Streptococcus agalactiae COH1: GBSCOH1_1556
Help
Entry
GBSCOH1_1556 CDS
T03434
Name
(GenBank) excinuclease ABC, A subunit
KO
K03701
excinuclease ABC subunit A
Organism
sagt
Streptococcus agalactiae COH1
Pathway
sagt03420
Nucleotide excision repair
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
sagt00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03420 Nucleotide excision repair
GBSCOH1_1556
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
sagt03400
]
GBSCOH1_1556
DNA repair and recombination proteins [BR:
sagt03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
NER (nucleotide excision repair)
GGR (global genome repair) factors
GBSCOH1_1556
DSBR (double strand breaks repair)
NHEJ (non-homologous end-joining)
SHDIR (short-homology-dependent illegitimate recombination)
Supressor
GBSCOH1_1556
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
UvrA_DNA-bind
UvrA_inter
ABC_tran
SMC_N
AAA_16
RsgA_GTPase
AAA_29
AAA_21
nSTAND1
AAA_22
AAA_23
nSTAND3
AAA_33
Viral_helicase1
AAA_18
nSTAND6
AAA_14
ATPase
NACHT
MMR_HSR1
NB-ARC
BCA_ABC_TP_C
cobW
DUF87
DnaJ_CXXCXGXG
NTPase_1
MeaB
IIGP
DUF463
Septin
YobI-ATPase
PRK
T2SSE
Dynamin_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CDN67022
LinkDB
All DBs
Position
complement(1619625..1622453)
Genome browser
AA seq
942 aa
AA seq
DB search
MQDKLMIRGARAHNLKNISVDIPRDKLVVVTGLSGSGKSSLAFDTIYAEGQRRYVESLSA
YARQFLGNMEKPDVDSIDGLSPAISIDQKTTSKNPRSTVGTVTEINDYLRLLYARVGTPY
CINGHGAITASSVEQIVDKVLALPERTKMQILAPIIRRKKGQHKSTFEKIQKDGYVRVRI
DGDIHDVTEVPELSKSKMHNIDIVVDRLINKEGIRSRLFDSVEAALRLSDGYVVIDTMDG
NELLFSEHYSCPECGFTVPELEPRLFSFNAPFGSCPTCDGLGIKLEVDIDLVIPDRSKTL
REGALVPWNPISSNYYPTMLEQAMTQFGVDVDTPFEKLSKAEQDLALYGSGEREFHFHYI
NDFGGERNIDLPFEGVVNNINRRYHETNSDYTRNVMREYMNELKCNTCHGYRLNDQALCV
RVGGEEGLNIGQVSDLSIADHLELLETLRLSSNEQLIARPIIKEIHDRLSFLNNVGLNYL
NLSRSAGTLSGGESQRIRLATQIGSNLSGVLYVLDEPSIGLHQRDNDRLIDSLKKMRDLG
NTLIVVEHDEDTMMAADWLIDVGPGAGAFGGEIVASGTPKQVAKNTKSITGQYLSGKKVI
PVPSERRVGNGRFLEIKGAAENNLQNLDVKFPLGKFIAVTGVSGSGKSTLINSILKKAVA
QKLNRNSDKPGKYVSLEGIEYVDRLIDIDQSPIGRTPRSNPATYTGVFDDIRDLFAQTNE
AKIRGYKKGRFSFNVKGGRCESCSGDGIIKIEMHFLPDVYVPCEVCHGTRYNSETLEVHY
KEKNIAQILDMTVNDAVTFFAAIPKIARKLQTIKDVGLGYVTLGQPATTLSGGEAQRMKL
ASELHKRSTGKSLYILDEPTTGLHADDIARLLKVLDRFVDDGNTVLVIEHNLDVIKTADH
IIDLGPEGGIGGGQIVAIGTPEEVAENPKSYTGYYLKEKLAR
NT seq
2829 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcaagataaattaatgataagaggagcaagagctcacaatttaaaaaatataagtgtc
gacattccacgagacaagttagttgtcgttacgggactatcaggatcaggtaagtctagt
ttggcctttgacactatctatgcagaaggacaacgtcgttacgttgaaagtctttctgct
tacgcgcgccaatttttgggaaatatggaaaagcctgatgtagattctattgatggcctt
agtccagctatttctattgatcagaaaacaacaagtaagaatcctcgctctactgttggg
actgtaacagaaattaacgattatttacgtttgctttatgctcgtgttggaaccccatat
tgtatcaatggtcacggagccatcacagcatcttctgtagagcaaattgtggataaggta
ctagcgcttccagagcgaacaaagatgcaaattttagccccaattatacgtcgaaaaaaa
ggacaacacaaatcaacatttgagaaaatacaaaaagatggttacgttcgtgttcgtatt
gatggtgatattcacgatgttactgaggtgcctgaattatcaaaaagtaagatgcacaat
attgatattgtagtagatcgattaattaataaagagggcattcgttcccgcttatttgat
tccgttgaagcggctctacgtttgtcggatggttatgtcgttattgatacaatggatggc
aatgagttattgttttcagagcattattcttgtcctgaatgtggttttactgttcctgaa
ttagagccacgccttttttcttttaatgctccctttggttcttgtccgacctgtgatggc
ttaggaattaagttagaagtagatatagatttggttattccagatagaagtaagaccctt
agagaaggggccttagttccttggaatccaatttcatcaaattattatccaacgatgcta
gagcaagctatgactcaatttggtgttgatgtggatacgccatttgaaaaattaagcaag
gcggagcaggacctagccctatatggttcaggcgaacgagagttccatttccattatatt
aacgattttggaggcgagagaaatattgatttgccttttgaaggggttgtcaataatatt
aatcgtcgttaccatgaaactaatagcgattacacacgcaatgttatgcgagaatatatg
aacgagctaaaatgtaacacttgtcatggctatcgtctcaatgatcaagcactttgcgta
agagttgggggagaagaaggtcttaatattgggcaagtctcagatttatcgatagcagac
catttagaacttttagaaacattgcgtttatcttcaaatgaacaattaattgctcgacca
attatcaaagaaatccatgaccgtctaagtttcttaaataatgttggacttaattattta
aatctgtcacgttctgcaggaacactttccgggggcgagagtcaacgtattcgtttggct
actcaaattgggtctaatttatcaggtgtcctttatgtacttgatgagccgtccattgga
cttcatcagcgagacaatgaccgtttgattgatagtcttaagaaaatgcgtgatttgggt
aatacgcttattgttgttgaacatgatgaagatacaatgatggcagctgattggttaatc
gatgtgggacctggcgctggtgcgtttggtggtgagattgtggcctctggtacaccgaag
caagtagctaaaaatactaaatctattacaggacaatatttgtcaggtaagaaagtgatt
cctgtgccatctgaacgaagagtaggtaatggtcgctttttagaaatcaaaggtgcggca
gaaaacaacctacaaaatttagatgtcaagttccctctcggtaaatttattgccgtaact
ggtgtctcaggttctggaaaatcaaccttaattaatagtattttgaaaaaagctgttgcg
cagaagcttaaccgtaactcagataaaccaggtaaatatgtttctttagaaggcattgaa
tatgttgatcgattgattgatattgatcaaagtccaattggtcggactccacgttctaat
cccgcaacctatacaggtgtttttgatgatattcgtgatctttttgctcaaactaatgag
gcaaagattcgaggttataaaaaaggacgcttctcatttaacgtcaaaggtggacgttgt
gagtcttgttctggcgatggtatcatcaaaattgagatgcattttttaccagatgtctac
gttccttgtgaagtatgccacggcacgcgctataatagtgagactctggaagtacattac
aaagaaaaaaatattgcacaaattcttgatatgacagtgaatgatgcagttacatttttt
gcagctattcctaaaattgctcgtaagttacagactattaaggatgttggtttgggatat
gtcactttggggcaaccagctacaaccttatcaggaggagaagctcagcgaatgaagctg
gcaagtgaattacataagcgttcgacaggtaagagtctttacatattagacgaaccaaca
acggggcttcatgcagatgatattgctcgtttacttaaggttttggatcgttttgtagat
gatggtaatacagtgcttgttattgagcataaccttgatgttattaaaactgctgaccac
attattgatcttggccctgaaggaggtattggtggcggacaaattgtagctatcggaaca
ccagaagaagttgctgaaaatcctaaatcctatacaggatattatttaaaagagaagtta
gcaagatag
DBGET
integrated database retrieval system