagcaaatccgcagcatcctcgaagccaataaatataatgccgaacaggaagatctctat
cgtaagttaaccctagcaataaacagggcaaacagtgagatagaaattgaagcggcatta
aaagaaaatgccgccaaagccagtaaggaaaaatcagaagcagatgctaagggcttggat
gtcacgaccaagcagacgctcaccttggctgaaaatgccaccgcattaaaagcgcaggcg
ttgtcactcgatgaggccaagaaaaaagcggctgagttgcatgataactatgataaaggg
ctgattagcaccgaaacctataacaacatgctcacgctgttgaatgagtcggttaaggct
aacagtgcagaaattggcaacaataataaagctcaaaaatcgcaaactgagttaaccacc
gagtttcttgctaagcgtaaagagctgcaagcgcaatatgagcaaggcttgataaccgag
caagagcttacttatgcgcagcaggatttagcacgggcttatgatgcatcagtggcgagc
gccaatgcttcagccggtacgactgaagtcctgtctgatgctcaattaggattgcaggaa
aaaatcctcaccactgaaaaggcaattagggagctacaaaaagcgctggaggatgaaaat
cagaccagtgcagacctggcgattactaaagcgaagcttgccaaggaagaggccaatctt
gctgatctaaaattgcaagccgctgaattggcgaaaattgaaaatgctaattacagcgag
ttgttgattatgcaggctcaatatcaagtgcagcttgatgcgcttgatcgcagttttaga
gcggggttaatcactaagcaggagtatgaaagccagtcgcagttgctcaaaggcagcttg
gatgaaatcaacaaagtcttagggacaaataccgataagacgactgagaacaccaaagca
actgaagaaaataccaaggcaactgaagaaaacactgctgcgggtattgaaaatgcgaaa
gcattagccgagcaaatcagttcgattgatgattttcgtggtagtgctatcgcgactcgt
tctgtgatggttgccctgaatactgagtacgattactcaaatgcaactatcgaggaaatg
accgataggttagctcagctcgataatcaaattgagggtgcagaccagaagcgtgaacgc
cgtgagctcaataatgccattcgtatgcgtaattgggttaaccaagttgagacggggtca
ctcagcttgcaagagcttggccgtattgctgatttagcgaataactcagttgtgcgcctc
tctgataaccagttagtcccactgaataaagcaattgaggaagcgcgggctaagtttcag
tcgttggctgatgagatcaatcaaacaacgctggatattcaagaccgcctcgatgctgct
ttgggtaatgagactgctattacggagcgtaaatttgctagtgagctgaaagaagtcgaa
agcttaattgaaacagctaagtcttacggtgacagccagctaatcaaaaaactgcaaaag
agtttaagcgacctaaaacaagctcaagcgctggagcgtaaagcaacacaagcccagcag
gccgccgacgaagccgctaaggctaagagtgaggcctccaccaaagccgcctcggcagca
gcaagttcgaccacgcaaaccagccaaccgactaccacgaccaccccagcaccgactgcc
agcgcttcggcgtcgagcagtgctgacactgtggtgttaaagctacaggtgggcggcaac
agctttgatgcgtcgatgaagcgcagcttagtgactgagctggttgccgaaatcaagcgg
ctgcaatccgtgggcggctaa
DBGET
integrated database retrieval system