Streptococcus agalactiae COH1: GBSCOH1_0161
Help
Entry
GBSCOH1_0161 CDS
T03434
Name
(GenBank) penicillin-binding protein 1B, putative
KO
K03693
penicillin-binding protein 1B
Organism
sagt
Streptococcus agalactiae COH1
Pathway
sagt00550
Peptidoglycan biosynthesis
sagt01100
Metabolic pathways
sagt01501
beta-Lactam resistance
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
sagt00001
]
09100 Metabolism
09107 Glycan biosynthesis and metabolism
00550 Peptidoglycan biosynthesis
GBSCOH1_0161
09160 Human Diseases
09175 Drug resistance: antimicrobial
01501 beta-Lactam resistance
GBSCOH1_0161
09180 Brite Hierarchies
09181 Protein families: metabolism
01003 Glycosyltransferases [BR:
sagt01003
]
GBSCOH1_0161
01011 Peptidoglycan biosynthesis and degradation proteins [BR:
sagt01011
]
GBSCOH1_0161
Glycosyltransferases [BR:
sagt01003
]
Polysaccharide
Bacterial polysaccharide (excluding LPS)
GBSCOH1_0161
Peptidoglycan biosynthesis and degradation proteins [BR:
sagt01011
]
Peptidoglycan biosynthesis and degradation
Glycosyltransferase/DD-Transpeptidase (Class A PBP)
GBSCOH1_0161
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Transgly
Transpeptidase
ARM_UBP24_USP9X-Y
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CDN65627
LinkDB
All DBs
Position
179049..181346
Genome browser
AA seq
765 aa
AA seq
DB search
MFKGNKKLNSSKLGDYTPLEFGSIFLRIVKLLSDFIYVIILLFVMLGVGLAVGYLASQVD
SVKVPSKNSLVTQVNTLTRVSRLTYSDKSQISEIATDLQRTPVAKDAISDNIKKAIIATE
DENFNDHKGVVPKAVLRAAAGSVLGFGESSGGSTLTQQLLKQQILGDDPSFKRKSKEIIY
ALALERYMDKDSILSDYLNVSPFGRNNKGQNIAGIEEAAQGIFGVSAKDLTIPQAAFLAG
LPQSPIVYSPYTADAQLKSDKDLSFGIKRQKNVLYNMYRTRALTKDEYKSYKDYDIKKDF
IKPAVATTNHHDYLYYSALSEAQKVMYNYLIKKDNVSEHDLKNDETRATYRHRAIEEIQQ
GGYTIKTTINKSVYQAMQDAAAQYGGLLDDGTGKVQMGNVLTDNSSGAIIGFIGGRNYSE
NQNNHAFDTARSPGSSIKPILPYGIAIDQGMLGSGSVLSNYPTTYSSGEKIMHADEEGTA
MVNLQESLDISWNIPAFWTYKMLRDRGVDVKNYMEKLDYPIENFGIESLPLGGGIDTSVA
QQTNLYQMIANGGVYHKQYMIESIEDSNGKVIYNHESKPVRVFSKATATILQQLLHGPIN
SGKTTTFKNRLQGLNSGLAGVDWIGKTGTTNSTSDVWLMLSTPKVTLGGWAGHDNNASLA
KLTGYNNNANYMAHLVNAINNADGNTFGKSERFRLDDSVIKAKVLKSTGLQPGVVTVNGR
RITVGGESTTSYWAKNGPGTMTYRFAIGGTDSDYQKAWSTLGGKR
NT seq
2298 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtttaaaggtaataagaagttgaatagttctaaattaggtgattacacaccacttgaa
tttggttctatttttttaagaattgtaaagcttttatcagatttcatctatgttattatt
ttactatttgttatgctcggagtaggacttgcagtagggtatcttgctagtcaagttgac
tctgttaaagtaccaagtaaaaatagtttagtgacacaagttaatacacttactagggtg
tctaggttaacttattctgataaatcacaaatttcagagattgccactgatttacaacgt
acaccagtggcaaaggatgctatatctgataatattaaaaaggctatcattgcaacagag
gacgaaaatttcaatgaccataaaggtgtagttcccaaagccgtactacgtgctgcagcg
ggatctgttctggggtttggagagagtagcggtggttcaacgctgacacaacaattatta
aagcagcaaattttgggagatgatccgtcatttaaacgcaaatcaaaagaaattatttat
gctctagcattagagcgttacatggataaggattcgattttatcagattatttaaatgta
tcaccgtttggtcgcaataacaaaggacagaatattgcaggtattgaagaagcagcacaa
gggatttttggagtttccgcaaaagatttaacaattcctcaggcagctttccttgcaggt
ttaccgcaaagtcctattgtatattctccttatactgcagatgcccagttgaaatcagat
aaagatcttagttttggtataaagcgccaaaaaaatgtgttatacaatatgtatagaacg
agagctttaaccaaagatgagtacaaatcctacaaagattatgacatcaaaaaagatttt
atcaaacctgcagtggcgacaacaaatcatcatgattatctttactactcggcattatct
gaagctcaaaaagtgatgtacaattacctcattaaaaaggataatgtttcagagcatgat
ttaaaaaatgatgagactagagcgacgtacagacaccgcgctattgaagagattcaacag
ggagggtatactattaaaactactatcaataaatctgtttatcaagccatgcaggatgct
gcagctcaatacggagggttgttagatgatggtactggcaaggttcaaatgggaaatgta
ctaacggacaattctagtggtgctattataggatttattggtggtcgtaactatagtgag
aatcaaaataaccatgcttttgatacggcacgctctccagggtcaagtattaaaccgata
ttaccttacggaattgctattgatcaagggatgttaggaagtggtagtgttctttcaaat
tatccaacgacatattcaagtggcgaaaagattatgcatgcggatgaagaaggtactgct
atggttaaccttcaagagtcattggacatttcttggaacattccagctttctggacttac
aagatgctacgagatcgaggcgttgatgtaaaaaactatatggagaaattagactatcca
attgaaaactttggtatagaaagtttaccacttggtggtggtattgatacgtcagttgct
cagcaaacaaacctttatcaaatgattgcaaatggtggtgtttatcataagcagtatatg
atagaaagtatagaggatagtaatgggaaagtgatttataatcacgaaagtaaacctgtc
cgtgtcttttcgaaagcaacagctactatcttacagcagctattacatggaccaattaac
tccggaaagactacaacctttaaaaatcgcttacaaggtttaaatagtggtttagctggg
gtagattggattggaaaaacgggtactactaactcaacttctgatgtttggttgatgctt
tctacacctaaagtgactttaggtggatgggcaggacatgataataatgcctctttagcg
aaattgacaggttacaataataatgctaattatatggctcacttggttaatgctattaat
aatgcagatggcaatacttttggtaagtcagaaaggtttagacttgatgatagcgttata
aaagctaaagttcttaagtctacaggtttacagccaggtgtagtaacagtaaacggtcgt
cgaatcactgttggaggtgaaagcacaacaagttattgggcaaaaaatggacctggaacg
atgacctatcgttttgctattgggggaaccgatagtgattatcaaaaagcttggtctact
ttgggtggaaaacgataa
DBGET
integrated database retrieval system