Candidatus Sarcina troglodytae: HH195_03865
Help
Entry
HH195_03865 CDS
T06935
Name
(GenBank) sensor histidine kinase
Organism
sarj
Candidatus Sarcina troglodytae
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HisKA_3
DUF2730
HATPase_c
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QPJ85095
LinkDB
All DBs
Position
complement(885163..886362)
Genome browser
AA seq
399 aa
AA seq
DB search
MNRLNHTFILRAILLLVIALNVYSKLNKNNFFFYLFIIFILILNEFFRYSLINKKSIMKS
KNNINKITIFVSLILSLVILSYLSYYHLSITFYIFFILFESFYFKGVLKIILFIINYLSY
ITPLALSNTYIDNSFLFNIYNKTISRGFIINIVESSISYFSYFIIVMLIKKVRKNKKNIY
ILNQELKEQNLKLKEYSKKIEELTISKERNRVAQELHDSLGHYLMAISMHIDVLDKTLDI
SPEKSKNILSKTKIIVDNSIDELRSTVYSLKKNNINIISSVNSLTENLSISNNISFNVNI
SNDIENVSLLIKDALYKTIKESITNGVKHGKASQFIIDLFIKDNIIYLSILNNGIKPDNI
IKSNGLNGMEDRLRVLNGKLNVENTLDGFKVSCTIPLIK
NT seq
1200 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatagattaaatcacacttttatattaagggctatactacttttagttatagctcta
aatgtttattcaaaattaaataaaaataattttttcttttacctcttcattatatttatt
ctaattctaaatgaattttttagatattcattaataaataaaaaaagtataatgaaatca
aaaaataatattaacaaaataactatatttgtttcattaatattatctttagttatttta
agttatttatcttattatcatttaagtataacattttatatattctttattttatttgaa
agcttttattttaaaggcgttttaaaaattatattatttataataaactatttaagctat
atcacacctttagcattgtctaacacatatatagataatagttttctttttaatatttat
aacaaaactattagtagaggttttattataaatatagttgaaagtagcataagttacttt
agttattttataatagtaatgctaattaaaaaagttagaaaaaacaaaaaaaatatttac
atattaaatcaagaacttaaagagcaaaatttaaaacttaaagaatattcaaagaaaata
gaagaacttactatatcaaaggaacgaaatagagttgctcaagaacttcatgactcttta
ggtcattatcttatggctatatctatgcacattgatgttttagataaaaccttagatata
tcgcctgaaaaatcaaaaaatattttatctaaaactaaaataatagtagataatagcatt
gatgaacttagaagcaccgtttattctttaaagaaaaataatataaatattataagttct
gttaactctttaactgaaaatttatcaatatcaaataatatttcttttaatgttaatatc
tcaaacgatatagaaaatgtttctcttttaattaaagatgcattatataaaactataaaa
gaatctataactaatggggtaaaacacggaaaagcctcacagtttattattgatttattt
attaaagacaatataatttatttatctatattaaacaatggaataaaacctgataatata
ataaaatctaacggtttaaatggaatggaggatagattaagagtattaaatggcaaactt
aatgttgaaaatactttagatggatttaaagtttcatgtaccatacctcttataaaataa
DBGET
integrated database retrieval system