Staphylococcus aureus subsp. aureus MSSA476 (MSSA): SAS2578
Help
Entry
SAS2578 CDS
T00183
Name
(GenBank) collagen adhesin precursor
Organism
sas
Staphylococcus aureus subsp. aureus MSSA476 (MSSA)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Cna_B
SpaA
GramPos_pilinD3
Collagen_bind
CBM60
PapC_N
DUF3016
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CAG44395
LinkDB
All DBs
Position
complement(2777716..2781267)
Genome browser
AA seq
1183 aa
AA seq
DB search
MNKNVLKFMVFIMLLNIITPLFNKNEALAARDISSTNVTDLTVSPTKIEDGGKTTVKMTF
DDKSVKIQNGDTIKVAWPTSGTVKIEGYSKTVPLTVKGEQVGQAVITPDGATITFNDKVE
KLSDVSGFAEFEVQGRNLTQTNTSDDKVATITSGNKSTNVTVHKSEAGTSSVFYYKTGDM
LPEDTTHVRWFLNINNEKRYVSKDITIKDQIQGGQQLDLSTLNINVTGTHSNYYSGSNAI
TDFEKAFPGSKITVDNTKNTIDVTIPQGYGSYNSFSINYKTKITNEQQKEFVNNSQAWYQ
EHGKEEVNGKSFNHTVHNINANAGIEGTVKGELKVLKQDKDTKAPIANVKFKLSKKDGSV
VKDNQKEIEIITDANGIANIKALPSGDYILKEIEAPAPYTFDKDKEYPFTMKDTDNQGYF
TTIENAKEIEKTKDVSAQKVWEGTQKVKPTIYFKLYKQDDNQNTTPVDKAEIKKLEDGTT
KVTWSNLPENDKNGKTIKYLVKEVNAQGEDTTPEGYTKKENGLVVTNTEKPIETTSISGE
KVWDDKDNQDGKRPEKVSVNLLANGEKVKTLDVTSETNWKYEFKNLPKYDEGKKIEYTVT
EDHVKDYTTDINGTTITNKYTPGETSATVTKNWDDNNNQDGKRPTEIKVELYQDGKATGK
TATLNESNNWTHTWAGLDEKAKGQQVKYTVEELTKVKGYTTHVDNNDMGNLIVTNKYTPE
TTSISGEKVWDDKDNQDGKRPEKVSVNLLANGEKVKAVDVTSETNWKYEFKDLPKYDEGK
KIEYTVTEDHVKDYTTDINGTTITNKYTPGETSATVTKNWDDNNNQDGKRPTEIKVELYQ
DGKATGKTAKLNESNNWTHTWTGLDEKAKGQQVKYTVEELTKVKGYTTHVDNNDMGNLIV
TNKYTPETTSINGEKVWDDKDNQDGKRPEKVSINLLANGEKVKTLDVTSETNWKYEFKDL
PKYDEGKKIEYTVTEDHVKDYTTDINGTTITNKYTPGETSATVTKNWDDNNNQDGKRPTE
IKVELYQDGKATGKTATLNESNNWTHTWAGLDEKAKGQQVKYTVEELTKVKGYTTHVDNN
DMGNLIVTNKYTPEKPNKPIYPEKPKDKTPPTKPDHSNKVKPTPPDKPSKVDKDDQPKDN
KTKPENPLKELPKTGMKIITSWITWVFIGILGLYLILRKRFNS
NT seq
3552 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaacaagaacgtgttgaagtttatggtctttataatgttattaaatatcatcacgcct
ttatttaataaaaatgaagcattggcagcacgagatatttcatcaacgaatgttacagat
ttaactgtatcaccgactaagatagaagatggtggtaaaacgacagtaaaaatgacattc
gacgataaaagtgtaaaaatacaaaatggtgacacgattaaagtggcatggccgacaagc
ggtacagtaaagatagagggttatagtaaaacagtaccattaactgttaaaggtgaacag
gtgggtcaagcagttattacaccagacggagcaacaattacattcaatgataaagtagaa
aaattaagtgatgtttcgggatttgcagaatttgaagtacaaggaagaaatttaacgcaa
acaaatacttcagatgacaaagtagctacgataacatctgggaataaatcaacgaatgtt
acggttcataaaagtgaagcgggaacaagtagtgttttctattataaaacgggagatatg
ctgccagaagatacgacacatgtacgatggtttttaaatattaataatgaaaaaagatat
gtatcgaaagatattactataaaggatcagattcaaggtggacagcagttagatttaagc
acattaaacattaatgtgacaggtacacatagcaattattatagtggatcaaatgcaatt
actgattttgaaaaagcttttccaggttctaagataactgttgataatacgaagaacaca
attgatgtaacaattccacaaggctatgggtcatataatagtttttcaattaactacaaa
accaaaattacgaatgaacagcaaaaagagtttgttaataattcacaagcttggtatcaa
gagcatggtaaggaagaagtgaacgggaaatcatttaatcatactgtgcacaatattaat
gctaatgccggtattgaaggtactgtaaaaggtgaattaaaagttttaaaacaggataaa
gataccaaggctcctatagctaatgtaaaatttaaactttctaaaaaagatggatcagtt
gtaaaggacaatcaaaaagaaattgagattataacagatgcaaacggtattgctaatatt
aaagcgttgcctagtggagactatattttaaaagaaatagaggcgccagcaccgtataca
tttgataaggataaagaatatccgtttactatgaaagatacagataatcagggatatttt
acgactattgaaaatgcaaaagagatagaaaaaacaaaagatgtatctgctcaaaaggtt
tgggaaggcactcaaaaagtgaaaccaacgatttatttcaagttgtacaaacaagatgac
aatcaaaacacaacaccagtagacaaagcagagattaaaaaattagaagatggaacgaca
aaagtgacatggtctaatcttccagaaaatgacaaaaatggcaagactattaaatattta
gttaaagaagtaaatgctcaaggtgaagacacaacaccagaaggatatactaaaaaagaa
aatggtttagtggttactaatactgaaaaaccaatcgaaacaacatcaattagcggtgaa
aaagtatgggacgacaaagacaatcaagatggtaagagaccagaaaaagtcagtgtgaat
ttattggctaatggagagaaagtaaaaacgttagacgtgacatctgaaacaaactggaag
tacgaatttaaaaacttaccgaagtatgatgaaggaaagaaaatagaatatacagtgacc
gaagatcacgtaaaagactacacaacagacatcaacggtacgacaataacgaacaagtat
acaccaggagagacatcggcaacagtaacaaaaaattgggatgacaataataaccaagac
ggaaaacgaccaactgaaattaaagttgagttatatcaagatggaaaagcaacaggaaaa
acggcaacattaaatgaatctaataactggacccatacgtgggcaggattagatgaaaaa
gcaaaaggtcaacaagtaaaatacacagtcgaggaattaacaaaagttaaaggctataca
acacatgtggataacaatgatatgggtaacttgattgtgacgaataaatatacgccagaa
acaacatcaattagcggtgaaaaagtatgggacgacaaagacaatcaagatggtaagaga
ccagaaaaagtcagtgtgaatttattagctaacggagagaaagtaaaagcggtagatgtg
acatctgaaacaaactggaagtacgaatttaaagacttaccgaagtatgatgaaggaaag
aaaatagaatatacagtgaccgaagatcacgtaaaagactacacaacagacatcaacggt
acaacaataacgaacaagtatacaccaggagagacatcggcaacagtaacaaaaaattgg
gatgacaataataaccaagacggaaaacgaccaactgaaattaaagttgagttatatcaa
gatggaaaagcaacaggaaaaacggcaaaattaaatgaatctaataactggacccatacg
tggacaggattagatgaaaaagcaaaaggtcaacaagtaaaatacacagtcgaggaatta
acaaaggtcaaaggttatacaacacatgtggataacaatgatatgggcaacttgattgtg
acgaataaatatacgccagaaacaacatcaattaacggtgaaaaagtatgggacgacaaa
gacaatcaagatggtaagagaccagaaaaagtcagtataaatttattggctaatggagag
aaagtaaaaacgttagacgtgacatctgaaacaaactggaagtacgaatttaaagactta
ccgaagtatgatgaaggaaagaaaatagaatatacagtgaccgaagatcacgtaaaagac
tacacaacagacatcaacggtacaacaataacgaacaagtatacaccaggagagacatcg
gcaacagtaacaaaaaattgggatgataataataaccaagacggaaaacgaccaactgaa
attaaagttgagttatatcaagatggaaaagcaacaggaaaaacggcaacattaaatgaa
tctaataactggacccatacgtgggcaggattagatgaaaaagcaaaaggtcaacaagta
aaatacacagtcgaggaattaacaaaagttaaaggttatacaacacatgtggataacaat
gatatgggtaacttgattgtgacgaataaatatacgccagaaaaaccgaataaaccaatc
tatcctgaaaaaccaaaagacaaaacaccaccaactaaacctgatcactctaataaagtt
aaaccaactcccccagataagccatcaaaagtggataaggatgatcaacctaaagataat
aaaaccaaacctgaaaatcctctaaaagaattaccaaaaactggtatgaagattataact
tcatggattacatgggtatttataggtatattgggattgtatttaattttaagaaaaaga
tttaactcataa
DBGET
integrated database retrieval system