Spiroplasma alleghenense: SALLE_v1c05960
Help
Entry
SALLE_v1c05960 CDS
T06597
Symbol
polC
Name
(GenBank) DNA polymerase III subunit alpha (PolC)
KO
K03763
DNA polymerase III subunit alpha, Gram-positive type [EC:
2.7.7.7
]
Organism
salx
Spiroplasma alleghenense
Pathway
salx03030
DNA replication
salx03430
Mismatch repair
salx03440
Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
salx00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03030 DNA replication
SALLE_v1c05960 (polC)
03430 Mismatch repair
SALLE_v1c05960 (polC)
03440 Homologous recombination
SALLE_v1c05960 (polC)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03032 DNA replication proteins [BR:
salx03032
]
SALLE_v1c05960 (polC)
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
salx03400
]
SALLE_v1c05960 (polC)
Enzymes [BR:
salx01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.7 DNA-directed DNA polymerase
SALLE_v1c05960 (polC)
DNA replication proteins [BR:
salx03032
]
Prokaryotic type
DNA Replication Elongation Factors
Elongation factors (bacterial)
DNA polymerase III holoenzyme
SALLE_v1c05960 (polC)
DNA repair and recombination proteins [BR:
salx03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
MMR (mismatch excision repair)
DNA polymerase III holoenzyme
SALLE_v1c05960 (polC)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DNA_pol3_alpha
RNase_T
PHP
DNA_pol3_finger
HHH_6
tRNA_anti-codon
RNase_H_2
DNA_pol3_a_NII
Rv2179c-like
DNA_pol3_a_NI
DUF655
HHH_3
T2SSK
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AXK51268
UniProt:
A0A345Z3T9
LinkDB
All DBs
Position
complement(683593..688062)
Genome browser
AA seq
1489 aa
AA seq
DB search
MDSTLKSFFTAMSVELHESHKEHFKNSKIIGRQIFDVKKNRVTVKISIQNFLPTEVLKTI
EEQLLNNPVCGSKLVFQVSNDEMSHDLVWDYFQFIIKYKAEFKNGFVENLRENEFTFKNN
IINLCVNDETEKNLWENHLNFYIKKFQDYGFNNLKFNFEVKPSGVDVIAKADESYAETNQ
KVKKIREQPNNNFESKKTDSNNEVVKEKKTFFRKPKADLEVPTYQELGDIEDGAQNVIIH
ARIIKKSIKFSPKSGRNIYTFVITDETSSLQANFFQRLAGVPNLFDEIEKDHPEYENIVR
IGDWVGMSGSLRWNEYSKDNVFYIDEFKKIDRIQKTRMDLSETKRVELHTHSKMSVMDGV
STIADYLEYADKWGHSAIALTDHLNVQAFPEAAQALSKINKNRDKDNKLKMIYGVEMNML
NNDFWLVKNNQGKQLSQEEFVFFDLETTGLSPEYDEIIEFGAVVYDPKTGETAKIDILIK
PSEPLSAFTTDLTGITDEMLENKPTIQESFGEIMEIIKNKILVAHNANFDLNFLKAWSQK
LGYGPVDNTVIDTLTIARNFYPKIKNHRLGTVAKAVGVLYDERVAHRGDYDAEVLKAVYD
RIVIEVKKQYSLIVDSDWNQIIPENEKENANYIKTRGYHINVLAKNQEGLKDLYKLISHS
HTKNFFGSPKIFKDKILEVRQKNNILIGSGCVNGEIFELARTGLETDLIAAMQNYDYIEV
QPLSVYKNLIQTGDLNQKGLQTIVEKIISLAQSLNKLVVATSDAHYVNPQLKSIREVFIN
SKGLGGSNHPLYDFKQRVTDYPEQHLRTTAEMLEEFEFLNNSKLINDLVITNTNLIAEQI
SSEISPLKSGSYPPKIDNVDKMLKDLCYENARKLYGEQLPEIVAKRLEKELTSIIKHGFA
VVYWISHKLVAQSLEDGYLVGSRGSVGSSFVATTSLITEVNPLKAHYRCPKCKYSDFNTP
LEIKCGYDLPPKPCPKCETPLVGDGHDIPFETFLGFDGDKVPDIDLNFSGEYQARAHNFT
KDMFGENNVFRAGTIATVADKTAYGYVKAYFEKVYGIDNNQRRVEVERIADLATGVKRTT
GQHPGGIVILPAEFEIEDFTPVNYPADDTSSTWLTTHFDFHSIHDNLLKMDILGHVDPTA
LKMLKDLTGVDPIEIPTNDEKVYQLFSGLESLHIKPGEINGETTGAIGIPEFGTQFVRAM
LRETKPQTFADLVQISGLSHGTDVWVNNAQDLIKEKVANISTVIGCRDDIMVYLLSKGLE
PSVAFSIMESVRKGNGIPKPEWVTEMLKNGVPQWYIDSCLKIKYMFPKAHATAYVLMAYR
VAWYKIYYPEEYYATYFSTRADAFDLSTVLLGVNAVKEKLQELETRLSRNELISSKERAL
ITVYEIMLEMFARGVKIKNIDFKSSDASKFKIIVDKKTQEKTIIPPFNVIDSLGEAVAQS
IVLARDERQFTSINDLKNRTQVTKTQIKIFDQLQITNSLENDEQLKFDF
NT seq
4470 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggattcaactctaaaaagtttttttacagcaatgagtgttgagcttcatgaatcacac
aaagagcattttaaaaattctaaaataattggtcgacaaatttttgatgtgaaaaaaaat
cgcgtaacagttaaaattagcattcaaaattttttgcccactgaagttttaaaaacgatt
gaagagcaattattaaataatccagtttgtggtagcaaactggtttttcaagtttctaat
gatgaaatgagtcatgatttagtttgagactactttcaatttataattaaatataaagca
gaatttaagaatggctttgttgaaaatttaagagaaaatgaatttacttttaaaaataat
ataataaatttatgtgttaatgacgaaactgaaaaaaacctttgagaaaaccatttaaac
ttttatattaaaaaatttcaagactatggttttaataacttaaaatttaattttgaagtt
aaaccaagcggagttgatgttattgccaaggctgacgaatcttatgcagaaactaatcaa
aaagttaaaaaaattagagagcaaccaaataacaattttgaatctaaaaaaactgattca
aataatgaagttgttaaggagaagaaaacattttttagaaaaccaaaagctgatttggaa
gttccaacatatcaagaacttggagatattgaggatggagcacagaatgtaattatccat
gctcgaattattaaaaaatcaattaaattttctccaaaaagtggtagaaatatttatact
tttgtaatcacagatgaaacctcgtctttacaagctaatttttttcaaagattagctgga
gttccaaatctttttgatgagattgaaaaagatcaccccgagtatgaaaatatcgttagg
attggtgactgagttgggatgagtggttcactaagatgaaatgagtatagtaaagacaat
gttttttacattgatgaatttaaaaaaatagatcgaattcagaaaactagaatggattta
tcagagacaaaaagggttgaactccatactcattcaaaaatgtcagttatggacggagtt
agtacaattgctgactatttagaatatgctgataagtggggacatagtgcaattgcttta
acagatcacttaaatgttcaagcttttccagaagcggctcaagccctaagtaaaataaat
aaaaatcgcgataaagataataagctaaaaatgatttatggtgttgaaatgaacatgttg
aataatgatttttgactagtcaaaaataatcaaggtaaacaattaagccaagaggaattt
gttttttttgatttagaaacaacaggtctttcaccagaatatgatgaaattatagaattt
ggagctgtagtttacgacccgaaaactggggaaactgctaaaatagatatcttaataaaa
ccctcagaaccactaagcgcattcacaaccgatttaacaggaataacagatgagatgttg
gaaaataagccaacaattcaagaatcatttggggaaattatggaaattatcaaaaataaa
attttagttgcccataatgctaactttgacttgaactttttgaaagcttgatctcaaaaa
ttaggctatggtccagttgataatactgttattgataccttaacgattgctcgtaatttt
tatccaaagattaaaaatcatcgtcttggtacagtggcaaaagcggtcggagttttatat
gatgaaagagttgctcaccgcggggattatgatgcagaggttttaaaagcggtatatgac
agaattgttattgaagttaaaaagcaatatagtttaattgttgatagtgattgaaatcaa
attattcctgaaaatgaaaaagaaaatgctaactatattaaaactcgaggatatcacatt
aacgttttggcgaaaaatcaagagggcttaaaagatttatataaactaatttctcactcc
catacaaaaaacttttttggttcaccaaaaattttcaaagataagattttagaagttcgt
cagaaaaataatatcctaataggctcgggatgtgtaaatggtgaaatttttgaattagct
cgaacagggttggaaactgacttgatcgctgccatgcaaaattatgattatattgaggtt
caacctctaagtgtttataaaaacttgattcagactggggacttaaaccaaaaggggtta
caaactattgttgaaaaaataatttcactagctcaaagtttgaacaaattggttgtggca
accagtgatgctcactacgttaatccgcaattaaaatcaattagagaagtgtttattaac
tccaaaggacttgggggttctaatcatccactttatgatttcaaacaaagagtaactgat
tatccagaacaacatttacgtacaacagcagaaatgctagaagagtttgaatttttaaat
aattcaaaactgataaatgatttagtaattactaatacaaatttaattgcagaacaaata
agttctgaaatttcaccacttaaatcagggagttatccaccaaaaattgacaatgttgat
aaaatgttaaaagatttatgttatgaaaatgcaagaaaattatatggagaacagcttcca
gaaatagttgctaagcgattagaaaaagagttaacaagtattatcaaacatggtttcgcc
gtggtttattgaatttctcataagttggtggctcaaagtttagaagatggatacttagtt
ggttcaaggggttcggttggatctagttttgtggcaacaacaagtttgattaccgaggtt
aatcctttaaaagctcactaccgttgtcctaaatgtaaatactcagatttcaatactcct
ttagaaattaagtgtggttatgatttgccgcctaaaccatgtccaaaatgtgagacacca
ctagttggtgatggtcatgatattccttttgaaactttcctgggttttgatggagataaa
gttccagatatagacttaaacttctcaggagaataccaagctcgtgcccataattttacc
aaagatatgtttggagaaaataatgtttttcgtgctggtaccattgccactgttgctgat
aaaactgcctatggatatgttaaggcttactttgaaaaagtttatggaattgataataat
caacgaagagttgaggttgaaagaattgcagatttagccactggggttaagagaacaact
ggtcagcatcctgggggaattgtaattcttcctgcagagtttgaaattgaagattttact
ccggtaaattatccagctgatgacacgagttcaacttgacttacaacccattttgacttt
cattccattcacgataatttattgaaaatggatattttaggtcatgttgatccgactgct
ttaaaaatgctaaaagatttaaccggagttgatccgattgaaattccaaccaatgatgaa
aaagtttatcaactgttttctggcttggaaagtttgcacattaagccaggagaaataaat
ggggagacaactggggccattggaattccagaatttggaacccagtttgttcgtgctatg
ttaagagaaactaaacctcaaacttttgctgacttagttcaaatttcaggacttagtcac
ggaactgatgtttgagttaacaatgcccaagatttaattaaagaaaaagtggcaaatatt
tcaacagtaattggttgtcgagacgatattatggtttacctattaagtaaaggtctagaa
ccttcggttgcttttagtattatggaaagtgttcgtaagggtaatggaattcctaaacca
gaatgagtgactgaaatgttaaaaaatggtgtcccacaatgatatattgattcttgtcta
aaaattaagtatatgtttcctaaagcacatgcgacagcttatgtattaatggcttatcgt
gtagcttgatataaaatttattatccagaagaatattatgcaacttacttttcaactcgt
gccgatgcctttgatttgtcaacagtgctacttggagtaaatgctgttaaggaaaaactc
caggaattggaaactagattaagtcgtaatgaattaatttcttcaaaagaacgagcttta
attacagtttatgaaataatgttggaaatgtttgctcgaggagtaaagattaaaaatatt
gatttcaaaagcagtgatgcttcaaaattcaaaataattgtcgataaaaaaactcaggaa
aaaacaattattccaccatttaatgtaattgattctttaggggaggctgtggcccaatca
attgttttagccagagatgaacgtcaatttacttctattaatgatttgaaaaatagaact
caagtcactaaaactcaaattaagatttttgatcaattacaaatcactaattctttagaa
aatgatgagcaactaaaatttgacttttaa
DBGET
integrated database retrieval system
