Candidatus Sarcina troglodytae: HH195_04100
Help
Entry
HH195_04100 CDS
T06935
Name
(GenBank) MATE family efflux transporter
KO
K26937
MATE family, multidrug efflux pump
Organism
sarj
Candidatus Sarcina troglodytae
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
sarj00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
sarj02000
]
HH195_04100
Transporters [BR:
sarj02000
]
Solute carrier family (SLC)
SLC47: Multidrug and toxin extrusion (MATE) family
HH195_04100
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
MatE
Polysacc_synt
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QPJ85138
LinkDB
All DBs
Position
932556..933920
Genome browser
AA seq
454 aa
AA seq
DB search
MKNLFDREITFLSIIKFTIPTVIMMVFFSMYTIIDGVFISRFVGADALSSVNIVYPVISL
LTAIAVMFATGGSAIVAKTMGEKRLEEAREKFTLITVCSIFFGIIVAVLCILFIKPIIMF
LGSIDNLYNNCYYYLLIMIIFTPFLILKMYFDYFFVTAGKARLGLVTSILGGIINVVLDY
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EMVTQLSSAVTTFVYNIVMINFLGADGVASITIILYVNFLLIAVYLGFTSGIAPWISYNF
GSKNAKQLKKIIKYSYIYIFLFSLISFIVSRLGSEILIGAFAVKGTDVYNISLNGFDIFS
FSFLISGFNMFTIGMFTAFSNGKISAVISLMRTLVLFLIGISVFPAFLGVNGVWIVVPFS
EILTLILGLTFVYKFRDEYMYGNILLKSYNCIKN
NT seq
1365 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
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tatggaaatattttgttaaaatcttataattgtataaaaaattaa
DBGET
integrated database retrieval system
