Candidatus Sarcina troglodytae: HH195_01295
Help
Entry
HH195_01295 CDS
T06935
Name
(GenBank) YhgE/Pip domain-containing protein
KO
K01421
putative membrane protein
Organism
sarj
Candidatus Sarcina troglodytae
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
sarj00001
]
09190 Not Included in Pathway or Brite
09194 Poorly characterized
99996 General function prediction only
HH195_01295
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ABC2_membrane_3
ABC2_membrane
LOH1CR12
DUF1664
ATG17_like
DUF2200
TBCC_N
GA_3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QPJ84623
LinkDB
All DBs
Position
292376..294526
Genome browser
AA seq
716 aa
AA seq
DB search
MKNCFKVLKRDLGALIKNSVAILIVAGLCILPSFYAWVNIAAVWNPYGNTSDVCVAVVNN
DTGATLDGKDINLGNDVVDKLKGNDKIGWRFVDEQEAQNGLLSGKYYAEIEIPKDFSEDL
ASVTSDNPVKPDIIYKVNTKESPVAGKITEVAQSNLVNEISSSFIESVSETMFSKVNGYG
DNLNSQRDNILKIKSAIIYLNNNMNSIEDALKNINSNSNSLNTTLGLLKGEIPTISQGIN
SLSNININTQDFVSSAKSSVDTSYNTLKTNYTTIQSEIGSVSGLLDNLKNLVSNNGNSED
KLNTINEAINKITTINTLINANISFLEGFNNSKLDSAINDLKTLQNFLDTQKTALENAKN
IIGSGQELSNTVINTLIDNGNSAKTQINNIVNTVNNVTMPELNNIGNEILSATNDATKII
GTSKGLIGQINTILNTATTGTNMASNMSSELISKLNEYKEPIANLATQLEKVNDNDLSQI
VSILQSNPKVVGSFASSPFNIDEQVLYAVPNYGSAMAPIYTVLALWVGALLLTSLLSTKS
KDFEGSEKISVRQKHFGKMMFFVILGALQGLIVCLGDKYILGVYTVNFPLMILFSVLSAV
TFTIIVFTFVSVFGNIGKAICIVLMVLQLAGSGGTYPIQVVPKIFQILQPFFPFTYAVGG
FREAIAGPLLSSVIKDIEILVIMAIIFILAGFFLKNLLNKKVEKFEEEFKKSGVGE
NT seq
2151 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaattgttttaaagtattaaaaagagatttaggtgcattaataaaaaattctgta
gcgatattaattgtagcaggactttgtatattgccctctttttacgcttgggttaatatt
gcggctgtttggaatccttatggaaacacaagtgatgtttgtgtagcagttgtaaataat
gatactggagctactttggatggtaaagatattaatttagggaatgatgtggttgataag
ctaaaaggtaatgataaaattggttggaggtttgttgatgagcaagaagctcaaaatgga
cttttaagcggtaaatattacgcagaaatagaaatacctaaagatttttcagaggattta
gctagtgtaacgtctgataatcctgtaaagccagacattatttataaagtaaatactaaa
gaaagtcctgtggcaggtaaaataacagaagttgctcaaagcaatttagttaatgagatt
tcatctagttttatagagagtgtaagtgaaactatgttctcaaaagttaatggatatggt
gataatcttaattctcaaagagataatatattaaagataaaatctgcaattatatatttg
aataataatatgaatagtatagaggatgctttaaaaaatattaatagcaattcaaatagc
ttaaatacgactttaggattattaaagggagaaattccaacaatatcacaaggaattaat
tctttgagtaatattaatataaatactcaggattttgtttctagcgctaaaagtagtgta
gatacatcatataacacattgaaaacaaattatacaacaattcaaagtgagattggtagt
gtaagtggcttattagataatttaaaaaatttagtttctaataatggaaattctgaagat
aagttaaatacaataaatgaagctataaacaaaattacaactataaatacgttaattaat
gctaatataagctttttagaaggatttaataattctaagctagatagtgcgataaatgat
ttaaaaacattacaaaactttttagatacacaaaaaacagcattagaaaatgctaaaaat
attataggttcagggcaagagttaagtaatactgtgataaacacattaattgataatgga
aatagtgcaaaaacacaaataaataatatagtaaatacagttaataatgtaactatgcca
gagcttaataatataggaaatgaaattttaagtgcaacaaatgatgcaactaaaattatt
ggaacttctaaagggttaataggtcaaataaatactattttaaatactgcaacaactgga
acaaatatggcaagtaatatgtcaagcgaacttatttctaaattaaatgaatataaggag
ccaatagctaatttagctactcaattagaaaaagttaatgataatgatttatctcaaata
gtaagtatattacaaagcaatcccaaagttgttggaagttttgcttctagtccatttaat
atagatgaacaggtgctttatgctgtacctaattatggtagcgcaatggctcctatatat
actgttttggctttatgggttggtgcattgttattaacatcattgttgtcaactaaatct
aaagattttgaaggaagcgaaaaaatatctgttagacaaaaacattttggtaaaatgatg
ttctttgtaatattaggagctttacaggggcttatagtttgccttggagataaatacatt
ctaggcgtatatacagttaatttcccgcttatgatattatttagtgtattgtcggcagtt
acatttactataatagtatttacttttgtttctgtttttggaaacataggaaaagctatt
tgtatagtgttgatggtattgcaacttgcaggttctggaggaacttatccaatacaagtt
gtaccgaaaatttttcaaatactacaaccgttctttccatttacttatgcagttggtgga
ttcagagaagcaattgcaggtccattattaagcagtgtaattaaagatattgaaattctt
gtaataatggcgataatatttattcttgcaggatttttccttaaaaatcttttgaacaag
aaggttgaaaagtttgaagaggaatttaaaaaatctggagttggagaataa
DBGET
integrated database retrieval system