Sulfurimonas aquatica: GJV85_03115
Help
Entry
GJV85_03115 CDS
T08902
Name
(GenBank) Ig-like domain-containing protein
Organism
saqt
Sulfurimonas aquatica
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Big_9
Cadherin_4
Cadherin_5
VWA_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QSZ41142
UniProt:
A0A975AYX3
LinkDB
All DBs
Position
650134..660627
Genome browser
AA seq
3497 aa
AA seq
DB search
MTDNGTNLVFSIDVAGSDLAADGDRTIDASVTTTDAAGNTATATDTEDYTVDTAITASIT
LDTEITADDVINAAESGQNIAITGVVGGDVQVGDTVTLVINNVTSTGLVTDNGTNLVFSI
DVAGSDLAADGDRTIDASVTTTDAAGNTATATDTEDYTVDTAITASITLDTEITADDVIN
AAESGQNIAITGVVGGDVQVGDTVTLVINNVTSTGLVTDNGTNLVFSIDVAGSDLAADGD
RTIDASVTTTDAAGNTATATDTEDYTVDTAITASITLDTEITADDVINAAESGQNIAITG
VVGGDVQVGDTVTLVINNVTSTGLVTDNGTNLVFSIDVAGSDLAADGDRTIDASVTTTDA
AGNTATATDTEDYTVDTAITASITLDTEITADDVINAAESGQNIAITGVVGGDVQVGDTV
TLVINNVTSTGLVTDNGTNLVFSIDVAGSDLAADGDRTIDASVTTTDAAGNTATATDTED
YTVDTAITASITLDTEITADDVINAAESGQNIAITGVVGGDVQVGDTVTLVINNVTSTGL
VTDNGTNLVFSIDVAGSDLAADGDRTIDASVTTTDAAGNTATATDTEDYTVDTAITASIT
LDTEITADDVINAAESGQNIAITGVVGGDVQVGDTVTLVINNVTSTGLVTDNGTNLVFSI
DVAGSDLAADGDRTIDASVTTTDAAGNTATATDTEDYTVDTAITASITLDTEITADDVIN
AAESGQNIAITGVVGGDVQVGDTVTLVINNVTSTGLVTDNGTNLVFSIDVAGSDLAADGD
RTIDASVTTTDAAGNTATATDTEDYTVDTAITASITLDTEITADDVINAAESGQNIAITG
VVGGDVQVGDTVTLVINNVTSTGLVTDNGTNLVFSIDVAGSDLAADGDRTIDASVTTTDA
AGNTATATDTEDYTVDTAITASITLDTEITADDVINAAESGQNIAITGVVGGDVQVGDTV
TLVINNVTSTGLVTDNGTNLVFSIDVAGSDLAADGDRTIDASVTTTDAAGNTATATDTED
YTVDTAITASITLDTEITADDVINAAESGQNIAITGVVGGDVQVGDTVTLVINNVTSTGL
VTDNGTNLVFSIDVAGSDLAADGDRTIDASVTTTDAAGNTATATDTEDYTVDTAITASIT
LDTEITADDVINAAESGQNIAITGVVGGDVQVGDTVTLVINNVTSTGLVTDNGTNLVFSI
DVAGSDLAADGDRTIDASVTTTDAAGNTATATDTEDYTVDTAITASITLDTEITADDVIN
AAESGQNIAITGVVGGDVQVGDTVTLVINNVTSTGLVTDNGTNLVFSIDVAGSDLAADGD
RTIDASVTTTDAAGNTATATDTEDYTVDTAITASITLDTEITADDVINAAESGQNIAITG
VVGGDVQVGDTVTLVINNVTSTGLVTDNGTNLVFSIDVAGSDLAADGDRTIDASVTTTDA
AGNTATATDTEDYTVDTAITASITLDTEITADDVINAAESGQNIAITGVVGGDVQVGDTV
TLVINNVTSTGLVTDNGTNLVFSIDVAGSDLAADGDRTIDASVTTTDAAGNTATATDTED
YTVDTAITASITLDTEITADDVINAAESGQNIAITGVVGGDVQVGDTVTLVINNVTSTGL
VTDNGTNLVFSIDVAGSDLAADGDRTIDASVTTTDAAGNTATATDTEDYTVDTAITASIT
LDTEITADDVINAAESGQNIAITGVVGGDVQVGDTVTLVINNVTSTGLVTDNGTNLVFSI
DVAGSDLAADGDRTIDASVTTTDAAGNTATATDTEDYTVDTAITASITLDTEITADDVIN
AAESGQNIAITGVVGGDVQVGDTVTLVINNVTSTGLVTDNGTNLVFSIDVAGSDLAADGD
RTIDASVTTTDAAGNTATATDTEDYTVDTAITASITLDTEITADDVINAAESGQNIAITG
VVGGDVQVGDTVTLVINNVTSTGLVTDNGTNLVFSIDVAGSDLAADGDRTIDASVTTTDA
AGNTATATDTEDYTGNLAPVAVDDSITVDEDTPFTSTIDLDANDTNLDGDALSVTPGTFT
TAQGGTLVLAADGSYTYTPAANFNGIDTVDYTVTDGSLTDVGTLTINVTPVNDAPVAVDD
SITIGEDTPFTSTVDLDFNDTDLDGDALSVTPGTFTTAQGGTLVLAADGSYTYTPAANFN
GIDTVDYTVTDGSLTDVGTLTINVTPVNDAPVAVDDSITIDEDTPFTSTVDLDFNDTDLD
GDALSVTPGTFTTAQGGTLVLAADGSYTYTPAANFNGVDTVDYTVTDGSLTDVGTLTINV
TPVNDAPEAVDGFARVSEEGLFNGIVDTTGENPGDDTTDSAVMTGTMSFSDVEGDVLSVS
LSNPTQTLTSGGATVTWSGAGSDTLTGSANGTDVITINVTNTGAYTVTLLDAVDHPTNSV
EDILALDFNVAVTDSVDTTNVNLNVIIEDDMAISGNIVQDIEIPEQNTNLMFIVDTSGSM
GWDADTGSTTITTVERMELLLTSMKDVINSYDDMGNVKIQITTFNSGESTHQNHWFTVTE
ALEFIGDGTAATRDISLTPGGGTNYDEAVAEAEIGYLVDGKIEATAEIEVANITYFFSDG
QPQTAGGTEGTDGITGVEITEWTDFLEANDISAYGVGFGSGLTAADQAFLDPLAYDGLNE
VERDGVIVTDSTTLAETLLGTIQPPLVGNVLGQLGSDGFGADGGYFQDITIDGVLYTYNV
ASDTITNDADANVIAGSQLELDTLQLGHISLNFATGAYVYSPDVRLAQGDTKQEVFDFTA
VDNDGDTSTGVVTLNINRAAEEIPVLNSNVDEVYESALDTGTDSTSTAEITTGNILANDT
LPLGSALTNATIAGGTTDTSVAGEITVTTKEGNVLVIDTTTGDYTYTLVNAVDHYTYNEL
LAAINVNQTFSAGLEGWSGTNVINNAGKMLIDGGGNTASQTFDFGAAYAGKTVTVSFDFE
AVGVWDGGNDNFVVTANTDTISDIAYFDGEAHYDFDVVLDTNGRVSIDLLNSSGWNQEDA
LIDNFSIQAPAETEISGLADNVMDSFVYTVTDLAGYNYTGGLDVTIHDDAPTATPQDVTL
TIEPVTTNISVIVDVSSSMSDSDLALTEQAIETMINKYESMGSVNVNIVQFYGNGKIQSG
WLDADAGRALTLDTTRSGTDIEQGLREVVENSYGTLYTPTLAAADQDVMYFFGDGNTYDA
YKTDFDAYLPTWNSFVDSGAIDKLFSYSVNTTSVLSDIVKVADNGENVVSQDAENISNIA
QLSTAVSSTAALYTEGSFTSDASGNTIIDFGADGGHIESVTIGANTVTYDAVNVVQTISG
THGDFEINFETGSYRYIPTDRVATTETIEASIVDNDGDSLNTILLDINIEYSAVFNDTLT
YDGVAQLDGEAGFDTVVMDAGITLDAGTTLDYTKLDNIEKIDLSASGDHQITNLSLDDVL
SITDSNNTLQIIGDGDGNPIIGLDEDNVATVDTTGWDRVNGTGVSDGTSTTYEYVKSDGS
GDSIKLIVEDQIDNTGL
NT seq
10494 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgacagataatggaacaaacttagtatttagtatcgatgtagctggttcagacttagca
gcagatggagatagaacaattgacgcttcagtaacaactacagatgcagctggaaataca
gcaactgcaactgatactgaagattacacagtagatacagcaatcacagcttcaatcaca
ctagatactgaaatcactgctgatgatgttatcaacgcagctgaatctggtcaaaacatt
gcaatcactggtgtagttggtggagatgttcaagttggagatacagttacacttgtaata
aataatgttacttcaactggtctagtgacagataatggaacaaacttagtatttagtatc
gatgtagctggttcagacttagcagcagatggagatagaacaattgacgcttcagtaaca
actacagatgcagctggaaatacagcaactgcaactgatactgaagattacacagtagat
acagcaatcacagcttcaatcacactagatactgaaatcactgctgatgatgttatcaac
gcagctgaatctggtcaaaacattgcaatcactggtgtagttggtggagatgttcaagtt
ggagatacagttacacttgtaataaataatgttacttcaactggtctagtgacagataat
ggaacaaacttagtatttagtatcgatgtagctggttcagacttagcagcagatggagat
agaacaattgacgcttcagtaacaactacagatgcagctggaaatacagcaactgcaact
gatactgaagattacacagtagatacagcaatcacagcttcaatcacactagatactgaa
atcactgctgatgatgttatcaacgcagctgaatctggtcaaaacattgcaatcactggt
gtagttggtggagatgttcaagttggagatacagttacacttgtaataaataatgttact
tcaactggtctagtgacagataatggaacaaacttagtatttagtatcgatgtagctggt
tcagacttagcagcagatggagatagaacaattgacgcttcagtaacaactacagatgca
gctggaaatacagcaactgcaactgatactgaagattacacagtagatacagcaatcaca
gcttcaatcacactagatactgaaatcactgctgatgatgttatcaacgcagctgaatct
ggtcaaaacattgcaatcactggtgtagttggtggagatgttcaagttggagatacagtt
acacttgtaataaataatgttacttcaactggtctagtgacagataatggaacaaactta
gtatttagtatcgatgtagctggttcagacttagcagcagatggagatagaacaattgac
gcttcagtaacaactacagatgcagctggaaatacagcaactgcaactgatactgaagat
tacacagtagatacagcaatcacagcttcaatcacactagatactgaaatcactgctgat
gatgttatcaacgcagctgaatctggtcaaaacattgcaatcactggtgtagttggtgga
gatgttcaagttggagatacagttacacttgtaataaataatgttacttcaactggtcta
gtgacagataatggaacaaacttagtatttagtatcgatgtagctggttcagacttagca
gcagatggagatagaacaattgacgcttcagtaacaactacagatgcagctggaaataca
gcaactgcaactgatactgaagattacacagtagatacagcaatcacagcttcaatcaca
ctagatactgaaatcactgctgatgatgttatcaacgcagctgaatctggtcaaaacatt
gcaatcactggtgtagttggtggagatgttcaagttggagatacagttacacttgtaata
aataatgttacttcaactggtctagtgacagataatggaacaaacttagtatttagtatc
gatgtagctggttcagacttagcagcagatggagatagaacaattgacgcttcagtaaca
actacagatgcagctggaaatacagcaactgcaactgatactgaagattacacagtagat
acagcaatcacagcttcaatcacactagatactgaaatcactgctgatgatgttatcaac
gcagctgaatctggtcaaaacattgcaatcactggtgtagttggtggagatgttcaagtt
ggagatacagttacacttgtaataaataatgttacttcaactggtctagtgacagataat
ggaacaaacttagtatttagtatcgatgtagctggttcagacttagcagcagatggagat
agaacaattgacgcttcagtaacaactacagatgcagctggaaatacagcaactgcaact
gatactgaagattacacagtagatacagcaatcacagcttcaatcacactagatactgaa
atcactgctgatgatgttatcaacgcagctgaatctggtcaaaacattgcaatcactggt
gtagttggtggagatgttcaagttggagatacagttacacttgtaataaataatgttact
tcaactggtctagtgacagataatggaacaaacttagtatttagtatcgatgtagctggt
tcagacttagcagcagatggagatagaacaattgacgcttcagtaacaactacagatgca
gctggaaatacagcaactgcaactgatactgaagattacacagtagatacagcaatcaca
gcttcaatcacactagatactgaaatcactgctgatgatgttatcaacgcagctgaatct
ggtcaaaacattgcaatcactggtgtagttggtggagatgttcaagttggagatacagtt
acacttgtaataaataatgttacttcaactggtctagtgacagataatggaacaaactta
gtatttagtatcgatgtagctggttcagacttagcagcagatggagatagaacaattgac
gcttcagtaacaactacagatgcagctggaaatacagcaactgcaactgatactgaagat
tacacagtagatacagcaatcacagcttcaatcacactagatactgaaatcactgctgat
gatgttatcaacgcagctgaatctggtcaaaacattgcaatcactggtgtagttggtgga
gatgttcaagttggagatacagttacacttgtaataaataatgttacttcaactggtcta
gtgacagataatggaacaaacttagtatttagtatcgatgtagctggttcagacttagca
gcagatggagatagaacaattgacgcttcagtaacaactacagatgcagctggaaataca
gcaactgcaactgatactgaagattacacagtagatacagcaatcacagcttcaatcaca
ctagatactgaaatcactgctgatgatgttatcaacgcagctgaatctggtcaaaacatt
gcaatcactggtgtagttggtggagatgttcaagttggagatacagttacacttgtaata
aataatgttacttcaactggtctagtgacagataatggaacaaacttagtatttagtatc
gatgtagctggttcagacttagcagcagatggagatagaacaattgacgcttcagtaaca
actacagatgcagctggaaatacagcaactgcaactgatactgaagattacacagtagat
acagcaatcacagcttcaatcacactagatactgaaatcactgctgatgatgttatcaac
gcagctgaatctggtcaaaacattgcaatcactggtgtagttggtggagatgttcaagtt
ggagatacagttacacttgtaataaataatgttacttcaactggtctagtgacagataat
ggaacaaacttagtatttagtatcgatgtagctggttcagacttagcagcagatggagat
agaacaattgacgcttcagtaacaactacagatgcagctggaaatacagcaactgcaact
gatactgaagattacacagtagatacagcaatcacagcttcaatcacactagatactgaa
atcactgctgatgatgttatcaacgcagctgaatctggtcaaaacattgcaatcactggt
gtagttggtggagatgttcaagttggagatacagttacacttgtaataaataatgttact
tcaactggtctagtgacagataatggaacaaacttagtatttagtatcgatgtagctggt
tcagacttagcagcagatggagatagaacaattgacgcttcagtaacaactacagatgca
gctggaaatacagcaactgcaactgatactgaagattacacagtagatacagcaatcaca
gcttcaatcacactagatactgaaatcactgctgatgatgttatcaacgcagctgaatct
ggtcaaaacattgcaatcactggtgtagttggtggagatgttcaagttggagatacagtt
acacttgtaataaataatgttacttcaactggtctagtgacagataatggaacaaactta
gtatttagtatcgatgtagctggttcagacttagcagcagatggagatagaacaattgac
gcttcagtaacaactacagatgcagctggaaatacagcaactgcaactgatactgaagat
tacacagtagatacagcaatcacagcttcaatcacactagatactgaaatcactgctgat
gatgttatcaacgcagctgaatctggtcaaaacattgcaatcactggtgtagttggtgga
gatgttcaagttggagatacagttacacttgtaataaataatgttacttcaactggtcta
gtgacagataatggaacaaacttagtatttagtatcgatgtagctggttcagacttagca
gcagatggagatagaacaattgacgcttcagtaacaactacagatgcagctggaaataca
gcaactgcaactgatactgaagattacacagtagatacagcaatcacagcttcaatcaca
ctagatactgaaatcactgctgatgatgttatcaacgcagctgaatctggtcaaaacatt
gcaatcactggtgtagttggtggagatgttcaagttggagatacagttacacttgtaata
aataatgttacttcaactggtctagtgacagataatggaacaaacttagtatttagtatc
gatgtagctggttcagacttagcagcagatggagatagaacaattgacgcttcagtaaca
actacagatgcagctggaaatacagcaactgcaactgatactgaagattacacagtagat
acagcaatcacagcttcaatcacactagatactgaaatcactgctgatgatgttatcaac
gcagctgaatctggtcaaaacattgcaatcactggtgtagttggtggagatgttcaagtt
ggagatacagttacacttgtaataaataatgttacttcaactggtctagtgacagataat
ggaacaaacttagtatttagtatcgatgtagctggttcagacttagcagcagatggagat
agaacaattgacgcttcagtaacaactacagatgcagctggaaatacagcaactgcaact
gatactgaagattacacagtagatacagcaatcacagcttcaatcacactagatactgaa
atcactgctgatgatgttatcaacgcagctgaatctggtcaaaacattgcaatcactggt
gtagttggtggagatgttcaagttggagatacagttacacttgtaataaataatgttact
tcaactggtctagtgacagataatggaacaaacttagtatttagtatcgatgtagctggt
tcagacttagcagcagatggagatagaacaattgacgcttcagtaacaactacagatgca
gctggaaatacagcaactgcaactgatactgaagattacacaggtaatttggcaccagta
gcagtagatgattcaatcacagtcgatgaagatacaccatttacttctacaattgattta
gatgcaaacgatacaaatttagatggagatgcattaagtgtaacgccaggtacttttaca
acagctcaaggcggaactttagttctagcagctgatggatcttacacttatacaccagca
gctaacttcaatggaattgatacagttgattacacagtaactgatggttcactaacagat
gtaggtactttaacaattaatgtaacaccagtaaatgatgcacctgtagcagtagatgat
tcaatcacaattggtgaagatacaccatttacttcaactgtagatttagatttcaatgat
acagacttagatggagatgcattaagtgtaacgccaggtacttttacaacagctcaaggc
ggaactttagttctagcagctgatggatcttacacttatacaccagcagctaacttcaat
ggaattgatacagttgattacacagtaactgatggttcactaacagatgtaggtacttta
acaattaatgtaacaccagtaaatgatgcacctgtagcagtagatgattcaatcacaatt
gatgaagatacaccatttacttcaactgtagatttagatttcaatgatacagacttagat
ggagatgcgttaagtgtaacgccaggtacttttacaacagctcaaggcggaactttagtt
ctagcagctgatggatcttacacttatacaccagcagctaacttcaatggagttgataca
gttgattacacagtaactgatggttcactaacagatgtaggtactttaacaattaatgta
acaccagtaaatgatgcccctgaagcagtagatggatttgcaagagtttctgaagaggga
cttttcaatggtatagtcgatactactggtgaaaatcctggagatgacactactgattca
gctgttatgacaggaacgatgtcttttagtgatgttgaaggtgatgtattgagtgtttca
ctctctaatccaactcaaactcttacttctggtggagcaactgtaacatggagtggagct
ggcagtgacactttaacaggttcagcaaacggtactgatgttattactataaatgtgaca
aacacaggtgcatatacagtaactcttttggatgcagttgatcatcctactaactcagtt
gaagatattttagcattagattttaatgtagcagttacggatagtgtagacactacgaat
gtaaacttaaatgtaatcatagaagatgatatggccataagtggaaatatcgttcaggat
attgaaattcctgaacaaaatacaaacttgatgtttatagtagatacttctggaagtatg
ggttgggatgccgatactggttcaactacgattactacagtggagagaatggaactactt
cttacatctatgaaagatgtaattaactcatatgatgatatgggtaatgtaaaaatacaa
attactacttttaatagcggtgagtctacacaccaaaatcactggtttacagttactgaa
gccttagaatttataggagatggaactgctgctactcgtgatattagtttaacaccaggt
ggtggaactaactatgatgaagcagttgcagaagctgaaattggttatctagtagatggt
aaaatagaagcgacagcagagatagaagtggcaaacataacttacttcttctctgatggt
caacctcaaactgctggtggtactgaaggtacagatggaattactggtgttgagataact
gaatggactgactttttagaagcaaatgatattagtgcctatggcgttggatttggatct
ggcttgactgcggctgatcaagcttttcttgatccattagcttatgatggattaaatgaa
gttgaacgtgatggtgttatcgttacggattcaacaacattagcagaaactttacttgga
acaatccagcctccacttgttggaaatgttcttggccagttaggtagtgatggatttggt
gcagatggtggatatttccaagatatcacaatagatggagtactttatacatacaatgta
gcatctgatactattacaaatgatgcagatgcaaatgtaatagctggaagccaactcgaa
ctagatactttacagctaggacatatctcacttaactttgctacaggagcatatgtttac
tccccagatgtacgcttagcacaaggtgatacaaaacaagaagtttttgattttacagca
gttgataatgatggagatacatctacaggtgtggttacgttaaatattaatcgtgctgca
gaagagattccagttcttaattcgaatgtagatgaagtttatgagtcagcattagatact
ggaacagatagtacaagtacggcagaaatcacgactggtaatattctcgcaaatgacaca
ctaccacttggatcagctcttactaatgctactatagcaggtggtacaacagatacttca
gtagccggagaaattacagttacaacaaaagagggtaatgttctagtaatagatacaaca
acaggtgattacacatatacacttgttaatgcagttgatcattatacttacaatgagcta
ttagcagctattaatgttaatcaaacattcagtgctggattagaagggtggtcaggaact
aatgtaatcaataatgcaggtaaaatgcttattgatggtggtggaaacactgctagtcaa
acttttgattttggagctgcatatgcaggtaaaactgttacagtatcatttgactttgaa
gcagttggagtttgggatggtggtaatgataactttgttgttacagctaatacagataca
attagtgatatagcatattttgatggagaagctcactatgattttgatgttgttttagat
acaaatggacgagtatcaatagatcttttaaatagtagtggttggaatcaagaagatgca
ctaatagacaatttttctattcaagcaccagcagaaacagaaatctcaggacttgcagat
aatgtaatggatagttttgtatacactgtgacagatttagcgggttataattatacaggt
ggtttagatgtgacaattcatgatgatgcaccaacggcaacaccacaagacgttacttta
acaattgaaccagtaacaacaaacatctcagttatagtagatgtctcttcaagtatgagt
gattcagatttagcattaacagaacaagcaatagagacaatgattaataagtacgaatct
atgggaagtgtaaacgttaatatagttcagttttatggaaatggaaagattcaaagtggt
tggctagatgctgatgcaggtagagcacttactttagatactacacgaagtggtacagac
attgagcaaggtcttcgtgaagtagtagagaactcgtacggaactctatatactccaaca
cttgcagctgcagatcaagatgtaatgtacttctttggagatggtaatacatacgacgct
tataaaacagattttgatgcatatttaccaacttggaatagttttgtagactctggggct
attgataagctatttagttatagtgtaaatacaacaagtgttttaagtgatatagtaaaa
gtcgcagataatggtgaaaacgttgtttctcaggatgctgaaaatatctctaatatagct
cagcttagtactgcagttagttcaactgctgcactttatactgaaggtagctttacatca
gatgcaagcggtaacactataatcgactttggtgcagatggtggacatattgagtcagtt
actatcggagcgaatacagttacatatgatgctgttaatgtagttcaaactatttctgga
acacatggagattttgaaattaactttgaaactggtagttatagatatataccaacagat
agagtagcaactacagaaactattgaagcttcaattgttgataacgatggggactcttta
aatacgattttacttgatataaacatagaatactctgcagtgtttaacgatactctaaca
tatgatggagttgctcaattagatggagaagctggctttgatactgttgtgatggatgct
ggaataactcttgatgctggaactactttagactatactaaactagataatattgaaaaa
attgacttgagtgctagtggagatcatcagattacgaatttatcacttgatgatgtctta
agcattacagactcaaacaatactctgcaaatcataggcgatggtgatggaaaccctata
attggacttgatgaagataatgtggctacagtagacacaactggttgggatagagtaaat
gggacaggagtttcagatggaacatctacaacatatgagtatgtaaaatcggatggttca
ggtgatagtattaaattgattgtagaagatcaaatagataatacaggcttataa
DBGET
integrated database retrieval system