Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9 (MRSA/VISA): SaurJH9_0966
Help
Entry
SaurJH9_0966 CDS
T00522
Name
(GenBank) DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B
KO
K16899
ATP-dependent helicase/nuclease subunit B [EC:
5.6.2.4
3.1.-.-]
Organism
saj
Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9 (MRSA/VISA)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
saj00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
saj03400
]
SaurJH9_0966
Enzymes [BR:
saj01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.4 DNA 3'-5' helicase
SaurJH9_0966
DNA repair and recombination proteins [BR:
saj03400
]
Prokaryotic type
DSBR (double strand breaks repair)
HR (homologous recombination)
AddAB pathway proteins
SaurJH9_0966
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ADDB_N
PDDEXK_1
UvrD_C
AAA_30
Anamorsin_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABQ48767
UniProt:
A5IRE4
LinkDB
All DBs
Position
1011516..1014989
Genome browser
AA seq
1157 aa
AA seq
DB search
MTLHAYLGRAGTGKSTKMLTEIKQKMKADPLGDPIILIAPTQSTFQLEQAFVNDPELNGS
LRTEVLHFERLSHRIFQEVGSYSEQKLSKAATEMMIYNIVQEQQKYLKLYQSQAKYYGFS
EKLTEQIQDFKKYAVTPEHLEHFIADKNMQTRTKNKLEDIALIYREFEQRIQNEFITGED
SLQYFIDCMPKSEWLKRADIYIDGFHNFSTIEYLIIKGLIKYAKSVTIILTTDGNHDQFS
LFRKPSEVLRHIEEIANELNISIERQYFNQLYRFNNQDLKHLEQEFDVLQINRVACQGHI
NILESATMREEINEIARRIIVDIRDKQLRYQDIAILYRDESYAYLFDSILPLYNIPYNID
TKRSMTHHPVMEMIRSLIEVIQSNWQVNPMLRLLKTDVLTASYLKSAYLVDLLENFVLER
GIYGKRWLDDELFNVEHFSKMGRKAHKLTEDERNTFEQVVKLKKDVIDKILHFEKQMSQA
ETVKDFATAFYESMEYFELPNQLMTERDELDLNGNHEKAEEIDQIWNGLIQILDDLVLVF
GDEPMSMERFLEVFDIGLEQLEFVMIPQTLDQVSIGTMDLAKVDNKQHVYLVGMNDGTMP
QPVTASSLITDEEKKYFEQQANVELSPTSDILQMDEAFVCYVAMTRAKGDVTFSYSLMGS
SGDDKEISPFLNQIQSLFNQLEITNIPQYHEVNPLSLMQHAKQTKITLFEALRAWLDDEI
VADSWLDAYQVIRDSDHLNQGLDYLMSALTFDNETVKLGETLSKDLYGKEINASVSRFEG
YQQCPFKHYASHGLKLNERTKYELQNFDLGDIFHSVLKYISERINGDFKQLDLKKIRQLT
NEALEEILPKVQFNLLNSSAYYRYLSRRIGAIVETTLSALKYQGTYSKFMPKHFETSFRR
KPRTNDELIAQTLTTTQGIPINIRGQIDRIDTYTKNDTSFVNIIDYKSSEGSATLDLTKV
YYGMQMQMMTYMDIVLQNKQRLGLTDIVKPGGLLYFHVHEPRIKFKSWSDIDEDKLEQDL
IKKFKLSGLVNADQTVIDALDIRLEPKFTSDIVPVGLNKDGSLSKRGSQVADEATIYKFI
QHNKENFIETASNIMDGHTEVAPLKYKQKLPCAFCSYQSVCHVDGMIDSKRYRTVDETIN
PIEAIQNININDEFGGE
NT seq
3474 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacattacatgcttatttaggtagagcgggaacaggtaagtctacgaaaatgttgacc
gaaataaaacaaaaaatgaaagcagatccgcttggagatccaatcattttaattgcgcca
actcaaagtacatttcaattagaacaagcctttgtcaatgatccggaattaaatggtagt
ttaagaacagaagtgttgcattttgaacgattaagtcatcgtattttccaagaagttggt
agttatagcgaacaaaagttatctaaagctgcaacggaaatgatgatttataacattgtt
caagaacaacaaaagtatttaaaactttatcaatcacaagcaaaatattatgggtttagt
gaaaaattaacagaacaaattcaagattttaaaaaatatgcagtaacgcctgaacattta
gaacactttattgctgataaaaatatgcaaactcgaactaaaaataagttagaggatatt
gctttaatataccgtgagttcgaacaacgcattcaaaacgagtttattactggtgaggat
tcattacaatattttattgattgtatgccgaaatcagagtggctaaaacgtgctgatata
tatattgatggttttcacaacttttcaacgattgagtatttaataatcaaaggattaatt
aaatatgcgaagagtgtcacaattatattgacgacagatggtaaccacgatcaatttagt
ttatttagaaaaccatcggaagtgttacgacatattgaagaaatagcaaatgaactcaat
atttctattgaacgtcaatatttcaaccaattatatcgcttcaataatcaagatttaaag
catcttgaacaagaatttgatgtacttcaaatcaatcgagtggcatgtcaaggtcatatc
aatattttagaatctgcgactatgagagaggaaataaatgaaattgcgcgacgtatcatc
gttgatattcgtgataagcaattacgatatcaagatattgcaattttatatcgtgacgag
tcttatgcttatttatttgattccatattaccgctttataatattccttataacattgat
acaaagcgttcgatgacacatcatccggtcatggaaatgattcgttcattgattgaagtt
attcaatctaattggcaagtgaatccaatgctacgcttattgaagactgatgtgttaacg
gcatcatatctaaaaagtgcatacttagttgatttacttgaaaattttgtacttgaacgt
ggtatatacggtaaacgttggttagatgatgagctatttaatgtcgaacattttagcaaa
atggggcgtaaagcgcataaactgaccgaagatgaacgtaacacatttgaacaagtcgtt
aagttaaagaaagatgtcattgataaaattttacattttgaaaagcaaatgtcacaagcg
gaaactgtaaaagactttgcaactgctttttatgaaagtatggaatatttcgaactgcca
aatcaattgatgacagagcgagatgaacttgatttaaatggtaatcatgaaaaggcggag
gaaattgatcaaatatggaatggcttaattcaaatccttgacgacttagttctagtattt
ggagatgaaccaatgtcgatggaacgtttcttagaagtatttgatattggtttagaacaa
ttagaatttgtcatgattccacaaacattagatcaagttagtattggtacgatggatttg
gctaaagtcgacaataagcaacatgtttacttagttggaatgaacgacggcaccatgcca
caaccagtaactgcatcaagtttaattactgatgaagaaaagaaatattttgaacaacaa
gcaaatgtagagttgagtcctacatcagatattttacagatggatgaagcatttgtttgc
tatgttgctatgactagagctaagggagatgttacattttcttacagtctaatgggatca
agtggtgatgataaggagatcagcccatttttaaatcaaattcaatcattgttcaaccaa
ttggaaattactaacattcctcaataccatgaagttaacccattgtcactaatgcaacat
gctaagcaaaccaaaattacattatttgaagcattgcgtgcttggttagatgatgaaatt
gtggctgatagttggttagatgcttatcaagtaattagagatagcgatcatttaaatcaa
ggtttagattatttaatgtcagcattaacgtttgacaatgaaactgtaaaattaggtgaa
acgttgtctaaagatttatatggtaaggaaatcaatgccagtgtatctcgttttgaaggt
tatcaacaatgcccatttaaacactatgcttcacatggtctgaaactaaatgaacgaacg
aaatatgaacttcaaaactttgatttaggtgatattttccattccgttttaaaatatata
tctgaacgtattaatggcgattttaaacaattagacctgaaaaaaataagacaattaacg
aatgaagcattggaagaaattttacctaaagttcagtttaatttattaaattcttcagct
tactatcgttatttatcaagacgcattggcgctattgtagaaacaacactaagcgcatta
aaatatcaaggcacgtattcaaagtttatgccaaaacattttgagacaagttttagaagg
aaaccaagaacaaatgacgaattaattgcacaaacattaacgacaactcaaggtattcca
attaatattagagggcaaattgaccgtatcgatacgtatacaaagaatgatacaagtttt
gttaatatcattgactataaatcctctgaaggtagtgcgacacttgatttaacgaaagta
tattatggtatgcaaatgcaaatgatgacatacatggatatcgttttacaaaataaacaa
cgccttggattaacagatattgtgaaaccaggtggattattatacttccatgtacatgaa
cctagaattaaatttaaatcatggtctgatattgatgaagataaactagaacaagattta
attaaaaagtttaagctgagtggtttagtgaatgcagaccaaactgttattgatgcattg
gatattcgtttagaacctaaattcacttcagatattgtaccagttggtttgaataaagat
ggctctttgagtaaacgaggcagccaagtggcagatgaagcaacaatttataaattcatt
cagcataacaaagagaattttatagaaacagcttcaaatattatggatggacatactgaa
gttgcaccattaaagtacaaacaaaaattgccatgtgctttttgtagttatcaatcggta
tgtcatgtagatggcatgattgatagtaagcgatatcgaactgtagatgaaacaataaat
ccaattgaagcaattcaaaatattaacattaatgatgaatttgggggtgagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
