Candidatus Syntrophocurvum alkaliphilum: SYNTR_1716
Help
Entry
SYNTR_1716 CDS
T06326
Name
(GenBank) RNA helicase
Organism
salq
Candidatus Syntrophocurvum alkaliphilum
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
DEAD
ResIII
Helicase_C
AAA_22
SLFN-g3_helicase
SNF2-rel_dom
CG7065_bundle
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QGU00310
UniProt:
A0A6I6DCI3
LinkDB
All DBs
Position
complement(1750390..1752300)
Genome browser
AA seq
636 aa
AA seq
DB search
MVDRGRGNRAIFDVLPPQRRTLAEQGLLGSSRRAVVVSLPTSSGKTMIAEFRILQALNQF
EYEKGWVAYLVPTKALVNQVTRQLRRDFDSLGVLVEQVSPALEVDNIEQRLLQEQAENSQ
FRVLVTTPEKLDLMLRQGWEEKIGRPLTLVVVDEAHNIQSNSRGLKLELLLATINKECQW
AQFLLLTPFIANGQEVARWLGGQNSDDISLALDWQPNDRIIGIVKAKQEELIKNKSYNYS
LDMETVHTSRNTLTTNGLLNLPGTHDIAKTFAQVNDKSTLAAVTAQYLKQRGPVIVMHTR
PDWVWSLADKLKIESNYIELPSEKIQLVKKFLQLELGANFPLIDLLSYGIGVHHAGLSDD
VRFLMEWLFEENELNFLVATTTIAQGVNFPISGLIMASHQYPEKQKTVDMPPEDFWNIAG
RAGRIGQSSVGVVTLVAKDENHVEKLREFINKQSGELNSALLKLANEAEDNLGDLGSIVY
RYPEWSSFLQYLVHTYRQIGKPDTFIDQVEQVLRGTLGFEKLRIKSPTLANKLLRGIHEY
ANYISAPNQPLKLVDSTGFSLQSINTVLVNKGNIDRSSWNADTLFHEGNQTLQDMMGILL
KVLELRDNLKDVVGEQQPDGQKLASIWRGKMLILLN
NT seq
1911 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttggtagatagaggacgtggtaatcgtgccatttttgatgttttaccaccacagcgccgg
acgttagcagaacaaggtttattagggtccagtcgccgagctgtagttgttagtttacct
acctcaagtgggaaaacaatgatagcagagtttcgaattttgcaggcattaaatcaattt
gaatatgaaaaaggttgggtggcctatcttgttcctacaaaagcgctagtgaatcaggtt
acacgtcaattgcgtcgtgattttgattctttgggagtgttagtcgaacaagttagtcca
gcgcttgaggtagacaatattgaacagagattattacaggaacaagccgaaaattcacaa
tttagagttcttgtgacaacgccagaaaaattggacctaatgcttaggcaagggtgggaa
gaaaagatagggcgtccactaacattagttgtagttgacgaagcccataatattcagagt
aatagtcgtggactgaaactagaacttttattagctacaattaataaagagtgccagtgg
gcacaattcctattattaaccccctttattgctaacggacaagaagtagcccgttggctg
ggaggtcaaaattcagatgatataagtcttgcattagactggcagccaaatgatagaatt
ataggtattgttaaggctaaacaagaagaattaataaaaaataaaagttataattatagt
ttagatatggaaacagtgcatacttcaagaaatacattgaccactaatggtttgcttaat
ttaccgggaacacatgacattgctaagacatttgctcaagtaaatgacaaaagtacattg
gcggctgtaaccgctcagtatttaaagcaacgtggaccggttatagtgatgcatacgcgg
ccagattgggtgtggtctttagcagataagttaaaaattgaatctaattatatagaacta
ccatctgaaaaaatacaactggttaaaaagtttttgcagcttgaattaggtgcaaatttt
ccgcttattgatcttttatcctatggaattggggtacaccatgctggcttgtctgatgat
gttcgatttctaatggaatggctattcgaggaaaatgaattgaattttcttgtcgctaca
actactattgcacagggagtcaattttccgatttctggattaattatggcttctcatcaa
tatccagaaaaacaaaaaactgttgacatgccaccagaagatttttggaatattgcaggt
agggcaggaagaattgggcaaagcagtgttggtgtagttactttagttgctaaggatgaa
aatcatgtagaaaaacttagagaattcattaataagcagtctggagaactaaactcagca
ttattaaaactagcaaatgaagcagaagataatttgggtgatttgggaagtattgtttat
aggtatccagagtggtctagttttctgcagtatttagtacatacatatcgtcaaattgga
aaaccagatacgtttatagatcaggtagaacaggttttacgtggaactttaggatttgaa
aagctacgaattaaaagcccaactttggctaataaattattaagaggaattcatgagtat
gctaattatataagtgctcctaatcagcctctaaaattggttgatagtacaggtttttca
ttacagagtattaatactgttttggtcaataaaggcaatattgacagatcttcatggaat
gcggatacattatttcatgaaggcaaccaaactcttcaggatatgatggggatattatta
aaagtgctagaattgcgggataatcttaaagacgtggtaggtgaacaacagccagatggg
caaaagcttgcttctatttggaggggaaagatgcttatccttttaaattaa
DBGET
integrated database retrieval system