Candidatus Sarcina troglodytae: HH195_11875
Help
Entry
HH195_11875 CDS
T06935
Name
(GenBank) ABC transporter ATP-binding protein
KO
K06147
ATP-binding cassette, subfamily B, bacterial
Organism
sarj
Candidatus Sarcina troglodytae
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
sarj00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
sarj02000
]
HH195_11875
Transporters [BR:
sarj02000
]
ABC transporters, eukaryotic type
ABCB (MDR/TAP) subfamily
ABCB-BAC subgroup
HH195_11875
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ABC_membrane
ABC_tran
AAA_21
nSTAND3
SMC_N
Rad17
AAA_29
AAA_14
ABC_ATPase
AAA_22
RsgA_GTPase
Zeta_toxin
cobW
T2SSE
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QPJ86665
LinkDB
All DBs
Position
p2:5926..7626
Genome browser
AA seq
566 aa
AA seq
DB search
MIRNLKNDISLFFQTLRELKLNKFKLFIIFITLIFSNILSFINPLLFGKIINGIMEKSVN
SIKLNLFLMCFFFLVSIILNYTNQIMLFKFTSNLEIEMKENIFNSILKIPYSNFIKIDKG
KLINTIEDDSTVFSNLISNNLTIITSGLSLIISLLLMLYISPILTLLYILTLPITSVIYI
ISGNKIKTNEIKSTNTHDFFISFLNESMYGWKVLKLFNAPNKRVSNFKDIINYLYSLEIT
KFKIQVSSSILVNILSFLVNILNIMLAAYLIFNGKLSLGMFTAFNDYSQTFKNSSLSFTQ
LNSIIQETSVSIKRFNDILKYKKNSKLNNVSTHNIDVPINTVEIRNLSYSTPDNNELFKN
TNLKFKKNNIYIIKGASGSGKTTLFNILGKFIDEYLGEVFINDINLRDINEHSLRNKLNY
IMQDNFLFSLSIKDNISLYREIEFNDIVNACKKLKIHDIIMTLPNKYDTILNKNGTDLSG
GQKQRICIARSIVSKPDIYLFDEITSAVDKNNVEEILKIIEDLAQNAIVILTSHDDLNFS
IPVVEYYLSNKKFKSKLIYNYNDAIY
NT seq
1701 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgataagaaacttaaagaacgatatatcattattctttcaaacattaagggaattaaaa
cttaataaatttaaattatttattatatttataacattaatattttctaatatcttaagc
tttattaatcctttattatttggaaaaataataaatggcataatggagaaatcagtaaat
tcaattaagttaaatttatttttaatgtgtttctttttcttagtttcaataatattaaat
tataccaatcaaataatgttattcaaatttacctctaatttggaaattgaaatgaaggaa
aatatttttaattcaatattaaaaatcccatattcaaattttataaaaatagataaaggt
aaattaattaacactatagaagacgactccactgtattctctaatttaatttctaataat
ttaactataattacaagtggattaagtttaataatttctttgctattaatgctatatatt
agccctatattgaccttattatatatattaacattaccaattactagtgtgatatatatt
atttctggaaataaaataaaaactaatgaaattaaatcaacaaatacacatgattttttt
atttcatttttaaatgaaagcatgtatggttggaaagttttaaaattattcaatgcacca
aataaaagagtttctaattttaaagatattataaattatttgtattcattagaaattaca
aaatttaaaatacaagtttcatctagtatcttagtaaatatattgtcttttttggtaaat
attttaaatataatgctagcagcatacttaatttttaatggaaaactttctttaggtatg
tttacagcatttaacgattattcccaaacatttaaaaattcatcattatcatttactcaa
ctaaattctattatacaagaaacgtctgtttctattaaaagatttaatgatattttaaaa
tataaaaaaaatagtaaattaaataacgtatctactcacaatatagatgtaccaattaat
acagttgaaattagaaatctatcatattctacaccagataataatgagctttttaaaaat
actaatcttaaattcaaaaaaaataatatatatattataaaaggtgctagtggttcagga
aaaacaacattatttaatattttaggaaaatttatagatgaatatttgggagaggtgttt
attaacgatataaatttaagagatattaacgaacattctcttcgtaataaattaaattat
ataatgcaagataattttttattctcattatcaattaaagataatatttctctatataga
gagattgaatttaatgatatagtaaatgcatgcaaaaaattaaaaattcatgatataatt
atgacactaccaaataagtatgatactattctaaataaaaatggtactgatctatctggt
ggtcaaaaacaaagaatctgtattgctagatcaattgttagtaaacctgatatatattta
tttgatgaaataacttcagcagttgataaaaataatgttgaagaaattttaaaaataatt
gaagatttagcccaaaatgcaattgttattttaacatctcatgatgacttaaatttttca
attccagtagtagaatattatctctcaaataagaaatttaaaagtaaattaatttataat
tataatgatgcaatatattaa
DBGET
integrated database retrieval system
