Silvanigrella aquatica: AXG55_02235 Help Entry AXG55_02235       CDS       T09772                                  Name (GenBank) hypothetical protein   KO K07012   CRISPR-associated endonuclease/helicase Cas3 [EC:3.1.-.- 5.6.2.4] Organism saqi  Silvanigrella aquatica Brite KEGG Orthology (KO) [BR:saqi00001]  09180 Brite Hierarchies   09183 Protein families: signaling and cellular processes    02048 Prokaryotic defense system [BR:saqi02048]     AXG55_02235 Enzymes [BR:saqi01000]  5. Isomerases   5.6  Isomerases altering macromolecular conformation    5.6.2  Enzymes altering nucleic acid conformation     5.6.2.4  DNA 3'-5' helicase      AXG55_02235 Prokaryotic defense system [BR:saqi02048]  CRISPR-Cas system   Type I CRISPR-Cas system    Type I signiture cas proteins     AXG55_02235 BRITE hierarchy SSDB OrthologParalogGene clusterGFIT Motif Pfam:  Cas3-like_C_2 Cas3_HD DEAD Helicase_C Motif Other DBs NCBI-ProteinID:  APJ02805 UniProt:  A0A1L4CXY5 LinkDB All DBs Position complement(509281..512223) Genome browser AA seq 980 aa AA seqDB search MVQLERDLFLGCAKKNSDKEFHGILYHLLDAGACCLEIISKEKFLVNLIAPFLMNKYNYN VASRILSFFTAVHDLGKLSPVFQAFILKNEPHSFFYKQWQSSYKYWNDINKFILRNKDNF HHGYISTQSLLNYFYKKCDKLNIKSAITRFLVAIGHHHDKFHSKNSLDSLHYFNEIRYFD INESYCGLKNWELLRENFIDEIWRIIVGDFLHMDQFIDDFHSDNHELTNNYEVIFAGLAC VSDWIASNENFFPYEAVVKNSDEIKNYFFDRRSRAQEVLQDKLYWGSEKCRYFKQHSFKN IFGFNPRSFQEQVFELVKQCQNPSLTIIEAPMGLGKTEAALSFLMSPYAQQSRGLYFALP TQATSNQMFTRINTILEKLFELHGQKVQLQILHSNKNWNDTNIELMKNYYKNDKPLSSVT DDTSSTYDNDTYDDINSNKSTLSSPWYENSRTGLLAEFGVGTIDQVLNCVFINSKHYFVK LFGLAGKTIILDEIHAYDAYMDEAICKLLQWLGHNQCQIILLSATLPKDKRDKFLTAFNN KQKIISSENGFPRITNVSWNKSDSFKEIIASSIDTQNKKTPTKLFAIANFKEIVAIVKNN IKKINNQYYGNIGIVCNTVNTAQKLFEEFLNDDFSKEDLLLFHARFSLNLKTEKESFIKE SLGKEQFRNHINNLKSSRPKFKIIIATQVIEQSLDIDFDYMYSFLCPIDLLLQRMGRHFR RCRWDLETAIPLEPTQFGIFHEACDDSHLPLFELCRGTKNVYFESVLLKSYLVLKDFLSK NNNIIDDICDLEFLVQSVYSNSSEQFSKKRIIESEKEMFANNVSTAKKALSVTIDSPMHK KNYHNWFMNLFFEREDKVGNSNLPQTRLFNKTEQLILIIKHNNKNYTLNYHNKLVELPHL FTEEKEEIINILHCQITVPFYVTKDLNNSDVENLDSHKVLKHYKILNMEWNGKYAVKNLE NTEIRYCSHYGFKYTKNKKS NT seq 2943 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt atggtgcaacttgaaagagatttatttttaggatgcgcaaaaaaaaattcagacaaagaa tttcatgggattttataccatttacttgatgctggggcatgttgtctagaaattataagc aaggaaaaatttttagttaatctcatagctcccttcctaatgaataaatataactataac gtcgccagtcgaatattaagcttttttaccgctgtacatgatttaggtaaactctcgcct gtttttcaagcatttattttaaaaaatgagcctcatagttttttttacaagcaatggcaa tccagttataaatactggaatgatataaataaatttattctgcggaataaagacaatttt catcatggctatataagtactcaatcattattaaattatttttataaaaaatgtgataaa ttaaatattaaaagtgcgattacaagatttttagttgcaataggacatcaccatgacaaa tttcatagtaaaaactcattagattctttacattattttaacgaaataagatatttcgat ataaatgaatcctattgtggtttaaaaaattgggaattattacgagaaaattttattgat gaaatatggagaattatcgttggtgattttcttcacatggatcaatttattgacgatttt cattcggataatcatgaattaacaaataattatgaagttatttttgcagggcttgcctgt gtgtctgattggatagcttctaatgaaaattttttcccctatgaagccgttgttaaaaat tctgatgaaataaaaaattatttttttgatagaagatcacgagcacaagaagttttacaa gataaactttattggggatctgaaaaatgccgatactttaaacagcacagttttaaaaac atttttggctttaacccgcgttcgtttcaagaacaagtgtttgaacttgtcaaacagtgc caaaaccccagtctaaccattattgaagctcccatgggactgggaaaaacagaagcagct ctttcatttttaatgtctccctatgcacagcagagtcgcggactttattttgcattgcca actcaagcaaccagcaatcaaatgtttacaagaattaatacaattttagaaaagcttttt gaattgcatggacaaaaagtacaactccaaattttacattcaaataaaaattggaatgat accaatattgaattgatgaaaaattattataaaaacgataagcctttatcatcagtaacc gatgatacttcctctacctatgacaatgatacttacgatgatatcaattcaaataaatcg acactttcaagcccttggtacgagaactccaggacgggattactagctgaatttggagtt ggcacaattgaccaggttttaaattgtgtttttatcaattcaaaacattattttgttaag ttatttggcttagcaggtaaaacaattattctcgatgagattcatgcttatgatgcctat atggatgaagcaatatgcaagttgttacaatggttaggccataatcaatgtcaaattatt cttctttcagcaactctgccaaaggataagagagataaatttttaacagcatttaacaat aaacaaaaaattatttctagcgaaaatggttttccaagaataacaaatgtaagctggaat aaatcagattcatttaaggaaattattgcttcttcaatagatactcaaaataaaaaaact ccgacaaaattgtttgcaattgcaaattttaaagagattgtagccatagtaaaaaataat attaaaaaaatcaataatcagtattatggtaatataggaattgtttgcaacactgtaaat acagcgcaaaagctttttgaagaatttttaaatgacgacttttctaaagaagaccttcta ctttttcatgcccgattttcattaaatttaaaaacagaaaaagagtcctttataaaagaa agtcttggcaaagaacaatttagaaatcacataaacaatctaaaaagttcaagaccaaaa ttcaaaattattatagccactcaggtcattgaacaaagtttagatattgattttgattat atgtattccttcctctgccctatcgatttactattacaaagaatgggtcggcattttaga cgatgccgttgggatttagaaacagcaataccattagagccaactcaattcggaattttt catgaagcctgtgatgactcccatttgcccctttttgagctttgcagagggacaaaaaat gtttactttgaatctgtattattaaaatcatatttagttttaaaagattttttatctaaa aacaataatattattgatgacatttgtgatttagagtttctagttcaaagtgtttattcc aatagttcagagcaattttcaaagaaaagaattatagagtcagaaaaggaaatgtttgct aataatgtaagtactgcaaaaaaagctttatcagtcactattgattctcccatgcataaa aaaaattatcataattggtttatgaacttattttttgaaagagaagacaaagtaggaaat tctaatttaccacaaacacgattgtttaacaaaacagaacaacttatattaattattaag cataataataaaaattacactttaaactatcataataaacttgttgaattgcctcattta tttacagaagagaaggaggaaataataaatattttacattgtcaaattacagttcctttc tatgtaacaaaagatttaaataattccgatgttgaaaatttagattcacacaaagtatta aaacattataaaatattaaatatggagtggaatggtaaatatgcagttaaaaaccttgaa aatactgagataagatactgttcacattacggctttaaatacactaaaaataaaaagagt taa

DBGET integrated database retrieval system