KEGG   Shewanella algae: BS332_01475
Entry
BS332_01475       CDS       T05622                                 
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
salg  Shewanella algae
SSDB
Motif
Pfam: FG-GAP_3 RHS_repeat TcdB_toxin_midN FG-GAP RHS DUF6443
Other DBs
NCBI-ProteinID: AXQ13233
LinkDB
Position
complement(326092..331707)
AA seq 1871 aa
MSIPSGNNDTAKFFDMDGDGLSDIVYVRDGRWYKRGIQSGIEQAMASTGAGKAAYAQTID
YDGDGQRDLLVANSETANWQILSFKPSTYQHTVCEPNGRGTQLCEDVERVVNYTLKDLGL
KAIGLEGKALVADVNGDALEDIIFIDGGAIKWYRNLGNGSFAAAQSLYSFPSTEVGHNTS
VHQWHSSRGFGSSFMDINGDGLTDFMLEVREREAVCISGSGKVISGVTENECRMDIRGTW
SVSDYEYWNLYVSTGSSYRRYQKIYRGQHNNLNIANTLRSADFNGDGLSDIAYVHNNKWF
IQLADGNGFLPRIDTGITTSDTQKYKTYFIDIAGDGRAEMVVQHTLNQALVYHSNPELTS
WTTYGAINDLSVQPLNFADIDGRGKLDIVSLSNGQWQRLTHKSHAYHNTIKGITDGFGVK
TRVTYAPLTEKSAGEYSVYKTQVSSYLDNSRNFSLIPPQKVVKQVATETGDGSQVSVNYE
YGGLLINRLGRGPAGFELLRTIDNQTQVVTETIYHQLFPQIGLPLATKQTYQGKTLYSAI
NEYSFQRGNDGIYRRVEENVVERTSQYGSDGVVRELTQTNTQTQFDDWGNAIAIKVDVTD
LEATQLVSRVETVNQYDGHGGGEAKGRLSHTRVTKSRFNQREQVQAIVTESAFSYYDNGL
LMNSTVSPNDNRYKLTTGKTYDIYGNTLTERVTGGVDAAGNTQQSRQMSCLFDARGRLLK
TVTNAAGDSSTYTYNGQSADQVTGKITQITVTDANGRKLTKDHDKWGRLVREVTPDGVPT
SYQYATCDAGCSPLSHGHLVTTKTKAGAPQSKVITDKYGREVGKQKQGFDGQWIVTATSY
DAQGRPVRQYEPAFAGISAYYTEIEYDHFGRVINQTNPNGGVSSIQYLGFETLTIDPNGK
QKRAISNAMGEQFKVVDDIGNELEFVYDASGKLVKSFITSASGQELLRTEASYDAYGRKI
STKDIDKGQWRYTYNAFGEMLSQTNGKSQSSFIYYDILGRKVRQTEPDGTSCWTYGNKGS
KTAGLLITETRFDTVVSNCSQTGWVHSKQSGYDSAGRLASSKTSIAGSSYEHRFSYDSHG
RAATQTYPNNLLTVVNHYNAQGYLFKRTDQQTGKAYQTITEMNARGQVEQVRYGNGAQES
TVFDATTGWVSGINLTTAGVTAHQLDYRFDTVGNLEYRQHSLSSAPATFSENYHYDDLYR
LYERTVSIHSGGTSLPSDFKATHEMQYDDLGNITFKTGVGDYRYDSANPYRLASIANTST
IAASKSCPAGYAFNSSKTSCLKTETRAATAVCPVGYSWNGSNCQKAISSPATPVCQAGYS
WSGSQCLKTVSSPATAVCAAGYNWNGSTCQKTVTSQATATCSAGYTYNSTAKRCEKKVVS
SAAKTCPAGYSYSSAQDKCTQTSTTWAKWVCTGSGGGGRDPKSTIPEFSTRAQVCDWKCP
SGYNNVWPGGEQCKKTELANYTYTCPTGSTLSGSSCTKLQTQSNGWSCPAGSTLSGSSCN
KVVTQNNTWSCPAGSTLSGSVCNKNYTAAPSWSCPAGTALSGTNCTGTQTASPSSWSCPS
GWSVSGSSCRRQLSAAVIYSCPANGVLNGSSCLISDGPSHTMTYDNNGNITQDGSRRFTY
SSYDLVTNITQGGESTRFKYDANRQRFERYDVKVEAGVTSYLTTLYVGGYEKVTRSGGNK
PALTVQKLYVGNLVITKRSNNTVDEFYLHKDHQGSTTTITNKSGNVVQQFTYDPWGKQTA
AYSHSLLNDYIAPAASKGYTGHEGIDNLNLIHMNGRIYDPTIGRFLQADPHIQAPTNTQS
YNRYSYVLNNPMSYSDPSGFFFKKMGEFFKKFWKPIVAVIVTVVTYGAASGWVAGWGLLG
GQQQLQPVPHL
NT seq 5616 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
ttgagtattccgtccggtaacaacgacaccgccaagttttttgatatggacggtgacggt
ttatcagatatcgtttatgtacgggacgggcgttggtacaagcgtggtattcagtcgggt
attgaacaggcgatggcctcgaccggtgccggtaaggcggcttatgcccaaaccatagac
tatgatggtgatggccagcgtgacttgctggtggccaacagtgaaaccgccaattggcaa
attctgtcttttaaaccctccacttatcagcacactgtgtgtgagccaaatggccgtggt
actcagctatgtgaggatgttgagcgtgtggtgaattacacgctcaaggatttggggctt
aaggctatcgggcttgaaggcaaggcgctggttgccgatgtcaatggtgatgcattggaa
gacatcatcttcatcgatggtggcgccatcaagtggtatcgcaacttgggaaatggaagt
tttgctgcggcgcaaagtctttatagcttccccagtactgaagttgggcacaacaccagc
gttcaccagtggcattccagtcgaggttttggcagctcctttatggatatcaacggtgat
ggactcaccgactttatgttggaggttagagagcgggaagctgtgtgtatctccggtagc
ggcaaagtgatttctggtgtgaccgaaaacgaatgccggatggacatcagaggtacttgg
tctgtcagtgattacgagtattggaacctttatgtctctactggctccagttatcgccgg
tatcaaaaaatctatcgtgggcagcacaataatctcaatatcgccaataccttacgcagt
gccgatttcaatggtgatggcttgtcggatattgcctatgtccataataataaatggttt
attcaattggccgatggcaatggtttcttgcctcgaatcgatacgggcattaccacttcc
gatactcagaagtacaaaacctattttatcgatattgctggtgatggcagagccgaaatg
gtggttcagcatacgctgaatcaggcactggtgtatcactccaaccccgagttaacttca
tggaccacttatggcgcaatcaatgacctgtccgttcaaccattgaatttcgcggatatt
gatggtcgtggaaagctggatattgtctctctcagtaacggtcaatggcaaaggttaacc
cataagagccatgcatatcataataccatcaaggggattaccgacggatttggagtcaag
accagggtgacttacgcgccgctgacggaaaagtctgctggcgaatacagtgtctataag
actcaggtatccagttatctggacaacagtcgtaacttctcccttattccgccgcaaaaa
gttgttaagcaagttgccactgaaaccggggatggcagccaggtttccgttaactatgag
tatggcggcttgctgataaaccgtttggggcgtggcccggccgggtttgagttattacgc
accatagacaatcagactcaggtggtgaccgagactatctatcatcagttgttcccgcaa
ataggtttgcccctggcaaccaaacaaacctatcagggaaaaacattgtactcggcaatc
aatgaatacagctttcagcgaggcaatgacggcatttaccgccgggttgaagaaaacgta
gtggagcgcacctcgcaatatggcagcgatggggtggtaagggagttaacgcagacaaac
acccagactcagttcgacgactggggaaatgccattgccattaaagtggatgtaactgac
cttgaagccactcaattggtttcaagggtcgagacggttaaccagtatgacggtcatggt
ggcggcgaagccaaggggcgactgagtcataccagggtgactaaatcacgctttaatcag
cgagagcaggttcaggcgatagtgaccgagagcgcattcagctattacgataacggtttg
ctgatgaactcaacggtatcgccaaatgacaatcgctacaaattgactaccggcaaaacc
tatgacatttacggcaacaccctgaccgagcgggtcaccggaggcgtagatgccgccggc
aacacccagcagtcgagacagatgagctgtttattcgatgccagagggcgtctgctcaag
acagtgaccaacgcggcaggcgacagcagcacctatacctacaatggtcagtcggcagac
caggtaacgggtaaaatcactcaaattaccgtgactgatgccaatggtcgcaaactgacc
aaagaccatgacaagtggggaaggctggtgcgggaagtcactccggatggtgttccaaca
agctatcagtatgccacctgtgatgccgggtgttcacctctcagtcatggccatttggtt
accaccaagaccaaggccggtgcgcctcaatccaaagtcatcacagataaatatggccgt
gaagtcggtaagcagaagcagggttttgatgggcaatggattgttactgcaaccagctac
gatgcgcagggaaggcctgtcagacaatatgaacccgcttttgccggtatcagtgcctat
tacaccgaaatagagtacgaccactttggtcgggtcatcaaccaaaccaatcccaacggc
ggcgtttccagtattcaatatctgggatttgagacgctgacgatagaccccaatggcaag
caaaagcgtgctatctccaatgccatgggtgagcaatttaaagttgttgatgatatcggc
aacgaactggagtttgtctatgatgccagtggcaagctggtgaagagttttatcacctca
gcctcgggacaagagctgctgcgcaccgaggcaagctatgatgcctacggccgcaaaatc
agcaccaaggacattgataagggacagtggcgctacacttataacgcctttggcgaaatg
ctgtcacagaccaatggtaaatcccaatccagctttatctactatgacattctagggcgt
aaagtcaggcaaactgagccagatggcacctcttgctggacctatggtaacaaaggcagc
aaaactgccggtttacttattacggaaacccgtttcgacaccgttgtgtccaattgctct
caaaccggctgggtacacagcaagcagagcgggtatgacagtgccggccggttggccagc
agcaagacaagcatagcaggtagtagctatgagcatcgctttagctatgacagccatggc
agagcggcgactcagacataccccaataacttgctgacggttgtcaaccactacaacgct
cagggataccttttcaagcgtaccgaccaacaaacaggtaaggcatatcaaactatcacc
gaaatgaatgcccgaggtcaggtggagcaggtgcgttatggtaatggtgcccaggaatca
accgtttttgatgcaaccactggctgggttagcggtatcaatttgaccactgctggagta
acagcccatcagcttgactatcgttttgataccgtgggtaacctggagtaccgtcagcac
agcctgtcttcggctccggccacattcagcgaaaactatcactatgatgatttgtatcgc
ttgtatgaacgtaccgtcagcatccactccggtggtacgagtctgccatcagactttaaa
gccacccatgagatgcaatatgacgatttgggcaatatcacctttaaaaccggtgttggt
gattaccgctacgatagcgccaacccctatcgtctggcctccattgccaacacaagtaca
attgcggccagcaaatcctgcccggcaggttatgctttcaacagcagcaaaaccagttgc
ctcaaaacggagacaagagcggccactgcggtatgccctgtcggctatagctggaatggc
agcaactgccagaaagccatctcatcgcctgcgactcctgtttgtcaggcgggttattcc
tggagtggtagtcaatgccttaaaacagtatccagtccggcaaccgccgtttgtgctgcg
ggttacaactggaatggcagtacctgccagaagactgtgacatcacaggcaaccgcaacc
tgctcagccggatacacctacaacagcactgctaaacgctgtgagaagaaggtggtttcc
agtgctgccaagacttgtccggctggttatagctattccagtgcacaagataagtgtact
caaaccagtactacctgggctaaatgggtatgtacgggaagtggtggaggaggtagagac
cccaagagtactatccctgagttcagtacccgtgcccaagtctgtgattggaaatgccct
tcgggttataacaatgtgtggcctggtggagagcagtgtaagaaaacagagctggcgaat
tatacctatacctgtccaacaggaagtacgctttcaggctccagctgtaccaaattgcaa
acccagagtaatggctggtcatgtcccgcaggcagtaccctgtccggcagtagctgcaac
aaagtagtgacccaaaacaacacttggtcatgcccggccggcagtaccttatcgggtagt
gtctgtaacaagaattatactgcagcgcctagctggtcctgtcctgctggaactgcgctg
tcaggaaccaactgcacaggtacccagacagccagccccagtagttggagttgcccaagt
ggttggtcggtttccggtagcagttgtcgccgtcagctcagtgccgcagtgatctattcc
tgtccggccaatggtgtgctcaatggttcaagttgcctgatatccgatgggccatcacat
accatgacctatgacaataatggcaatatcacccaggatggcagtcgccgtttcacttac
agttcttacgatttggtcaccaacattactcaaggtggggaatcaacccgctttaagtat
gatgccaaccggcaacgcttcgagcgttacgacgttaaagttgaagcgggagtgacaagc
tatctcaccaccttatatgtcggggggtatgagaaagtcacccgtagcggcggcaacaaa
ccggcactcaccgtgcaaaaattgtatgtcggcaatttggtgataaccaagcgtagtaat
aacactgttgacgagttttacctgcacaaagatcatcaaggctcaaccacgacgattacc
aataagtcaggtaatgtggtgcagcagtttacctatgacccttggggtaaacaaaccgcc
gcctatagccattcactgttgaatgattatatcgcgccagctgcatccaaaggttatacc
gggcatgaaggtatagataacctgaatcttatccatatgaatgggcgtatctatgacccc
accataggacgtttcttgcaggccgatccgcatatccaagcgccaaccaatacacaaagc
tataaccgttatagttatgttttgaataacccgatgagttattccgatccgagtgggttc
ttctttaagaagatgggagaattcttcaaaaaattctggaaaccgattgttgccgttatt
gtgactgttgttacatatggcgcagcatcgggttgggttgctggttgggggctacttggg
ggacagcagcaactacaaccagtgccgcatctttga

DBGET integrated database retrieval system