Candidatus Sarcina troglodytae: HH195_10850
Help
Entry
HH195_10850 CDS
T06935
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K01421
putative membrane protein
Organism
sarj
Candidatus Sarcina troglodytae
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
sarj00001
]
09190 Not Included in Pathway or Brite
09194 Poorly characterized
99996 General function prediction only
HH195_10850
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EzrA
Sec10_N
DUF948
Prominin
ATG17_like
Mce4_CUP1
KASH_CCD
Dynactin_p22
SHE3
DUF7121
DUF489
MitMem_reg
Sec3_CC
Laminin_II
HsbA
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QPJ86366
LinkDB
All DBs
Position
complement(2332270..2334243)
Genome browser
AA seq
657 aa
AA seq
DB search
MKKNKIISLVLATVIMGGVATPISAFAQEIVTSDNLEDSSRENTDKEEVVYVNLNNNGLV
DKVYAVNIFNSKNIVDYGDYSEVRNMNTNDVLNYSNGKIVTTNSSDKLYYEGVLENAQIP
WNIDINYYLNGEKISADKLAGSAGSLEIKISISSNEKCNSVFFENYALQGTGLLDTEKCT
NIESDEATIANVGSQKQLSYMILPNKGKEITIKADVKDFEMPSISLNGVRFNLDVDVNTD
ELTDKVKELTDAIDEINSGATTLKDGTSTLNGGTNDLLSGVDSLNSGVDSLNSGILKVKE
GLETLNSKSSNLTDGSKKILDALNEINLALENVNVSSESIAQLVSASSDIKKGIDNLVKG
ALSLNSNIGYSAYKGIMSSNGLNIDSLQGSNTSEVNDIKSQIQSLTDAKNALMAEGALDG
DSKVLAIENAISELTEIIGLLQKNSAAIGGVETYLNNVSTGTQELLTGSNTLQEKYGQFD
EAIVNLSQKLSGLGENMATLANAISQLTAQYKTFDTGVNDYTKGVSALLEGYSKIVNGST
ELKNGTKTLKDGANSLNSGASSLYEGTTKLSDGTGELNDKTSNLDGEINDEVDSMVNELT
GNLEEVVSFVSEKNTNVESVQFVIKTPAIEKEKVESVEEKTENLSIWQRFINLFTKK
NT seq
1974 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagaaaaataagattatatcattagttttagctactgtgattatgggaggtgtagca
actcctataagtgcatttgcacaagaaattgttacttcagataatttagaagattcaagt
cgtgaaaatacagataaagaagaagttgtatatgttaacttgaataataatggtttggta
gataaggtttatgctgttaatatatttaatagtaaaaatatagtggattatggtgattat
agcgaagttagaaatatgaatactaatgatgttttaaattatagtaatgggaaaatagtt
actactaattcgtctgataaactttattatgagggagtattagaaaatgcacaaattcct
tggaatatagatattaattactatttaaatggtgaaaaaattagtgctgataaactagct
ggaagtgctgggagtttggaaataaaaatatctataagtagtaatgaaaaatgtaatagt
gtattttttgaaaattatgcattacagggaacgggattattagatacagaaaagtgtacg
aatatagaatctgatgaagctacaatagcaaatgtaggaagccaaaagcaactatcatat
atgatattacctaacaagggaaaggaaattacaataaaggctgatgttaaagattttgaa
atgccttctataagcttaaatggggttagatttaatcttgatgttgatgttaatactgat
gaattaacagataaggtaaaagagttaacagatgccatagatgaaataaattcaggagct
acaactttaaaagatggaacatctacactaaatggtggaacaaatgatcttttgtctggt
gttgatagtttgaactcaggagttgattctttaaatagtggaattttaaaggttaaagaa
gggcttgagactttaaatagcaaatcttcaaatttaactgatggttcaaaaaagatttta
gatgctttaaatgaaataaatctagctttagaaaatgttaatgtatcatcagagagtata
gcacaattagtttcagcatcatctgatataaaaaagggaattgataatttagttaagggt
gctttatcattaaattctaacatagggtattctgcttataagggaattatgagttcaaat
gggttaaatatagattctttacaaggaagcaatacaagtgaggttaatgatataaagagt
caaattcaaagtcttacagatgctaaaaatgctttaatggcagaaggtgcattagatggt
gatagcaaagttttagcaattgaaaatgctattagcgagttaacagaaataataggattg
cttcaaaaaaattctgctgctattggtggagttgaaacttatttaaataatgtttcaaca
ggaacacaagaattattaacaggttcaaatacattgcaagaaaaatatggtcagtttgat
gaagcaattgtaaatctttcacaaaaattaagtggcttaggtgaaaatatggctacttta
gctaatgcaataagtcaattaacagctcagtataaaacttttgatacaggagttaatgac
tatacaaaaggagtatctgctttacttgaaggatattcaaaaatagtaaatggttctact
gagttaaaaaatggaacaaaaacattaaaggatggagcaaatagtttaaattctggggca
tcaagcctttatgaaggaacaacaaagttatcagatggaacaggtgaacttaacgataaa
acttctaatttagatggagagattaatgatgaagttgatagtatggtaaatgaattaact
gggaatttagaagaggttgtttcttttgtttctgaaaaaaatactaatgttgaatcagta
caatttgtaataaaaacacctgctatcgaaaaggaaaaagttgaaagtgttgaggagaaa
actgaaaatttaagtatttggcaaaggtttataaatctatttacaaaaaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
