Spiroplasma apis: SAPIS_v1c04170
Help
Entry
SAPIS_v1c04170 CDS
T02945
Symbol
secDF
Name
(GenBank) bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF
KO
K12257
SecD/SecF fusion protein
Organism
sapi
Spiroplasma apis
Pathway
sapi02024
Quorum sensing
sapi03060
Protein export
sapi03070
Bacterial secretion system
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
sapi00001
]
09120 Genetic Information Processing
09123 Folding, sorting and degradation
03060 Protein export
SAPIS_v1c04170 (secDF)
09130 Environmental Information Processing
09131 Membrane transport
03070 Bacterial secretion system
SAPIS_v1c04170 (secDF)
09140 Cellular Processes
09145 Cellular community - prokaryotes
02024 Quorum sensing
SAPIS_v1c04170 (secDF)
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02044 Secretion system [BR:
sapi02044
]
SAPIS_v1c04170 (secDF)
Secretion system [BR:
sapi02044
]
Sec (secretion) system
Prokaryotic Sec-SRP core components
SAPIS_v1c04170 (secDF)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SecD_SecF_C
Exonuc_VII_L
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AHB36263
UniProt:
V5RIG5
LinkDB
All DBs
Position
478537..482442
Genome browser
AA seq
1301 aa
AA seq
DB search
MVKVKKNQKTNQKNINKNVFRFLTIFLLLCSLALGILFSTWRFSKDYKLGNDFRGYYSAL
VSVDNVNNEKKANNQPNGDAKEAAKVLEQRLNPMGTNQIIIETAGLNYLKVLSPIEAYKN
KIVFQNQIQRKGGAILLNEEYKDLQFKDQERTGINDFFSSAKSTSITTARGKNPAVSFEL
KGSNFSSLFKAEEGQTSAKLKMSVLIDADGFYNDIRNFYNLVEADKNEEKVNLYFEQIIE
PFRNIYNNSETNAKAKLILADFFKGRYTITTSGNNKSYSYVNLLDKNFERKTFLDHFSDF
EFLSDTSGYVYDPNAKTDDFKEGGKYAEEVIGYSISSGNDRSTKLGKVNELFNEFNPVMA
KFLNTNANSLNKKIYNSLTNYFLFDGTASNSGRLNEASTSVNGAYGYIKDNHFITEYPKD
PESKAKMGASVFNASTKGFVFTVNEISEISGSITSLMLSFAIIFMGVIALALMIYIAFLY
RVLGIFMIAIILAITGLTLLSTTWFGLTLGPETIIGIILIIALNLEIFVLIFENVKYNIF
NKQRGVKTSFNISIKENLGIAIDVIVALIVPSICLFWITSNALQSFAIIISMGMAFSILL
TVLFAVILFKMLINTNIFNNNLWLFALNTSFAKNGRPVLNYKIYTLKNKIQKLDYATIND
KKIEVLERQKSSLNDSVHSLSSKSQKATLKKIEKIEKKLLNLKSFKIDSKDIDKRKTLQA
KLATLETKLAQKEQKHEELHVLKAEKIKEKLNKKINKKITKIKTKISKLDQEKYITKINK
LNLAIEELNYVLNDNTETIIEQESEIVTSTKEKLKVKTYEKVIKHGSKLLAFILIILTSI
AALVGGLWGPNYDATFGNRTEYTIWGSNIDEFYQNIEAVSNKDEPNNELINIAKNTVKNF
NDFEIENPTLEPSSSKRQLKKTQLVSNFIYTVFLDKEYVNYLANTTNAITTYVNHNHSVS
YGSKFEYNSKTSDEENYPWISLSVATTNSEQSSIAKNVFQRMGINITNAREDRGFISKRI
RPATMLWMSFQMLWTVLAIILGLLIYILIRFKWTYYIAMIVAIILTPAITLGAIVALQIP
LGMSSLISIVASISFVCMALFIIFGKARSLIVSKDEKSLNEYFKKEIEYSFNTKSEKKRI
KDELFLIKADLKLALKSKDLTVKEKRELYAQFSKTKQEKYLAFKDIKKENKIKISRVAKE
NNYLKEVMVQTFRFGVKRTYLIGSVYIAVALLLAMTLSPLLAFGISLIIGILSSALVVLF
VAIPIWIGLEQLRIRNHLSRKHFINNLKVSGEEQIIEGIND
NT seq
3906 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtggtcaaagtgaaaaaaaatcaaaaaacaaatcaaaaaaatattaataaaaatgttttt
aggtttttaacaattttcttattattatgttcattagcacttggaattttatttagtaca
tgacgtttttcaaaagattacaagctaggtaatgactttaggggttattattcagcattg
gtttcagttgataacgtaaataatgaaaaaaaagccaataaccaacctaatggtgatgca
aaagaggcagccaaggtattagaacaaagattaaaccctatgggtacaaatcaaataata
attgaaactgctggtttgaattatttaaaagttttgtcaccaatagaagcatataaaaac
aaaattgttttccaaaatcaaattcaaagaaagggtggagccatccttttaaatgaagag
tacaaagatttacaattcaaagatcaagagagaactggaattaatgactttttctcaagt
gctaaatctacttctataactacagctagaggtaaaaacccagctgtgtcatttgaatta
aaaggttcaaacttttcttctttatttaaagcagaagaaggtcaaacatctgctaagtta
aaaatgtcagtattaattgatgctgatggtttttataatgatattagaaacttctataat
ttagttgaggctgataaaaatgaagaaaaagtaaatctttacttcgaacaaataatcgaa
ccatttagaaatatttataataatagcgaaacaaatgctaaagctaagctgatattagct
gacttttttaaaggtcgttatacaattacaacttctggtaataataaatcttattcttat
gttaatttacttgacaaaaattttgaaagaaaaacatttttagaccactttagtgatttt
gaatttctatcagatacttctgggtatgtttatgatcccaatgctaagactgatgatttc
aaagaaggtggaaaatatgccgaagaagttattggttattcaatatcaagcggtaatgac
cgcagtacaaaattaggtaaagtaaatgaattattcaatgagtttaaccctgttatggct
aagtttcttaatacaaatgctaactcattgaataaaaagatttataattctttaacaaat
tacttcttatttgatggtactgcttcaaatagtggaagattaaatgaagcttctacatca
gttaatggtgcttatggttatataaaagataatcattttattacagagtaccctaaagat
cctgaatctaaagctaaaatgggtgcatctgtatttaacgcttctacaaaaggttttgtt
ttcacagtaaacgaaatttcagaaatatctggttcaattactagtttaatgctttcattc
gctattatatttatgggtgttatcgccttagcattgatgatttatatagcctttttatat
agggtattaggtattttcatgattgcaataatattagcgattacaggccttacattgtta
tctactacttgatttggactaactttaggacctgaaacaatcattggaataattttaatt
atcgctctcaaccttgaaatatttgtccttatatttgaaaatgttaagtacaatattttc
aataaacaaaggggagtcaagacaagtttcaacatttcaattaaagaaaaccttggtatt
gccattgatgttatagttgccctaattgtgccaagtatttgtttattttgaattacttct
aacgcacttcagtcatttgcaataataatttcaatgggaatggctttctcaatattgttg
acagttttatttgctgtaatcttattcaaaatgttaataaatacaaatatcttcaataat
aatctatgattatttgcattaaacactagtttcgccaaaaatggtagaccagtgttaaat
tacaaaatatacactttgaaaaataaaattcaaaaactagattatgcaacaattaatgat
aaaaaaattgaagttttagaaagacaaaagtcttctttaaatgactcagttcattcattg
tcaagtaaaagtcaaaaagctacgcttaaaaaaatagagaaaatagagaagaaattatta
aatctaaagagtttcaaaatagattcaaaagatattgataaaagaaaaactttacaagct
aaattagcaactttagaaactaaattagcacaaaaagaacagaaacacgaagaactgcat
gtgttaaaagctgaaaaaataaaagagaaacttaacaaaaaaataaacaaaaaaataact
aaaatcaaaactaaaatctctaagttagatcaagaaaaatatattactaagataaataaa
ttaaatttagctatcgaagaactaaattatgttttgaacgataatacagaaacaattatc
gagcaagaaagtgaaatagttacttcaactaaagaaaagttgaaagtaaaaacttatgaa
aaggttattaaacacggatctaaactactcgcatttattttaattattttaacttcaata
gcagccttggttggtggtttatgaggacctaattacgacgcaacatttggtaacagaacc
gagtatacaatttgaggaagtaacattgatgagttctatcaaaatatcgaagcggtatct
aataaagatgaaccgaataatgaattaataaatattgcgaaaaacacagttaaaaacttc
aatgattttgaaattgagaatcctactctagaacctagttcatctaaaagacaacttaag
aaaactcaattagtaagtaatttcatatatacagtatttcttgacaaagaatatgtaaat
tatctagcgaatactacaaatgcgataactacatatgttaatcataatcatagtgtctca
tatggttctaaatttgaatataattctaaaacatctgatgaagaaaattatccatgaatt
tctttatcagtagcaacaactaactcagagcaatcatcaattgctaaaaacgttttccaa
agaatgggaattaacatcacgaacgctcgtgaagacagagggtttatttcaaaaagaatt
agaccagctactatgctatgaatgtcattccaaatgctatgaacagttctagctattata
ttaggcttattaatttatatattgataagattcaaatgaacatactatattgcgatgatt
gtggcaatcatattaactcctgcaattacccttggtgctattgttgcattacaaatacca
ttaggaatgagctcattaatatctattgttgcttctatctcatttgtatgtatggcatta
tttataatttttggaaaagcaaggtcattaattgtttcaaaagatgaaaagagtttaaat
gaatacttcaaaaaagaaattgaatattcattcaacactaaatcagaaaaaaaacgtatc
aaggatgaacttttcttaattaaagcagatcttaaattagcactcaaaagtaaagattta
actgttaaagaaaaaagagaactgtatgcacagttcagtaagacaaaacaagaaaaatat
ttagcatttaaagatatcaaaaaagaaaacaaaatcaaaatttctagagtagcaaaagag
aataattaccttaaagaagtgatggttcaaacatttaggtttggtgttaaaagaacttat
ttaattggatcggtatatatagctgttgccttactattggcgatgacactatcaccacta
ttagcatttggtatcagtttaattataggtatattatcatcagcattagttgtattattt
gtagcaataccaatatgaattggtttagaacaattaagaattagaaatcatctttcaaga
aaacacttcatcaacaaccttaaagtttctggtgaagagcaaattattgaaggtataaat
gattaa
DBGET
integrated database retrieval system
