Shewanella aestuarii: HBH39_06170
Help
Entry
HBH39_06170 CDS
T06921
Name
(GenBank) DEAD/DEAH box helicase family protein
Organism
saes
Shewanella aestuarii
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SNF2-rel_dom
Helicase_C
ResIII
SWIM
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QIR14122
UniProt:
A0A6G9QI25
LinkDB
All DBs
Position
PN3F2:1343345..1346569
Genome browser
AA seq
1074 aa
AA seq
DB search
MSAKLFNLPIKLSHELIGKLFSATQIQKAQNYLIQGRVLQVTASHDNHDIEAYTQGAIEE
PYRQDISLVNVNHKVIMRSYCTCPVRRDCKHVAAALLALIDNKPVEEQRVAQWLSQLDKL
DTIQPVINDEYAEPNRIIYCLSSDPHGVYVELKNSKLNKKGTYNRGSKLIINDLRLHLPW
WISPEDKQLIGLLFANNLQGNKIYLEGEIGYIALMKMLDAEVAFWEENRFPLKLSQAIKP
EFIWAEMDKNHRQMQMVMPGLDNWEFIATEPALYIELDYLQLGKIDTELSAERLQLLQKM
PPVNKSQLDKISHALLLHFPSKVVPIPTEIEFQEISQQLNTRLTFCLVDRADSPAFLQPA
IKVEHCYGEIKFAASEQFEHISLLKKGNVQYQIHRQAEQEQHNMAQLRELGLQALSVDIL
PPSLDKQYFVSIGLLPEAIIDWSALSSQRIDELTELGFDVHFASDFDLNIVDAQLDVDLV
DEDESGWFSLSLNADIDGQRISLLALVARWLQQHGEPDDEQELLLPSDNGRFIKIKAKSI
KPLISIIQELFHRHSSDELQIPRSRAHLLNDLSESEVRLLNGERVRLLASKLASFNGVQP
IDLPNDLNATLRDYQKQGFDWLCFLKEYQLGGILADDMGLGKTVQALAFLLHVKQQTLPA
KRKPSLIICPTSLVGNWQKEAEKFTPDLNLIVIHGNQRHQWLAELDQYDVIVTTYPLIIR
DEDIYHEHVFEHIILDEAQQIKNAQAKATQVIKTLKGHFRLCLSGTPLENHLGELKSLMD
FCLPGLLGQQTYFNKEFRTPIEKQADIEKSRLLTQRISPFMLRRTKTQVVAELPEKTEIV
QSLELEKDQRNLYESIRLVMEKKLRELFAKKGVSSSHIEFLDALLKLRQACCDPRLVKLE
QAQKVTDNAKLNWLVQNLPEMIEEGRKILIFSQFTSMLSLIEQELTALDIPYSLLTGKTL
QRQQQIDAFQDGDNPVFLISLKAGGTGLNLTAADTVIHYDPWWNPAAERQATDRAYRIGQ
ENPVFVYKLIAQGTVEEKIQAMQQHKQGLADNILSDGTQGPWKGSAEDLLALLR
NT seq
3225 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcggctaaactctttaatctcccaatcaaattatcccatgaattaatcggaaagctt
ttttcggcaacccaaattcagaaggctcaaaattacctgatccaaggccgtgttcttcag
gtcacggctagccatgataatcacgatattgaagcttatactcaaggcgcgatagaagaa
ccataccgtcaagatatcagcttagtgaatgttaatcataaagtgattatgcgttcctat
tgtacatgtccggttcgccgagattgtaagcatgtggccgccgcattgttggctctaatt
gacaataagccagttgaagagcaacgagtggcgcaatggctgtcgcaactagacaaatta
gatactatccagcctgttattaatgatgaatatgctgaaccaaaccggataatttattgt
ttatctagcgatccgcatggggtttatgttgagcttaaaaacagcaagttaaataaaaaa
ggcacttataatcgtggcagcaaattaatcattaatgatttacgtctgcatttaccttgg
tggataagccccgaagataaacagcttatcggcttgctttttgctaacaatttacaaggc
aataaaatctatcttgaaggtgaaattggttatattgccttaatgaaaatgcttgatgct
gaagtggctttttgggaagaaaatcgttttcctctcaaattatcacaagccataaaaccc
gagtttatatgggctgaaatggacaaaaatcatcgtcaaatgcaaatggtgatgcccggt
ttggacaactgggaatttattgccaccgagccagcactttatatcgagctagattattta
caacttggtaaaattgacactgagttatcggctgagcgcttacagttattgcaaaaaatg
ccaccggtaaataaaagtcaattagataaaattagccatgcattacttctacattttcca
tcaaaagtggtgcctatccctaccgagattgaatttcaagaaattagccagcaattaaac
actcggctaactttttgtttagttgaccgagccgatagcccagcctttttgcagccagca
attaaagttgaacactgttacggtgagattaaatttgccgcaagcgaacagtttgaacac
atcagcttactgaaaaagggcaatgtgcaatatcagattcaccgccaagcagagcaagag
caacacaatatggctcagttgcgtgaactgggtttacaggcactatctgtagatatatta
ccgccaagcctagataagcagtactttgtttcaatagggttgctacctgaggccattatt
gattggtcagcattatcatcacagcgtattgatgagttaaccgaattaggttttgatgta
cactttgccagcgattttgaccttaacattgttgatgctcagctagatgttgatttagtg
gatgaggatgaatcaggttggttttctttgtcattaaacgctgatatcgatggtcagcgg
atttcgttgttggcattggttgcgcgttggttgcaacagcatggtgaaccagacgatgaa
caagagttgcttttgccaagtgataatggtcgatttattaaaattaaagctaaatccatc
aagccattaatttcaattattcaagagttgtttcatcgtcatagtagtgatgaactgcaa
attccacgcagccgtgctcatttactgaatgatttgtcagaaagcgaagtaagattgctc
aatggcgagcgcgtgcggctattagctagtaagttagccagctttaatggggtgcaaccg
atagacttgcctaatgatctgaatgcaacattgcgtgactaccaaaagcagggctttgat
tggttgtgctttttaaaagaatatcaattaggcggcattttggctgatgatatgggactg
ggtaaaaccgttcaggcattagcttttttactgcatgtaaaacaacaaacgttacccgca
aagcgaaaaccgagtttaattatttgcccaaccagcttagtgggcaattggcaaaaagag
gccgagaaatttaccccagatttaaacctcatcgttattcacggtaatcagcgtcatcaa
tggcttgctgagctggatcaatatgatgtgattgtcaccacgtatccgctgatcattcga
gatgaagatatctatcatgagcatgtgtttgagcatattattttggatgaagctcagcag
attaaaaatgctcaagctaaagcgactcaggtgatcaaaacccttaaaggccactttaga
ttgtgtttatcgggtacgccattagaaaatcatttgggtgagttaaagtcgttaatggac
ttttgtttacccggcttattagggcagcagacctattttaataaagagtttcgcacccca
attgaaaagcaggctgatattgaaaaatctcgcttgttaactcagcgtatttcgccattt
atgcttcgccgtactaaaactcaagtggttgctgagttgccagaaaaaactgaaattgtt
cagtcgttagagcttgaaaaagaccaacgaaatttatatgaatcaattcgtttagtgatg
gagaaaaagctacgcgagttgtttgctaaaaaaggcgtgtctagcagtcatatagagttt
ttagatgctttattaaagcttcgtcaggcctgctgtgatcctcgtttagttaaattagag
caagcgcaaaaagtgaccgacaacgccaagttaaattggttagtgcaaaacttgcctgaa
atgattgaagaaggacgtaaaattttgatctttagtcagtttacttcgatgctgagcttg
attgagcaagagttaactgctttagatattccttatagtttactgacgggaaaaaccctg
cagcgtcagcagcaaattgatgctttccaagatggcgacaatccagtgtttttaattagt
ttgaaagccggtggtacagggcttaatttaacggctgcagacacggttattcactatgat
ccatggtggaaccccgccgctgagcgccaagccactgatcgtgcttatcgaataggtcaa
gaaaacccagtttttgtctataagttaattgcgcaagggacggttgaagagaagattcaa
gccatgcagcagcataagcaaggccttgccgataatatcttatccgatggcacgcagggg
ccgtggaagggcagtgcagaagacttattagcgcttcttagatag
DBGET
integrated database retrieval system
