Candidatus Syntrophocurvum alkaliphilum: SYNTR_0865
Help
Entry
SYNTR_0865 CDS
T06326
Name
(GenBank) TRAP-type uncharacterized transport system, fused permease component
Organism
salq
Candidatus Syntrophocurvum alkaliphilum
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DctM
DUF3394
PET122
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QGT99458
UniProt:
A0A6I6D971
LinkDB
All DBs
Position
855802..857694
Genome browser
AA seq
630 aa
AA seq
DB search
MFSFLAISLTIFHLYTASYGILQSQVQGAVHLGTGLGLIFILYPIKKGLQHKQKGVPWYD
VILAFLALFVGYYFAYFVNEITVRIPRNDATSLDLLVAVLGVFLVLEATRRCVGLPIVVI
ASVFITYALLGPHMPVLDHRGFAWDNLALRLYFSTSAIFGTPIQVSSKFIFLFLLFGVVL
IKTGIGKFFNDLAFALAGRYTGGTAKAAVAASALQGTVSGSSVANTVSSGSFTIPLMKKS
GFKPEFSAAAEASASTGGQLMPPIMGAAAFLLAEYAGVPYSQVMLAALIPALLYFSGVFM
GVHFESKKLGIKGLPKSELPKLKEIIFSRGYMILPLILIFTTLLIGFTPIRAALIGIGSA
FILSFIKKETRLSIIDIFETLERGARVALPVIAACASAGIVAGIVVITGLGGKLASGIIS
MSGGILILTLVFTMLACILLGMGLPTTANYVVTASIAAPALVNHPEFAIPVLAAHMFVFY
FGIVADITPPVCLAAYAGSGIAQSNPFHSGVTAVKLAIAAYIIPFIFIYNPMLILIDFTY
PLLAISVLTAMLGMFGISSAMMGYFIRHSYLWERLVLFAAGIMLISPNILVDLSGVILII
GIWLIQKRREDENLKDDKLTNELTERPQHL
NT seq
1893 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgttttcatttcttgctatatctttaactatatttcatttatatactgcttcatatggt
attttacaatcacaagtacaaggtgctgtacatttaggaacaggacttggtttaatattt
atactttatcctattaagaaaggattacagcataaacaaaaaggtgttccttggtacgat
gtaatactagcctttctagcattgttcgtgggttattattttgcttattttgtaaatgaa
attactgtacgaatacctcgtaatgatgctacaagtttagatcttttagttgctgtatta
ggtgtatttttagttttagaagcaactagaagatgtgtaggattaccaatagttgtgatt
gctagtgtatttattacatatgctttattaggccctcacatgcctgtattagatcataga
ggttttgcatgggataatttagcattaagactctactttagcacttctgctatttttggt
actccgatacaggtttcgtctaaatttattttcctatttttgcttttcggtgtagtgctt
attaagacaggtattggaaagtttttcaatgatctagcctttgctttggcaggacgatat
acaggtgggacagcaaaagctgcggttgcagcaagtgctttacaaggaacagttagtgga
agctcagttgctaatacagtcagctcaggttcctttacaattccattaatgaaaaaatcc
ggatttaaacccgagttttcagctgctgctgaagcatcagcttcaactggtggacaactt
atgccgccaattatgggagctgctgcatttttattagctgaatatgccggtgttccttat
agccaagttatgttagcagcacttatccccgctttgctatatttttcgggtgtatttatg
ggagtacactttgaatctaaaaaattaggtattaagggtttgccaaaaagtgagctacca
aaattaaaagaaataatttttagtcgtggatatatgattttaccactgatattaattttt
acgactttattgattggctttacaccaatacgagctgctttaattggaataggaagtgcg
tttatattaagctttataaaaaaggagacacgtctttctattatagatatttttgaaaca
cttgaaagaggagcaagagttgctttacctgtaatagccgcttgtgcaagtgctggtatt
gtagcaggaattgttgttattactggcttaggaggtaaattggcttcaggaataatttcc
atgtcaggaggcatactaattttaacactagtttttactatgctagcatgtatattatta
ggtatgggtctaccaacaactgccaattatgtagtaacagcatcaatagccgcaccggca
ttagtaaatcacccagaatttgctataccggtattagcagcacatatgttcgtgttttat
ttcggaatagtagctgatattactccgcctgtgtgtttagctgcctatgctggttcaggt
atagctcagtctaatccatttcactcaggagtaacagcagtaaaattagctattgcagcc
tatattataccttttatatttatatataacccaatgcttattttaatagattttacatac
ccactattagcaatatcagtccttacagcaatgcttggtatgtttggaataagtagtgct
atgatgggctactttatacgtcattcatatttatgggaaagactagttttatttgctgct
ggtataatgctcatatcacctaatattttggtagatctaagtggagtaatcttaataatt
ggtatatggctaatacagaaacgaagagaagatgaaaatcttaaagatgataaattgact
aatgaattaactgaaagaccccaacacttatag
DBGET
integrated database retrieval system
