Sulfurospirillum barnesii: Sulba_1369
Help
Entry
Sulba_1369 CDS
T02139
Name
(GenBank) filamentous hemagglutinin family N-terminal domain protein
KO
K15125
filamentous hemagglutinin
Organism
sba
Sulfurospirillum barnesii
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
sba00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
sba00536
]
Sulba_1369
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
sba00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Microbial pathogens
Sulba_1369
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TPS
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AFL68658
UniProt:
I3XXI4
LinkDB
All DBs
Position
1338109..1343313
Genome browser
AA seq
1734 aa
AA seq
DB search
MNFRQIISISISLLLVSNQTLYAAGITVDTSAAKAHQAELIKAPSGLPIVNIVTPNAQGL
SHNKFSNFNVEQQGLILNNSKTVANTELAGYISYNPNLTGNAAKLILSEVTGTSKTYLRG
YTEVAGVAADVIIANPNGISVNGGGFINTPNVTLSTGTPMLYQGVLQGFDVSGGNIVIEG
DGFNAHNIAKVNLYAKALELNAKLYADALHVTTGENTIALDGTVSSKEKTSTGLSLDSTL
LGGIYANAITLKSSDKGIGVTLPPEVLAQDSLELDVNGEIIVSKVTAGATTLKAHDAGIK
LQNDISAKTLSIDAGKKLMIEEDKIIEASDALSIIAESILNQGELSALEGKDKSTLKVTQ
SLENEGFIGGYDLDVSATHIENTGAMYSKNALSINAQTLNNDGLIRSNSTLDLLVSNTLT
NQKEGVIYSDGTLTLAANTAQDKSESITNYGLIQSEKNIAIHAKTLNNLASTPTLKDLSS
STSETISRGGKNDFDIVTTSIYKTVVDIPSSPAQIMADGSMLLDLGTLNNVYSLIASDED
IVLNATLANNIGVVLITNTKVVTTQYRDRKKCKRKWHGGKSCKHVADYRGSFTKTENVEE
PIANYGIQAKKSITGNVVTLNNLSAHAGLIGNAEIQAKLATIETIELNTKNLNALSNELT
QNSEGTLDFIIDEASLDETLATLKTLEDLSAYQTELLATKSDIQEILNESKPLVSSLESL
LPTLQTLDATANTAPITTTLETIKANFLSIETHLLALEELSSSLKVVDDANLQKDALLLN
QEALSTLINQNTTLLQALDLSALNTSLESKSDTLRADVGLALAQQSNVEYKIINANNGLY
QTNTHHALSSTKAPTYTTNNSTIIDNITLPKGKYGTFLVNKAHNHPYLIEANPRYTNYNT
FISSDYMLSKLNFKPEQTQKRLGDAMYETQLVSNSIVRLSGSRYLEGYGTELAQFQGLMD
NALSVQKDLGLELGISLSLEQIARLSKNIVWMVEKEVEGEKVLVPEVYLASSNVSSDGAR
IEAGEIHLLIEETLLNNGIIASEGSLKIATGASLTNQNGSITSGETMALSSKGVLENLSG
TIHADGDMTLDAKSIHSTAFSEEKTYTYARGYQRITEQGNAAQFTSGGNLSMQTNDEISL
VNSYIQATNDVTLTSKGTIALSALAKNESYDFKIGGGYNKGYATTHAPSSIEASNITLNA
SALTLNASNLSASDTLRLHATEGVAILTSNDVRYQDTKVKTKGGLFGGKKVKKDEVSTST
VVSSTLSAKTLNIDTSTLSIQGSKLTAEQATIASEIIELISLKNSEYESHFSDKSGFITR
TITSKGHVKEEVVPAIIEVEKQLIINHKDVTQQLQTDNILKTITSQSGLSVEQIKLVEAY
AKSDEWNKKMTTLSGMGSLIIAAVVTICTMGAGGGLVGLGAAQAAATSTAATAAATGTAA
ATAAAASAASALTTATIQAAVVQSIVTQMANTLVTAAITGNSPVIDAASIAKGAVLAGVL
SYANISFATDALKENMSLYDYAKNATIRGTVQGVGSEISGGKFKDGFATGATLSVVSDGA
LQMRQYVKDNFDYAGKDGKPVPENVKSVGVNGDGVKVEGSHPEKVVENGVIIRTKEVIAP
TGGSQMGENLLFGMPIVEGSVTNKTLAYFAGPHDFLSSWNYENINIDGQTLTVLKDNGTL
VNVASGALLIPALPLAAAPFIEKNINEINTINSIQEQESKKAEDFILTNTKDTK
NT seq
5205 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaattttagacagatcatttctatttcgattagccttttgttggtttcaaaccaaacc
ctgtatgctgctggtatcacggtggatacaagtgctgctaaagcccatcaagcagagctc
atcaaagcgcctagtggtctgcctattgtcaatatcgtcacacccaatgcgcaaggactc
tcccacaataaattttcaaattttaatgttgagcaacaaggtttaatcttaaacaactca
aaaaccgttgccaataccgagcttgcaggctatatctcctacaatccaaaccttacaggc
aatgctgctaaattgattttgagtgaagtcactggtacgagtaaaacctatttacgaggc
tatacagaggttgcaggagttgctgctgatgttatcatcgccaatcccaatggcattagt
gtcaatggcggtggatttattaacaccccaaatgtaacgcttagcacaggaacacccatg
ctttatcaaggcgttttacaaggctttgatgtgagtggtggaaacattgtcattgaagga
gatggctttaatgcccacaatatcgccaaagttaatctgtacgccaaagccttagaactc
aatgccaaactctatgctgatgctttacatgtaaccactggtgaaaataccattgccctt
gatggtacggttagctccaaagagaaaacaagcactggactctctttggattcgaccttg
ctaggaggcatttatgccaatgccattacgcttaaaagtagcgacaaaggcattggtgtt
accttgcctcctgaagtgttagcacaagactctttggagcttgatgtcaatggagaaatt
attgtctcaaaggtgaccgcaggtgctacaacccttaaggcacacgatgcaggtataaaa
ttacaaaatgacatcagtgcaaaaaccctctctatcgacgctgggaagaaactgatgatt
gaagaagataagattattgaagcttccgatgcgttgtccatcatcgcagaaagtattctc
aatcaaggcgagctaagcgcacttgaggggaaagataaaagcacactaaaggtgactcag
agccttgaaaatgaaggatttattggtggctatgacctggatgtaagtgccacacacata
gaaaacacaggggctatgtactccaaaaacgctttgagcatcaatgcgcaaacgcttaac
aatgatggcttgattcgaagcaatagcacgctagacctccttgtctccaacaccctgacc
aaccaaaaagaaggggtcatctacagcgatggcacgcttactctcgcagccaacaccgca
caggataaaagcgagagtattaccaattatgggcttatccaatcagaaaaaaatatcgcc
atacacgcaaaaacgctcaataatctcgcctcaacccccaccctcaaagacctctcctct
tctacgtctgaaaccatttcacggggtggtaaaaatgattttgatattgtaacgaccagc
atttataaaaccgttgtcgatataccctcctctcctgctcagattatggcagatggttcc
atgcttttagaccttggcacactcaacaatgtctactctttgattgcctcggatgaagat
attgtcttaaacgcaaccctagccaacaacatcggggtggtgctcattacgaacacgaaa
gtggtgaccacccagtaccgtgaccgtaaaaaatgtaagagaaaatggcatggtggtaaa
agttgtaaacatgtcgctgactatcgaggcagtttcacgaaaacagagaatgtggaagag
cccattgcaaattatggcattcaagccaaaaaaagcattacaggcaatgttgtgacacta
aacaacctcagtgcacacgcagggcttataggcaatgctgagatacaagccaaacttgcc
accatagagaccattgaacttaacacaaaaaatcttaatgccctaagcaatgaattaacc
caaaacagtgaaggcacactggattttattattgatgaggcatctttagatgaaacccta
gcgaccctaaaaacccttgaggatttaagtgcgtatcaaacggagcttttagcgaccaaa
agcgatattcaagagatattaaatgagagcaaaccgcttgtaagttcccttgagtcttta
ctacccacccttcaaacactcgatgcaactgccaacacagcgcccattacaacaacactg
gagacgattaaagccaattttttaagcattgaaacacatctcttagcccttgaagagctc
tcctcttctttaaaagtggtggatgatgccaaccttcaaaaagatgctttacttctcaat
caagaggcactcagtacgctcatcaaccaaaacaccacgttgcttcaagcccttgacctc
tcagcgctaaacacaagccttgaatccaaaagtgataccttacgtgcggacgtaggtctt
gccttagcacaacagagcaatgttgagtataaaatcattaacgccaataacggcttatac
caaaccaatacccaccatgccctctcctccacgaaagcacccacctatacaaccaataac
agtaccatcatcgacaacatcacccttcctaagggaaaatatggcacctttttggtcaat
aaagcgcacaatcatccttatctcatcgaggctaaccctcgctataccaactataacacc
tttattagttcagactatatgttaagcaaactaaattttaaaccagagcaaacccaaaaa
cgcctaggggatgctatgtatgagacacagttggtgagtaacagcattgtgcgtttaagt
gggagtcgttacctagaggggtatggaacagaactcgcacagtttcaaggcttgatggac
aatgcccttagtgtacaaaaagatttaggtttagagttaggtatttccctctcgttagag
caaatagcacgtctttctaaaaatattgtctggatggtagaaaaagaggtagagggtgag
aaggtcttagttcctgaggtctaccttgcaagcagtaatgtcagcagtgatggtgcacgc
attgaagcaggagagatacatcttctcattgaagagaccctgttaaacaatggcatcatt
gcctcagagggttctcttaaaattgccacaggcgctagccttaccaaccaaaacggctcc
atcacctctggtgaaaccatggcgctaagctcaaagggtgtgctagaaaacctaagcggg
actatccacgcagatggcgatatgacactggatgcaaaaagcattcacagtacagccttc
agtgaagagaaaacctatacctatgcaagaggctaccaaaggataacagaacaaggcaac
gccgcacaatttacttcgggtggaaatctttccatgcaaaccaacgatgagataagcctt
gtcaatagctatattcaagccaccaacgatgtcaccctcacctctaaaggtaccatagcc
ctcagtgcccttgccaaaaacgaaagctatgactttaaaattggtggagggtataacaaa
ggctacgctaccacccatgccccctcctctatagaagcatcaaacattaccctcaacgct
tctgcgctaacactcaatgcctccaacctgagtgcgtctgataccctacgccttcacgct
acagaaggagttgccatcttaacctccaatgatgttcgctaccaagatacaaaggtaaaa
accaaagggggattgtttgggggtaagaaggttaaaaaagatgaagtctctaccagtacc
gtggtctcttccaccctcagtgctaaaaccctcaacatcgatacctctaccctctccatt
caaggctctaaactcaccgcagaacaagccactatcgccagtgagattatagagctgatt
tcgcttaaaaacagtgagtatgagagccattttagcgataaatcaggatttatcacacgt
accattacctcaaaaggacatgtgaaagaagaagtggttccagccatcattgaggtagaa
aaacaactcatcattaaccataaagatgtcacacaacaactccaaaccgataacattctt
aaaaccatcacgtcccaatcaggtttgagtgtcgagcagataaaactagtagaagcctat
gcaaagtctgatgagtggaataaaaagatgaccacactcagtggtatgggaagtcttatc
atagcagctgttgttacgatatgtactatgggtgcaggtggtggtttggtaggattaggt
gcggcacaagcagcagccacttcaacagctgccaccgctgctgcaacaggaacggcggca
gcaactgccgcagccgctagtgctgctagtgcccttaccaccgctaccattcaagcagcc
gtggttcaatccatcgtgacacaaatggcaaacaccttagtcaccgctgctatcacaggc
aatagtcccgtcattgatgctgcatctattgccaaaggtgctgtccttgcaggggtactt
agttatgctaatatttctttcgcaacagatgcattaaaagagaatatgagtctgtatgac
tatgcaaaaaatgctactataagaggaaccgtacaaggggtgggttcagagataagtgga
ggcaagtttaaagatggatttgcaacaggagcaacgctttcagtggtaagtgatggtgcg
ctacagatgagacagtatgttaaagacaattttgattatgcaggtaaagatggtaaacct
gtgcctgaaaatgttaaaagtgttggcgtgaatggggatggggttaaagttgagggaagt
catcctgaaaaagtagtagaaaatggcgtaataataagaaccaaagaagtaattgcacct
acaggtggttcacaaatgggagagaacctcctctttggaatgccaattgtggaaggtagt
gttactaataaaacattggcatattttgcaggacctcatgattttctttcaagctggaat
tatgaaaatatcaacatagatggtcaaacactcactgttttaaaagataatggaacacta
gtcaatgtagcaagcggggctttacttattcctgctcttcctttagcagcagcacctttt
atagagaaaaatataaatgagattaatacgataaattctatacaagaacaagaaagtaaa
aaagctgaagattttattttaacaaataccaaggacactaaatga
DBGET
integrated database retrieval system
