Sulfurimonas aquatica: GJV85_00370
Help
Entry
GJV85_00370 CDS
T08902
Name
(GenBank) PAS domain S-box protein
Organism
saqt
Sulfurimonas aquatica
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HATPase_c
PAS_9
PAS
Response_reg
HisKA
PAS_3
PAS_4
dCache_1
PAS_8
HAMP
HATPase_c_5
PAS_12
Diguanyl_cycl_sensor
HATPase_c_2
HATPase_c_3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QSZ40633
UniProt:
A0A975AY13
LinkDB
All DBs
Position
81034..84204
Genome browser
AA seq
1056 aa
AA seq
DB search
MNLNKLKTLSTSIFISFLIISIIPLSIVSWISYSDSVKNIEQLKKNKLENRAAQNVDFIT
SLFKNTKENLLSWAGYEGTQEFMQKLNSEVFQSKLTAKEFVLSDKYKSMKQIKENTLKQL
NESYDYIYDTFLIDTAGNILYTVKRESDLGENLSTGIYSSTLFAQVFRASRRDKKTYFSD
IERYTPSGGDIAGFICTPMITNAGKVIGYIAVQIDLASMFNRFRNIKDEESGIKHYLVGS
DSLLRTSLNNHDEVLKRAINTEQFWLWYNKYGIEKNKNPKMKEELLSYMGPDGTKVLGLY
YPISILGKNWVHISEIDASLFYKDSHELMKNILGLMILTVLLIVVLSLWIAKRITSPIAY
LNNQAHRYIKGEKSVSLLLNSKDEIGQLSDTFHTMMKQQQEHEKELERLLESLKFQKFAL
DVHAIVAITNTQGDILYANKQFEEISGYTQNELLGANHRILNSGHHPLSFWKEMYEEIKN
GNIWHGVVKNRAKDGSYYWVDTTVLPFMGSNSKVEQYIAIRTDITHQKEIEKNILENANL
QNAMFDNAGISIIITDTQGLIQSFNKEAENLLGYKAEELVGKETLAIFHKVNEIVSMSKQ
LSKCFGVEIEPGFGVFVEEANRGLASIHEWTYVHKDSSEFPVTIAVTAFYGESNAILGYV
GMVHDIRLFKEAQQKIIDAKDAAESSERAKSEFLASMSHELRTPLTAILGFTNILESKVT
DETHLSYAKHIASSSQQLLTLVNDILDISKIQSGKFRISPYSFHAHSEFTKLSLGLESLV
EKKKLHFEKDFDESIKLVLYGDLTRINQVITNLLSNAIKFTPQKGSIGLAIHYSDGKLIV
EVRDTGIGMNEDALSRIFKPFEQADGSTTRKYGGSGLGLTIVQKIIELMDGRLETKSKEG
EGTTFKVTLPIPLSDEEIEEDSTEEGNQNSKFQGNILVAEDNKTNQILIRLLLEERGLCC
DFADNGQIVVEMYDPRKYDLLFMDENMTLMNGTEAFKIIKNRYKDKCGPIVALTANAISG
DREKFISIGMDDYISKPIDEQRLYEVLSRYTTVMKF
NT seq
3171 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgaatttaaataaattaaaaaccttatctacgtctatctttatatcgtttttaataatt
tctatcatccccttaagtatagtctcttggatttcatatagcgattctgtaaaaaatata
gagcaattaaaaaaaaataagctagaaaacagagccgcccaaaacgtcgactttataaca
agcctttttaaaaatacaaaagaaaacttactctcatgggcagggtatgagggtactcaa
gagtttatgcaaaagcttaatagtgaagtttttcaaagtaaactaacagctaaagagttt
gttttaagcgataagtataagagtatgaaacagatcaaagagaatacgctaaagcaactc
aatgaaagttatgactatatatatgatacctttttaatagacactgcaggaaacatccta
tacacagtcaaaagagagagcgatcttggggaaaacttaagtacggggatttactctagt
acgctttttgcacaggtatttcgggcttcaagaagggataaaaaaacatacttttccgat
attgagcgttacacaccgagtggtggagatatagctggctttatctgtacacctatgata
actaacgcagggaaggttattggctacatagctgtgcagatagatctggcctctatgttt
aacaggtttcgtaacataaaagatgaagagagtgggataaaacactacctagttggttca
gactctctcttgcgtacaagtttaaacaatcatgatgaagttttaaaacgagctataaat
acagagcagttttggttatggtataacaagtacggcattgaaaaaaacaaaaatccaaag
atgaaagaagagcttctctcctacatgggcccagatgggacaaaggttttgggtctatat
tatccaatcagtatacttgggaaaaactgggttcacattagtgagattgatgcaagtctg
ttttataaagattctcatgagttgatgaaaaacattttaggacttatgatacttactgtt
ttgcttattgttgtgttgtctttatggatagctaaacgcataacgtctcccatagcctat
ctaaacaaccaagcacacagatatataaagggtgaaaagtctgttagtctactacttaac
tctaaagatgagattggacagctttcagatacttttcacaccatgatgaagcaacaacaa
gagcatgagaaggagcttgaaagattacttgagagtttaaaatttcaaaagtttgctcta
gatgtacatgctatagttgctataacaaacacacagggcgatattctctatgctaacaaa
cagtttgaagagattagcggttatactcaaaatgaacttcttggagcaaaccatagaatt
ctcaactctggacaccatccattaagcttttggaaagagatgtatgaagagattaaaaat
ggaaatatttggcatggcgttgttaaaaacagagctaaagatggaagttactattgggta
gatacaacggttcttccatttatgggaagtaattctaaagtagagcagtatattgccatt
aggacagatataacgcaccaaaaagagatagaaaaaaatattttagagaacgcaaactta
caaaacgccatgtttgataatgctggaataagcatcattattacagatacacaaggatta
atccaatcctttaacaaagaagcggaaaatctacttggttacaaagcagaggagcttgta
ggtaaagaaactctcgctatttttcataaggtgaacgagattgtctccatgtcaaaacaa
ctctctaaatgctttggagtagagatagaacccggttttggtgtttttgtagaagaagca
aacagagggcttgctagcatacatgagtggacatatgtacataaagatagtagtgagttt
cctgttaccatagctgtcacagctttttatggagagagtaatgccatacttggttatgtg
gggatggttcacgatataagactctttaaagaggcacaacagaagattatagatgctaaa
gatgcagcagagtcgtcagagagagccaagtcggagtttttagcgtctatgagtcatgaa
cttcgaactcctctaacagctattttaggctttacgaatatactggagtctaaagtcaca
gatgagacccatctctcttatgctaagcatatcgcttcaagttctcagcagctgcttacc
ttagtaaatgacatcttagatatctcaaaaattcaaagtggaaaatttagaatctctcca
tatagttttcatgctcactcagagtttacaaagctatcgctaggactagaatctttagta
gagaagaaaaagttgcactttgaaaaagatttcgatgagagtataaagttagttctttat
ggagacctcacaagaataaatcaggttataaccaacttactctcaaacgcgatcaagttt
acacctcaaaagggcagtattggcttagctattcattactccgatggcaaattaatagta
gaagtcagagataccggcataggtatgaatgaagacgccctaagtagaatctttaagcct
tttgagcaagcggatggaagcacaacaagaaagtatggaggaagcggtcttggcttgacc
atcgtacaaaaaataatagagttaatggatggcagattagagactaagagtaaagaggga
gaaggaacaactttcaaagtaacacttcccatccctttaagtgatgaagagatagaagaa
gatagtactgaagaagggaatcaaaacagtaaatttcaaggaaacatcctcgtagcggag
gacaataaaacaaatcagattttaatacggctacttctagaggagagaggtctctgctgc
gattttgcagataatgggcaaattgtagtagagatgtatgatcctcggaagtatgattta
ctttttatggatgagaatatgacactaatgaatggtacagaggcatttaaaattattaaa
aacagatataaagataagtgcggtcctattgttgcactgactgcaaatgcaatctctggg
gatagagagaagtttataagtattgggatggatgattatatctctaagcctatagatgag
cagagactctatgaagttttgagtagatatacgactgttatgaaattctaa
DBGET
integrated database retrieval system