KEGG   Spiroplasma alleghenense: SALLE_v1c07100
Entry
SALLE_v1c07100    CDS       T06597                                 
Symbol
dnaE
Name
(GenBank) DNA polymerase III subunit alpha
  KO
K02337  DNA polymerase III subunit alpha [EC:2.7.7.7]
Organism
salx  Spiroplasma alleghenense
Pathway
salx03030  DNA replication
salx03430  Mismatch repair
salx03440  Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:salx00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09124 Replication and repair
   03030 DNA replication
    SALLE_v1c07100 (dnaE)
   03430 Mismatch repair
    SALLE_v1c07100 (dnaE)
   03440 Homologous recombination
    SALLE_v1c07100 (dnaE)
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03032 DNA replication proteins [BR:salx03032]
    SALLE_v1c07100 (dnaE)
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:salx03400]
    SALLE_v1c07100 (dnaE)
Enzymes [BR:salx01000]
 2. Transferases
  2.7  Transferring phosphorus-containing groups
   2.7.7  Nucleotidyltransferases
    2.7.7.7  DNA-directed DNA polymerase
     SALLE_v1c07100 (dnaE)
DNA replication proteins [BR:salx03032]
 Prokaryotic type
  DNA Replication Elongation Factors
   Elongation factors (bacterial)
    DNA polymerase III holoenzyme
     SALLE_v1c07100 (dnaE)
DNA repair and recombination proteins [BR:salx03400]
 Prokaryotic type
  SSBR (single strand breaks repair)
   MMR (mismatch excision repair)
    DNA polymerase III holoenzyme
     SALLE_v1c07100 (dnaE)
SSDB
Motif
Pfam: DNA_pol3_alpha DNA_pol3_finger PHP HHH_6 tRNA_anti-codon Zw10_N tRNA_anti_2 HROB
Other DBs
NCBI-ProteinID: AXK51380
UniProt: A0A345Z451
LinkDB
Position
complement(821334..824366)
AA seq 1010 aa
MYSPLLNVRSCFNFQDSLITIDEYLDFAKKEGFQFAIYNDIETLYGLADFVKAAEKRNLK
PIVGITINFLIDNNSFSINFYAKNLQGYQTISKFSSMIMCHEFKNDIEKWDFILENINKN
LIAVISFNNLFNHEIFKKLESKFESEKIFIGVNVNSNEIDYQFKSRVIFNQEIKYLDKRD
FASFKILKAIKENIRINEQSEIQNNYFYYSDEELDVFLELDVHKKNINYIFENCNFNLFD
NPQRHLIKYPNTKNIPSDNYLRLICEQSLTGYFKNFKKMPGIPQIYLERLEAELNTIFKM
GFSDYFLVVYDFVRKAKELEILVGPGRGSAVGSLVSFLLQITTVDPLEYGLIFERFLNPE
RISLPDIDIDFQDDRRDEVIEYIFEKYGRFNVATITTYQTIGTKNALRDCARVFGITPDE
INEITKPIGNEFLRDLDGAIEKFPKLKIFLKNNQQIYTVAKKIIGLPRQTGTHAAGLVFC
DIDLRDVVPLKVGYNGINQTQFSMNYLEDLGLIKIDLLGLRNLTTLNNILKAVSRNRKIN
TSLSRIPVNDYPTFTSLQEGKTTGIFQLESGGMTDTIIKMKVSSINDIAAASALFRPGPQ
ENIPEYIKRKNSGGKFEILDESLKTILEPTFGIIVYQEQVIQILQTVAGFSLAKADIVRR
AMGKKDLQLMKKEQEDFVEGAISKGYTIEKAKQIWMWILKFANYGFNKSHAIAYSYIGYW
LAYLKQNYTAEFYCELLNSAVGNDAKTAKYLEEARALGIKVIPPNVKNVNLNYFGNEVGI
YLPLILVKQVGIEFIKNLAELKEIDKTAFLDLFNFCSKTFKRGLNKTTFSNLVKSGAMDI
FGFTRETLLENQDKILLFADLNQNIEKINPFTFPQLEIKPDSEIKKSFYELDSLGFYFTS
HPLQIIRNQLANSDRLSFIKDLTKPEMKSPILFVINDFRIHLDKNNNEMVFLDVSDETGH
IDITIFSSVYNKFKDQLNQGDILIGEIKTQLYNGKISGVLNQVLKSFATT
NT seq 3033 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgtactcaccgttactaaatgtcagaagttgttttaatttccaagactctttaataaca
attgatgaatacttggattttgctaaaaaagagggattccaattcgctatctacaacgat
attgaaactctttatggtcttgctgattttgttaaagccgcagaaaaaagaaacttaaaa
cctattgttggaataacaataaattttttaattgataataatagtttctcaattaacttt
tatgcaaaaaatttacaaggatatcaaactatttcaaaattcagttcaatgataatgtgt
cacgaatttaaaaatgacatagaaaagtgagattttatcttagaaaacataaataaaaat
ttaattgcagtaataagttttaataacttatttaatcatgaaatttttaaaaaattagaa
tcaaagtttgaatcagaaaaaatatttattggtgtgaatgtgaattcaaacgaaattgat
tatcaatttaaatccagagttatttttaaccaagaaataaaatatttagacaaaagagat
tttgcttcttttaaaattttaaaagcaattaaagaaaatattaggattaatgaacaaagt
gaaatccaaaataattatttttattatagtgatgaagaattggatgtatttttggaactt
gatgtccataaaaagaacataaattatatttttgaaaattgtaattttaatttattcgat
aacccacaaagacatttgattaaatacccaaataccaaaaatatcccatcagataattat
ttgagattaatttgtgaacaaagtttaacaggctactttaaaaattttaagaaaatgcct
ggaattccacaaatatatttggaacgtcttgaagcggagttgaataccatttttaaaatg
ggattttctgactactttttagttgtttatgactttgtaagaaaagctaaggaattagaa
attttagtaggaccagggagaggtagtgctgtgggttctttagtttcatttttattacaa
attactacagttgatccacttgaatacggtttaatttttgaaagatttttaaatccagag
agaatttcgcttcctgatatcgatattgatttccaagatgaccgccgtgatgaagttatt
gaatacatttttgaaaaatatggacgttttaatgtcgcaacaattacaacttatcaaaca
attggtaccaaaaatgccttaagagattgtgccagagtttttggtataacaccagatgaa
attaacgaaattaccaaaccaattggtaatgagtttttaagggacttggatggcgcgatt
gaaaagtttcctaagttaaaaatatttttaaaaaataatcaacaaatttatacggttgcc
aaaaaaattataggacttccacgtcaaacgggtactcatgcggcgggattagttttttgt
gatattgatttacgtgatgtggtaccactaaaagttggctataacggaattaatcagact
caattttcgatgaattatttagaagacctaggtttaattaaaattgatttattaggatta
agaaatttaacaactttaaataatattttgaaagccgtttcaagaaaccgtaagataaat
actagtttatctagaatccccgtaaatgattatcctacatttacaagtcttcaagaaggt
aaaaccacaggtatattccaactagaatcggggggaatgacggacacaattattaaaatg
aaagtgtcatcaattaatgatattgctgctgcttcagctctttttcgacctggtcctcaa
gaaaatattcctgaatatattaaaaggaaaaattctgggggaaaatttgaaattctagat
gagagtttaaaaactattcttgaaccaacatttggaataattgtttatcaagaacaagtt
attcaaatcctacaaacagtagcaggatttagtttagcaaaagcagatattgtaagaagg
gcaatgggtaaaaaagatcttcagttaatgaaaaaagagcaagaagattttgttgagggc
gcaattagcaaaggctatactattgaaaaagccaagcaaatttgaatgtgaattttaaaa
ttcgcaaattatggattcaataagtctcatgcaatcgcgtactcttacattggttactgg
ctggcatatttaaaacaaaattatacagcagagttttattgtgaattattgaactcagct
gttggaaacgatgctaaaactgccaagtatttagaagaagctagggcattggggataaag
gttatccctccaaatgttaaaaatgttaatttaaattattttggaaatgaagtgggaata
tacttgccgttaattttagtaaaacaagttggaatagaattcattaaaaatttggcggaa
ttgaaggaaatagacaaaacagcattccttgatttatttaatttttgttctaaaacattt
aaaagaggtttaaacaaaactaccttttcaaatcttgtaaaatctggggcaatggatatc
tttggatttacacgcgaaaccttgcttgaaaatcaggataaaattcttttatttgctgat
ttaaatcaaaatatcgaaaaaattaatccttttactttcccgcagctggaaattaaacct
gattcagaaattaaaaagtctttttatgaattagactcgttaggattttattttacttca
cacccattacaaattattagaaatcagttggcaaactctgatcgattaagttttattaag
gatttaacaaaaccagaaatgaaaagcccgattttatttgtaattaatgattttagaatt
catttagataaaaataataatgaaatggtctttttggatgtttcagatgaaaccggacat
attgatataactattttttcttcggtttataacaaatttaaagaccaattgaatcaaggt
gatattttaattggagaaattaagacacaactttataacggtaaaatttcaggagtgctt
aaccaggtattaaaaagttttgctacaacctaa

DBGET integrated database retrieval system