KEGG   Spiroplasma mirum GNAT3597: SATRI_v1c05470
Entry
SATRI_v1c05470    CDS       T03973                                 
Symbol
secDF
Name
(GenBank) preprotein translocase subunit SecD
  KO
K12257  SecD/SecF fusion protein
Organism
satr  Spiroplasma mirum GNAT3597
Pathway
satr02024  Quorum sensing
satr03060  Protein export
satr03070  Bacterial secretion system
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:satr00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09123 Folding, sorting and degradation
   03060 Protein export
    SATRI_v1c05470 (secDF)
 09130 Environmental Information Processing
  09131 Membrane transport
   03070 Bacterial secretion system
    SATRI_v1c05470 (secDF)
 09140 Cellular Processes
  09145 Cellular community - prokaryotes
   02024 Quorum sensing
    SATRI_v1c05470 (secDF)
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02044 Secretion system [BR:satr02044]
    SATRI_v1c05470 (secDF)
Secretion system [BR:satr02044]
 Sec (secretion) system
  Prokaryotic Sec-SRP core components
   SATRI_v1c05470 (secDF)
SSDB
Motif
Pfam: SecD_SecF_C
Other DBs
NCBI-ProteinID: AKM53032
LinkDB
Position
483381..486515
AA seq 1044 aa
MKEKQQVKTIKKPVNRKVLTKLIVRIFVLLILTCAMIVGAVFSGENFSYSYKLGIAYSGG
YQVQINVFDTTVENPDGTPNGDNKKGLDLLRNKLDPLNNSNLYLQTLGHNGLELIAGKDL
FKSYADLKTDIQRLGAIYLMKGNGTDLLVSDKERTPLSNVISGAEAGIDKIRHPIINLNI
KDQAKWDAIIKSLTPSQGSPEPLYIWTDIGQFIDELRHDTDNIQAIATNFNVNILPNLSG
TDNINVRSIFDVSYKDAGQGGIIVYRNLLDLATSGMSHPELVKVMQEDSFRFTTVSLGKL
VIDPNDKKAIKNQYIDPLRKYLTGIVNYTPQLKDKYKKYIINYNAINKGATPGLNSNQIA
TSTDTEARTISNLVNGGLSGLKFVVRGHTTIPPVVSRNILNVSMIVLGIIAAAICVYLLI
YYRLFGFVAILTLAFTIILTLYFSSLLGVQISPESITAVIIAFGIALEGNLLLFSRYKRE
RYQNGLPYEPAMKIANKQTVAVFVDALVVLLVLGLSLFWAGTNNIKSFATILLVALIISL
VMVFAVARIMYWIIIKLRWQEKVTWLDIPRFSLLTYFQQKKHTHQVVNGEGQLLSDCFFA
LPTTDVNEATPSESDQPKKPHKLRFKPKFSLYNITKYSPIVGIILIIIALIIGFAGKANI
DSTIKPGTNITVASDIWRHRDDAAAEIQEMTQELKHLQATRGYNFSFNLYVIKADDMSMG
QQLLVISTNISGSNFARELLSSIAGYYGLTPEDPVFKLEKTSPVMETYILKTAGISLAIG
IACIFVYTLFRLDWAQFIGILFAAVFTLAVSVSIIVIAHILLTFEMSIAFIAIFGFAWAM
GAIVMAWAKQNKKLVNIKEYETFFTYMSEHRAQVRRLRRAKKVYMQEEIKKLMIANLNLK
QKEVKKEFAEHLKTQWKIAKDLAAKNKKEIKLINKEFRKYNYTHNFLQKIANLTIKQMLR
HCLTLGAIFTIILIILSAFSGSVFGFNITVFIGLAIGMFSVLFLAIPIWVALEKYRALNK
IRVKNYLDSQRVEIDEQIVAGVND
NT seq 3135 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
gtgaaagaaaaacaacaagtaaagacaataaaaaaaccagttaatagaaaggttttaaca
aaattaattgttagaatttttgtcttattaattttaacgtgtgccatgatcgtaggagcc
gttttttcaggtgaaaatttttcttattcttataaattaggaattgcttattcgggaggc
tatcaagttcaaattaatgtttttgataccactgttgaaaatcccgatggaacccccaac
ggagataataaaaaagggctagatttattacgcaacaaacttgacccgttaaataattct
aacttatacttgcaaacattaggacataatgggttagaattaattgctgggaaggattta
tttaagtcttatgctgatttaaaaactgatattcaacggttaggggccatttatttaatg
aaagggaatggcaccgatttattggttagtgataaagaacgtacaccgttaagtaatgtt
atttcgggagcagaagctgggattgataaaattcgtcatccgattattaatttaaatatt
aaagaccaggctaaatgagatgctattattaaaagcttaactccaagtcaaggttcaccc
gaaccattatacatttgaacggatattggccaatttatcgatgaattgcgccatgatact
gataatattcaagcgattgctactaattttaatgttaacattttacccaacctaagcgga
actgataatatcaatgttcgtagtatttttgatgttagttacaaagatgctgggcaaggg
ggaattattgtttatcgaaacttactagatttagcaactagtggaatgagtcatcctgaa
ttagttaaagtaatgcaagaagatagtttccgctttaccactgtttccttaggcaaacta
gtaattgatcccaatgataagaaagcaattaaaaatcaatacattgacccgttacgaaaa
tatttaactggaattgtcaactatactccgcaattaaaagataaatataaaaaatacatt
attaactataatgccattaataaaggagcaacaccaggcttaaattcaaaccaaattgcg
acttcgactgataccgaagcacgaacaattagcaacttggttaatggggggctaagtggt
ttaaaatttgttgttcggggtcataccacaattccgccggttgtttcgcgcaacatttta
aatgtttcaatgattgtgttaggaattattgctgctgcgatttgtgtttatttattaatt
tactatcgtttgtttggttttgtggcaattctaaccttagcctttactattattttaact
ttatatttctcatctttattaggagtccaaatttctccggaaagtatcaccgctgttata
attgcctttggaatcgctttagaaggaaatctcttgttattttcgcgttataagcgtgag
cgatatcaaaatggcttgccttatgagccagcgatgaaaattgccaataaacaaacggtt
gctgtttttgtggatgccttagttgttttattagtattaggattatcattattctgagca
ggaactaacaatattaaatcatttgccacaatcttattagttgccttaataatttcgtta
gtaatggtctttgctgtggctcgtattatgtactggattattattaaacttcgttgacaa
gaaaaagtaacatggttagatattccccgcttttcattgttgacttatttccaacaaaaa
aaacatacgcaccaagtggtaaatggggaaggccaattactaagtgattgtttctttgcc
ttaccaacaaccgatgttaacgaagcaactccaagtgagtcagaccaacccaaaaaacct
cacaagttaagattcaaaccaaaattttcattatataatattactaaatattcaccaatt
gtgggaattatcttaattatcattgcattaattattgggtttgccggaaaagcaaatatt
gatagtacgattaaaccgggaactaatattaccgtcgctagtgatatttgacgtcatcgc
gatgatgccgctgcggaaattcaagagatgactcaagaattaaaacatttacaagcaacg
cgtggttataattttagttttaatttatatgtcattaaagccgatgatatgtcaatgggc
caacaattattagttattagtactaatatttctggaagtaattttgcccgcgaattacta
tcatcaattgcgggatattatggactaactcccgaggatccggtctttaaattagaaaaa
acatcaccggtgatggaaacctacattttaaaaactgcggggattagtttagcaattgga
attgcttgcatctttgtttatacattattccgattagactgagcacaatttattggaatt
ttatttgcggctgtctttaccttagcagttagtgtttcaattatagtaattgcccatatt
ctcttaacctttgaaatgagtattgcctttattgcgatctttggttttgcatgagcgatg
ggagcgattgtaatggcctgggcaaaacaaaacaaaaaactggttaatattaaagaatat
gaaactttctttacatatatgagtgagcaccgtgcccaagtccgccgtttgcgccgggcg
aaaaaagtttacatgcaagaagaaattaaaaaattaatgattgccaacctgaatttaaaa
caaaaagaagtgaagaaagaatttgctgaacatctaaaaacccaatgaaaaattgcgaaa
gatttagcagctaaaaataaaaaagaaattaaattaattaataaagaatttcgtaagtat
aattatacgcataactttttacaaaaaattgctaatttaacaattaaacaaatgctacgt
cattgtttaaccctaggagccatatttacaattattttaattatcttatctgccttttcg
ggaagtgtctttggttttaacattactgttttcattggtttagcaattgggatgtttagt
gtgttattcttggcgattcctatttgagtagcgttagaaaaatatcgggcattaaataaa
atccgggttaaaaattatttagactcgcagcgagttgaaattgatgaacaaattgttgct
ggtgttaatgactag

DBGET integrated database retrieval system