KEGG   Snodgrassella alvi: SALWKB2_2246
Entry
SALWKB2_2246      CDS       T03063                                 
Name
(GenBank) DNA-binding protein
Organism
salv  Snodgrassella alvi
SSDB
Motif
Pfam: YobI-ATPase TniB AAA_22 AAA_16 AAA_29 Zeta_toxin DUF2250
Other DBs
NCBI-ProteinID: AHN29628
UniProt: X2HET5
LinkDB
Position
complement(2457358..2461602)
AA seq 1414 aa
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NT seq 4245 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
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DBGET integrated database retrieval system