Spiroplasma alleghenense: SALLE_v1c04480
Help
Entry
SALLE_v1c04480 CDS
T06597
Symbol
secDF
Name
(GenBank) bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF
KO
K12257
SecD/SecF fusion protein
Organism
salx
Spiroplasma alleghenense
Pathway
salx02024
Quorum sensing
salx03060
Protein export
salx03070
Bacterial secretion system
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
salx00001
]
09120 Genetic Information Processing
09123 Folding, sorting and degradation
03060 Protein export
SALLE_v1c04480 (secDF)
09130 Environmental Information Processing
09131 Membrane transport
03070 Bacterial secretion system
SALLE_v1c04480 (secDF)
09140 Cellular Processes
09145 Cellular community - prokaryotes
02024 Quorum sensing
SALLE_v1c04480 (secDF)
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02044 Secretion system [BR:
salx02044
]
SALLE_v1c04480 (secDF)
Secretion system [BR:
salx02044
]
Sec (secretion) system
Prokaryotic Sec-SRP core components
SALLE_v1c04480 (secDF)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SecD_SecF_C
VWA_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AXK51122
UniProt:
A0A345Z3E3
LinkDB
All DBs
Position
508365..512213
Genome browser
AA seq
1282 aa
AA seq
DB search
MKNKKFKSNSFNKNFFRVLTVLFITVAMIISIFFSASSVNDNIKFGKDIKGSFVATVGVF
DNSDSSGNSAIGLPNGDAEAAAEILNNKIDPMGNQQVNVIATDKHYLRVSAPKSSFDNNE
SRFRTTIQRSGGIFIFDSSWKDLLFSDDNKRTKMSDVFSGASATTIGQGTRNAPFIRFDL
PSAGGKFSEIVDSLNPENGDPTPLTIMTDVDSFLDDFRTYYAINNSSDESLDIWFNKILK
PLREKYRNSQDDLFKKVLFDLFFGEYTYSDNNETSIRRESLISEASAFQTADQFKKVMGS
WKFLSDTNKYIYDPNSTEEDFDGTNGKYKTPVRGWTSNTVFGDIGKIKDVFSILSNNIFN
TALSVDQDRFSEYFLYSGNVSKSEPATKSGGFIGDSGKAFFAQTSTFSQAKQAEATFKAA
SKGFSFFVFSVSENQGTISWILFLISSAALILIAVLIAIFLLIFYRLLGLFLIIVISTTI
AIMMVSANVFNLTFGVETLGAIFIVVGLILDMNITLFEAMKKSMFLKKRSFKSSFIISHR
DTIGGVVDAAVVLIIPNIILFWNSSNVIKSFATLVTIGGFITIILSIFVIRVMIYYLAKT
EYLDLHPNWFAINTTMSKKTTFMIEMKYNSLDAKIKAASIKEPLGIKISKLREKLAFYQE
NSNDKLVKKYQDAIDKLVKKQDKILSKDEILLSKYNEKLAQLKIKREKALQKRLEKEQKY
ENVLVEKFKKKIDKYEIKKNKYLALENNPKVFKIDAAIEETRYLIDNNFSIDDSLVRESD
NEENLVIPNEPETPKTAAEKIRVKRRERGIFKFSKLFLIFIALLASLATVLGLSVGPNYD
SSFGKGSEFYIWGDYVESTYSKVEELSSGTWWIDDEPVPTELQDFAKDLLVSPSVNENEK
LYQKTKSATEMLEFVISRDKYFKILTSSNLSAPSIKTNFGVNYTKFEQTGDKADQAPWIM
LTFKTTNKKVLKSINNILIQFTDKTAGSSNDPERGVQRLILSPFSTVKLIQELAISLLII
IAGLIIYIIIRFKWTYYVAITLALTLGLATFASAMVVLQIPLGFSIIISASILISFILTN
AIMILNHGKVLIQSKNEKSLTNYFNKEIDISVNNRENAAIYRADVRKLKLELKLKLQSKE
ISKEDKKNIKKEFKAAKNAEMVKLKELKKENSVKLSRAAKDNNYLKEVIVDVMNFAIKRL
LLIGIFYVAIAITMILTMPNIFAFGLSMLLGIVISMFVTMFIIIPIWIFLEQWRLRNRLA
FKRYINSLKVSQEEQIIEGIND
NT seq
3849 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgaaaaataaaaaatttaaatcaaattcattcaacaagaatttctttagagttttaact
gttttatttattacagttgcaatgataataagtatctttttctcggcatcttcagtgaat
gataatattaaatttggtaaggacatcaaaggtagttttgttgctacagttggtgttttt
gataattctgattcttctggaaactctgcaattggtctaccaaatggtgacgcggaggcg
gctgcagaaattttaaataataaaattgatccaatggggaaccaacaagtaaacgtaatc
gcaacagataaacactacttaagagtttcggctccaaaatcttcttttgataacaatgaa
agtcgttttcgtacaacaattcaaagaagtggtggaatttttatctttgattcaagctga
aaagatttactttttagtgatgataataagcgtacaaaaatgagtgatgttttctcagga
gcttctgcaacaactattggtcaaggaacaagaaatgcgccatttattagatttgactta
ccttctgcaggtggaaaattcagtgaaatagttgattctctaaatcctgaaaatggcgat
cctacaccgcttactattatgactgatgttgatagttttttagatgattttagaacttac
tatgcaattaataattcaagtgatgaaagtcttgatatttgatttaataaaattctaaaa
ccattaagagaaaaatatcgtaattcacaagatgatttatttaaaaaagttttatttgat
ttattttttggagaatacacttattcagataataatgagacttcaattcgtcgtgaaagt
ttaatttcagaagctagtgccttccaaacagctgatcaatttaaaaaagttatgggatct
tgaaaattcctttcagacaccaacaaatatatttatgatcctaactcaactgaagaggac
ttcgatggaacaaatggaaaatacaaaactccagttagaggttgaacatcaaatacagtt
tttggagacattggaaaaataaaagacgttttttcaatactttcaaacaacattttcaat
accgctctttcagttgatcaagatagatttagtgaatatttcctttattcaggtaatgta
tctaaatcagagccagcgactaaaagtggtggtttcataggggattcaggtaaagcattc
tttgcacaaacttcaactttctctcaagcaaaacaagctgaagcaacttttaaagcagct
tcaaaaggtttctcgttttttgtattttcagttagtgaaaatcaaggaacaataagctga
attttatttttaatttcttcagctgcattaattttaattgctgttttaattgcgatattc
cttctaattttctatagattactaggactattcttgattatagtaatttcgacaacaata
gccataatgatggtttctgccaatgtatttaatttaacatttggagtcgaaactcttggc
gcgatatttattgttgttggtttaattttggatatgaatataactttatttgaagcaatg
aaaaaaagtatgttcttaaagaaacgaagtttcaaatcctcatttattatttctcataga
gatacaattggaggggtagttgatgctgctgtagttcttattattccaaatattattctg
ttttgaaattcttcaaatgtaattaaaagttttgcaactctagttacaattggtggtttt
attacaatcattctttctatttttgtaattcgtgtaatgatttattatttagctaaaact
gaatatttagatttacacccaaattgatttgcaataaatactaccatgtctaaaaaaacc
actttcatgattgaaatgaaatacaacagtctagatgcaaaaataaaggcagcaagcatc
aaagaacctttgggtataaaaataagtaaattaagagaaaaattagcattttatcaagaa
aattctaatgataaattagttaagaaataccaagatgctattgataaattagttaaaaag
caagataaaattttatctaaagatgaaattcttttatcaaaatataatgaaaaattagca
caattaaaaataaaacgtgagaaagctttacaaaaacgcctagaaaaagaacaaaaatat
gaaaatgttttggttgaaaaattcaagaaaaaaattgataaatatgaaatcaaaaaaaat
aaatatttagcacttgagaacaacccaaaagttttcaaaatcgatgctgcaatcgaagag
acaagatatctaattgataataattttagtatagatgactctcttgttagggaatctgat
aatgaagaaaacctggtgattccaaatgaacctgaaactccaaaaactgctgctgaaaaa
attcgtgtaaaaagacgagaaagaggaatctttaaattcagtaaattatttttaattttt
attgcattgttagcttctttggcaactgtgttaggtctaagtgttggaccaaattatgat
tcatcatttggtaagggttcagaattctatatttgaggagattatgttgaatcaacttat
tcaaaagtcgaggaactgagttcaggaacttgatgaattgacgatgaacctgtgccaacc
gaattacaagattttgcaaaagatttactagtaagtccatcagtaaatgaaaatgaaaaa
ctctatcaaaaaactaaatcagcaactgaaatgctagaatttgtaatttcaagagacaag
tatttcaaaattttaacaagttcaaatttatcggccccaagtattaaaacaaattttggt
gtaaactacactaaatttgagcaaactggagataaggctgatcaagcaccttgaattatg
ttaacttttaaaactactaataaaaaagttttaaaatcaattaacaatatcttgattcaa
tttacagataaaaccgctggttcatcaaacgacccagagcgtggagttcaaagactaatt
ttaagtcctttctcaacagttaagttaattcaagaattagcaatttctttattgataata
attgctggtctaataatttatattattattcgttttaaatggacttattatgttgccatt
acactggctctcacactaggtcttgcaacctttgcttcagcaatggtagtactacaaatt
cctttaggatttagtataattatttctgcttcgatattaataagttttattttaacaaac
gcaataatgattctaaatcatggaaaagtattaattcagagtaaaaacgaaaaatcatta
acaaactactttaacaaggaaattgatatttcagtaaataaccgcgaaaacgcagctatt
tacagagctgacgtaagaaaattaaaattagaactaaaattaaaattacaaagcaaagaa
atatcaaaagaagataaaaaaaatatcaaaaaagaattcaaagcagctaaaaatgccgaa
atggtaaaactgaaggaactaaaaaaggaaaactcagtaaaactatctagagctgcgaaa
gataataactatttaaaagaagttattgttgatgttatgaattttgcgataaaaagatta
ttattaatcggaatattctatgttgcaattgcgattactatgatattgacaatgccaaat
atttttgcctttggactttcaatgttgctgggaatagttatttcgatgtttgtaacaatg
tttattattatcccaatttgaatattcttggaacaatgaagattaagaaatcgtttagca
tttaaaagatacattaatagtctaaaagtatctcaagaagaacaaataatagaaggtatt
aacgactag
DBGET
integrated database retrieval system