KEGG   Snodgrassella alvi: SALWKB2_0916
Entry
SALWKB2_0916      CDS       T03063                                 
Name
(GenBank) hypothetical protein
  KO
K11891  type VI secretion system protein ImpL
Organism
salv  Snodgrassella alvi
Pathway
salv03070  Bacterial secretion system
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:salv00001]
 09130 Environmental Information Processing
  09131 Membrane transport
   03070 Bacterial secretion system
    SALWKB2_0916
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02044 Secretion system [BR:salv02044]
    SALWKB2_0916
Secretion system [BR:salv02044]
 Type VI secretion system
  Imp/Vas secretion system core components
   SALWKB2_0916
SSDB
Motif
Pfam: IcmF-related IcmF_helical IcmF_C Rv2949c-like BBS7_hp 8xMP
Other DBs
NCBI-ProteinID: AHN28298
LinkDB
Position
1013693..1016935
AA seq 1080 aa
MLRWNPLRQFSSRVNSKLSKLAQVNQKITQRPKILKLWLLCSFLWLILICGLTAFLYWYY
DKKWLQNHKFHLIILALAGLFLCVILPLFWRIFVVIDGQERTIRFIERSKYTRESPAQQN
LVAFQDYLNQKYPLSILNRCYILAVHGEPDAFCDVSEQLQRTGWVQVDNVYLVLINDVDE
IESIPPFRGKYHCPFDGLIILRDMKSNKTPVTHDNISVWLEKFYQLLNWKIPFVHVFQSD
IDLNKFPLNQVFTWSSLTENIVSDIKIKAEDLFIQAFLKSRDRQFLSLIDSIAITKLNPA
ENYSEEQQPWFTGMAIQAKQSNWWETWAMVAEQLYQHPAKLILQPSSQRLAKAGLVISTV
IFLMILYAFTSNYREAQLFRNQITSVNKSSGSNNAINSILSLQHHIALINNVPQPFYRRL
GFNHDDILLNKAFVAYGNAAKKWLIKPADQQIILVLNSLQQLQTLPNVIETNAADTEEIA
EQTSNAVALDEGFNALKAYLMLRRPKRLDNIFLSDYLSRLYRTQGLQKADAAQNIFRFYT
RNMMKHRSWFLSEDSALVAESRGVLNNIVNQQQEDVVIYQNLLDSALEKYRDIDLVQLAG
KDSTQFWTNKNKLHGAFTARAWNEWFKPEIDKLNPEHFKNGSWVLNESEESNENTDIRKQ
IMALYKQDYFEAWTQFLSGIQWVPVTGLNKQMDRLKKYSDKKNSVLVKLLTAIQFNASIG
YPEDRTEKGKGVLQEFEPIVDLIKTVEDRNKQPSRKLDQYQENLLAMYLEVQKVQGANNQ
ASASQLSFNTILNSDDGSNLAKAEESINLQVANLGEEWQDIGHTLLTYPFADAKKAILLP
ALNNINALWQQMVVSQWNSRFANRYPLNPSSNLDVSLPELQKFIDPQKGVVAQFNQQYLN
KILNLVGNQWIVNPAVMDQIQIDDQFVTGLNELNQLLEFVSDGSNTASFEIMPLPTPEVK
QITFNFNKQKIQFYNEKSFWHKVNWSVSDSTDKKASIQWSDVTDKTAQLEVVGDLSILRL
LEKAQARKNDDDTYHLKWIIKNRVVEMNLKNLQTNDLITLLKLKGASLPQQVFKVDQNAN
NT seq 3243 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgttaaggtggaaccctttaagacaattcagttcacgtgtaaatagcaagttgtctaaa
ttagcgcaggtgaatcagaaaattacccagcgccctaaaattctcaaattatggttattg
tgcagtttcctctggttgatacttatttgcggattaactgcatttttatattggtattat
gataaaaaatggctgcaaaatcataaatttcatttgataatactggcactggccggttta
tttctctgcgttatactgccattattctggcgtatttttgttgtcattgacgggcaggaa
cggacaatccgctttattgagcgatcgaaatatacacgtgaaagtcctgcacagcagaat
ttggtggcttttcaggattatttgaatcagaaatatcctttatctattttaaatcgctgt
tatattcttgcggtacatggagaaccggatgctttctgcgacgtcagtgagcagctacag
cgtacagggtgggtacaggttgacaatgtttatctggtattgattaatgacgtggatgaa
atagaatccataccaccttttcgcggcaaatatcattgtccgttcgatggattgattata
ttgcgtgatatgaaaagtaacaaaaccccggttactcacgataatatttctgtatggctg
gaaaaattttatcagctgttaaactggaaaattccatttgtccatgtatttcaaagtgat
attgatttaaataaatttcctcttaatcaggtttttacttggtcatcgctaacagagaat
attgtttcagatatcaaaataaaagcagaggatttatttattcaggcttttttaaaaagc
cgggacagacagtttttgtctctgattgattccattgctattactaaattaaatccggct
gaaaattactctgaagagcagcaaccctggtttacaggtatggctatacaggctaaacaa
agtaactggtgggaaacatgggcgatggtagcagagcagttatatcagcaccctgctaaa
ttgattttacagcccagtagtcagcggcttgccaaagccggtctggtaatcagtactgta
atttttttaatgattctgtatgcttttaccagtaattacagggaagcacagttattccga
aaccaaatcaccagcgtgaataaatcttcgggcagcaacaatgcgattaattctatactc
agtttacaacaccatattgcattgataaataatgttccgcaaccattttaccgtcgtctt
ggatttaatcatgatgatattttactgaataaagcatttgtagcttatggtaatgctgca
aaaaaatggctgataaaacccgcagatcaacagattattctggttctgaattctttacag
caactgcagactttacctaacgtaattgaaacaaatgcagcggatacagaggaaattgca
gaacaaaccagtaatgcagttgcattggatgaaggctttaatgctctgaaagcatattta
atgttacgtcgtcctaaacgtctggataatatttttctaagtgattatttatcacgtctg
tatcggacacagggcttacaaaaagccgatgctgctcagaatatattcagattttatacc
cggaatatgatgaagcatcgaagctggtttctgagtgaagattctgctttggtggcagaa
agtcggggagtattgaataatattgttaatcagcagcaggaagatgtcgttatttatcag
aatttgctggattctgcattagagaaatatagggatattgatttagtgcagctggctggc
aaagatagcactcaattctggacaaataagaataaattgcatggtgcatttactgcacgt
gcatggaacgaatggtttaagccggaaattgataaacttaatcctgaacattttaaaaat
ggttcatgggtgctgaatgagtctgaggaaagcaacgaaaatacggatatccgtaaacag
ataatggcattgtacaagcaggattattttgaagcatggacacaatttttatctggtata
cagtgggtaccggttactggtctgaataaacagatggatcgtttgaaaaaatattcagat
aaaaagaattcagtacttgttaagttactaacagccattcagtttaatgccagtatcgga
tatccggaagaccggactgaaaaaggcaaaggagttttacaggaatttgaaccaattgta
gatttgattaaaacagttgaagacaggaataagcaacccagccgtaaactggatcagtat
caggaaaatctgctggctatgtatcttgaagtacagaaagttcagggggctaataatcag
gcctctgcttcacaactttctttcaatactattttgaatagtgatgatggttctaatctg
gctaaagctgaagaatctattaatttacaagtagctaatctgggagaagaatggcaggat
atcgggcacactttacttacttatccttttgctgatgctaaaaaagcaattttgcttccg
gctttaaacaatattaatgcattgtggcagcagatggtggtttcgcaatggaattctcgt
tttgctaatcgttatccactgaatccttccagcaatctcgatgtctctttgcctgaatta
cagaaatttattgatccgcaaaagggtgttgttgcacagtttaatcagcaatatttaaat
aaaattctgaatcttgttggtaatcagtggattgttaatcctgctgtaatggatcagatt
cagattgatgatcagtttgtaactggtttaaatgaattaaatcagttactagaatttgtt
tcagatggctcaaataccgcttcttttgaaataatgccattgccaactcccgaagttaaa
cagattacatttaattttaataaacagaaaattcaattttataatgaaaaatctttctgg
cataaagtgaattggtctgttagtgatagtaccgataaaaaggcttcaattcagtggtct
gatgtgacagataagactgctcagcttgaagtagttggtgatttgagtattttgcgttta
cttgaaaaggctcaggcacgtaaaaatgatgatgatacttatcatcttaagtggataata
aaaaatagggttgtagaaatgaatctgaagaatttacaaactaacgacctgattacatta
ttgaagttaaaaggggcaagtttgccgcaacaggttttcaaggtggatcaaaatgcaaat
tag

DBGET integrated database retrieval system