Candidatus Sarcina troglodytae: HH195_02305
Help
Entry
HH195_02305 CDS
T06935
Name
(GenBank) multidrug efflux MFS transporter
KO
K18926
MFS transporter, DHA2 family, lincomycin resistance protein
Organism
sarj
Candidatus Sarcina troglodytae
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
sarj00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
sarj02000
]
HH195_02305
Transporters [BR:
sarj02000
]
Major facilitator superfamily (MFS)
Drug transporters
Drug:H+ antiporter-2 (14 spanner) (DHA2) family [TC:
2.A.1.3
]
HH195_02305
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MFS_1
FtsX
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QPJ84807
LinkDB
All DBs
Position
521166..522581
Genome browser
AA seq
471 aa
AA seq
DB search
MTNIKQNNKKINTKLIIAVLVFSAFIGTFNETILNVALNPIMNDFHIDSGTAQWIITAYM
LVTSVMVPITAFLYESFKTKKLYIIAMLFLLIGTVICAGSTSLLILILGRMVQAIGAGML
IPIMMSTVLLVSPKEKIGISMAICVSAVTLGPAFGPTISGIILQFLSWNMLFIILIPIVI
IAIILGAIFIENASDLRKPKLDYLSVVLSMAGLVAIIYGISSIFNTFNVAIICFVIGIIL
TAIFAKRQTKLKEPMLNLNPFRFVPFDFGVLMVMVIMMICFTMNVIIPLYLEGALHTSSF
VAGIVLLPAILCNAVAATCGGKILDKYGIKILIPGGFLLIAVSVFIMSMVNASTQVMTIA
IIYIFIQIGVGLTMSPSQTSGLRYLPRDIYTHGVAIMNTFQQIAACIGSSLFVGVMSFVE
QKKLLLGVVSENAVAQGFSAAILVAFVIVIVGLIASIVFIGVFNKNSKDKK
NT seq
1416 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgactaatattaaacaaaataataagaaaattaatactaagctcattatagctgttttg
gtctttagtgcatttattggaacgtttaatgaaactatattaaatgtagcattaaatcca
ataatgaatgattttcatattgattcaggaacagctcaatggataattacagcatatatg
ttagtaacatctgtaatggtaccgataactgcgtttctttatgaaagttttaaaacaaaa
aaattatatataatagcaatgctatttttacttataggaactgttatttgtgctggttct
acatcactattaatacttatattaggtagaatggtacaggctataggagcaggaatgttg
attcctattatgatgagtacagttttattggtgtcacctaaagaaaaaataggtatatct
atggcaatatgtgtatcagctgtaactcttggacctgcatttggaccaacaatatcagga
ataatattacaatttttaagttggaatatgctttttattattttaataccaattgttatt
atagcaataattttaggagctatctttatagaaaatgcatcagatttaaggaaaccaaaa
ttagattatttatctgttgttttatctatggctggtcttgtagcaatcatttatggaatt
agtagtatatttaatacatttaatgtagcaataatatgttttgtaataggaataatttta
actgctatttttgctaaacgtcaaacaaaattaaaggagcctatgcttaatttaaatcca
tttaggtttgttccttttgattttggggttcttatggttatggtaattatgatgatatgt
tttacaatgaatgtaattataccattatatttagaaggagcattgcatacatcaagtttt
gttgctggtattgtattacttcctgcaatattatgtaatgctgtggcggcaacttgtgga
ggaaaaatactcgataaatatggaattaaaattttaattccaggaggatttttgttgata
gcagtatcagtatttattatgtcaatggtaaatgcatcaacacaagttatgacaattgct
attatttatatatttattcaaattggggttggacttacaatgtcaccatctcaaacaagt
ggattaagatatttaccaagagatatttatactcatggtgtagcaattatgaatacattt
caacaaattgcagcttgtataggctcatcattatttgttggtgttatgtcatttgttgag
caaaaaaaattattacttggagtagtttcagaaaatgcagtagctcaaggtttttcagct
gcgattctagttgcttttgttatagtaattgttggacttatagcgtcaatagtttttatt
ggtgtatttaataaaaattctaaagataaaaaatag
DBGET
integrated database retrieval system