Candidatus Sulfurimonas baltica: HUE88_00910
Help
Entry
HUE88_00910 CDS
T07552
Name
(GenBank) tandem-95 repeat protein
Organism
sbal
Candidatus Sulfurimonas baltica
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Cadherin_4
Big_9
NHL
Cadherin_5
SBBP
DUF2808
He_PIG
BBS2_GAE
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QOY52287
UniProt:
A0A7S7RMJ4
LinkDB
All DBs
Position
183066..188573
Genome browser
AA seq
1835 aa
AA seq
DB search
MQVFRLKAFVLMLVLSIALQAGTLLNTSAGTLLNTSIVADDYSTGATTKYKFTYTTQTAF
TYINETAPWYKNSVLFVDFPSQFSFNYTLGVSGDDYTVPCADIIDSITLNGVAVTCVRAR
SFIMGSIRVELAEDISANSTLEVTLKNVTNPTTERIYNFDQVVTQNPWGWEIDFWQSPKV
KISNSVNTAPIITEGTDTQQQTGEDLNVTFTLNATDADSDILSWSILSFPSNGVATVSSN
PDGTSQDITYSPNLNYNGTDSFVVKVDDGQSTDTINVDVNISAINDTPTITSTPITSVVE
NSIYSYTLLGSDVDGDDLNWSVRSNTQLPSWLELNTYSLQSSYLGSGLTVPYDIAIDNSG
KVYITDSFGDKTIDMYDSGSQSSIITGLNMPLGVAVDSNGNVYVSDSMDDVIKKYDGNTV
ETIITGLSGPNGLSIDKDDNLYICDTGNNVIKKYDGNTVETIITGLNTPRHIAVDNDGNL
YITNQGDGEIIKYDGSSTSVVFSGINAPWGIAVDKYNNIYFTDQDNTLKKYNGVETTILK
SGLSSPRGIDLDNQGNIYVAETGKTGFLKIELPKTILSGTPTIADIGVHDVNLTLSDGTN
LTEHNFQITVKNINHAPTASNISFTIDEDSNLNVSDSNFTSIFNDVDANYGDVLDSIVIT
TLPSKGTLKLNSNNVALNQQIAVEDIVNLTFTPAVNEFGTPYDSFGFKVNDGRTSSNSAN
TATINVIAVDDAPTLEAIANKTSIEDGDDLNITLAVNDIEGHPITYIVTSSNPSIATAVV
DANGDLIVTYISDANGLVNFEVNATANGKTATQSFDVAISAVNDTPVIASISDITKDEDF
DTFNVSIAPSDIDSDNLKLSVDMNDSTIISIPTNSTDWIANANYSGGLALSISPIANKFG
TTELNVTVEDPSGEKYSETFSITVTPTDDAPVAFSMAATVGPNSQNTFDTFSPNFSDVDG
HNPIMLKIETLPSVGTFETTTDGGSTWTLIDSVPFEVSMMDLANYRFNAGDNSGLNANVN
WSIMTSIDNTYASGLYSNTATGVVTIIDPANNIAPDVNITSNGVDINNSIVTINEDSKTE
PIYIIFSDDYTPTAFLVGVIDSNDSTKVSLMDGDFNITRISDNNVSVIITPKANVYGDIN
ITLGAFDGDKNGTRSFTLHINTLNDVPTALNFEKVINEDNNYSFATLDPTTVYSDTNDSS
QDANELYPNIFTIVTLPSHGMLHLGDNIALGADTNVSITELPTLVYTPSENNNTDVSFTY
KAYDGEAWTEVKSATIHVTPVDDAPILSTIQSQLLDEDFNVVSLTLISSDVEGDAISYVA
TSSNGEIATVTIVNDKVVITPVENANGTVRVDVNATANGQTTTQSFDVAISAVNDDPAID
TVFANLSLLEDSATANYELNVSDIDGDALTVTMTSSDSGILMVSPNWTNPLDQAAWSQTL
DYNLTTVADANGEVTITVTVRDENDAAVSKTFTVDVTPVNDAPEFAIAETKIVYKNFVDV
NITLLGTDVEEDPLTYTAVIEDDSLASVSFTNNVLIFEAIDGAVGSSDINITLSDGDLNV
SNILHFTVLPLEDGEDVEKVGVVDYESDENGTTTTLSIDNNLTISTKEDTNGTVTHEITV
AGKVITATSDLNGSEVAFTESGVKTTYSDVNLSLEVNASVTGEASHLLTVTGKTTTATSE
KVGASTRIAKDANGSIEIVTSVDVNGTQVSVKAKADGTAEHSVTTPSGRSIATSKVKGAA
TVIKATGEVQTEVGDNTPDADGYVIRAVVVTNTDGTTHTQFEKVSTTDENDREIVSRTLK
ESTEFDAGNSVEIDEINSVLYIKTQANLTTDLVIE
NT seq
5508 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcaagtttttagattaaaagcttttgtacttatgttggtactttctatagctttgcaa
gcggggacgcttttaaatacctctgcggggacgcttttaaatacctctatagtagcagac
gattatagtacaggtgcaactacaaagtataaatttacatatacaacccaaacagctttt
acatatataaacgagacagctccatggtataagaattctgtcctctttgtagattttcct
agtcaattttcattcaactatacgctaggcgtttctggtgatgattatactgtcccttgt
gctgatattatagactctattacattaaatggtgtagctgttacttgtgtacgagctaga
tcttttattatgggtagtatacgagtagaattagctgaggatattagtgccaactcaacg
ttagaggtaacactgaaaaatgtaactaaccctactactgaaaggatatataatttcgat
caagtagtaactcaaaatccatggggatgggaaattgatttttggcaatctcctaaagtt
aagatatcaaattcagtcaatacggcacctattatcactgaaggtacagatactcagcaa
cagacaggtgaagatctgaatgtaacatttactttgaatgcaacagatgctgatagtgat
attctatcttggagtattttatcttttccatcaaatggagtagccacagtaagttcgaat
ccagatggtacatctcaagatattacatattcaccaaatctaaattacaatggaactgat
agctttgtagttaaagtagacgatggacaatcaacagatacaatcaatgttgatgttaac
attagtgctataaatgataccccaactatcacaagtacaccaattacaagcgtagttgaa
aatagtatttatagttatacacttttaggaagtgatgtcgatggtgatgacttaaactgg
agtgtgagaagtaacacacaacttcctagttggttggaacttaatacttatagtttgcaa
tcttcttatttaggatcaggacttactgtcccttatgatattgctattgataatagtgga
aaagtatatattactgattcttttggagataaaactattgatatgtatgatagtggttct
caaagctcaattataacaggattaaatatgcctttaggtgtagcagttgatagtaatggt
aatgtatatgttagcgacagtatggatgatgttattaaaaaatatgatggaaatactgta
gaaactataattacaggattgtcaggcccaaatggtctatctatagataaggatgataat
ctatatatatgtgatacaggaaataatgtcattaaaaaatatgatggaaatactgtagaa
actataattacaggactaaacacaccaagacatatagctgtagataatgatggtaattta
tacataacaaatcaaggagatggtgagattattaaatatgatggttcatcaacatctgta
gttttcagtggtattaatgcaccatggggtattgctgttgataaatataataatatttat
tttacagatcaagataatacgcttaaaaaatataatggagttgaaactactatattaaag
agtggattatcttcaccaagaggtatagatttagataatcaaggaaatatatatgttgca
gaaactggtaaaacaggttttttaaagattgaacttcctaaaactattttatcaggaacc
ccaacaattgcagatattggagtacatgatgtaaacctaacactcagtgatggcacaaac
ctaactgaacataacttccaaattacagtaaagaatataaatcatgcgccaacagcgtca
aatattagctttactatagatgaagatagtaatctaaacgtaagcgattcaaacttcaca
tctatctttaacgatgttgatgcaaattatggcgacgttctagactcaatagtaataaca
actcttccttcaaaaggaacattaaaactaaacagcaacaacgtagcgctaaatcaacaa
atagctgtagaagacatagtaaacttaacgttcactccagcagtaaatgaatttggaact
ccatatgatagctttggttttaaagtaaatgatggaagaactagctctaactcagccaat
acagctacgataaatgtaattgcagttgatgatgcaccaacattagaagccatagcaaat
aagacaagtattgaagatggtgatgatttaaacatcactctagcggtgaatgatatagaa
ggtcatcctattacttacatagttacctcttcaaacccttcaatcgctacagcagtagta
gatgcaaatggtgacttaattgttacatatatttcagatgcaaatggtttagtaaacttt
gaagtaaacgcaactgcaaatggaaaaactgcgacccaaagctttgatgttgcaatttcg
gctgtaaatgacacgcctgtcattgcatctatatctgatataaccaaagatgaagatttc
gatacatttaatgtatctatcgctccatcagatatagatagtgataacctaaaactatct
gtagatatgaatgatagtacaatcatatctataccaactaactctacagattggatagca
aatgcaaactacagtggcggtcttgcattgtcaatttcaccaattgcaaataaatttgga
acaacagagttaaatgtaactgtagaagatccaagtggtgaaaaatatagtgagacattt
agcattacagtaactccaacagatgatgcaccagtggctttttctatggcagcaacagtc
ggacctaactctcaaaatacttttgatacattttcaccaaactttagtgatgttgatgga
cacaatccaattatgttaaaaatagaaactttaccatctgtaggaacatttgaaactaca
acagatggaggctctacatggactcttatagattcagttccatttgaagtatccatgatg
gatcttgcaaactacagattcaacgctggagataattcaggactgaatgcaaatgttaat
tggtctattatgacaagtatcgataatacatacgcaagcggtctttattcaaacactgca
acaggtgttgtgactattattgatcctgcaaacaacatcgctcctgatgtaaatataact
tctaacggagttgatataaataactccatagtaactataaacgaagattcaaaaacagaa
ccaatctatatcatattcagtgatgactacactcctactgctttcttagtaggtgtaatt
gattctaatgattcaacgaaagtatcattaatggatggagactttaatatcactagaatt
agtgataacaatgtatctgttatcatcaccccaaaagcaaatgtatatggagatataaac
ataactctaggcgcatttgatggagataaaaatggcacgaggtcatttacacttcatatt
aatactctcaatgatgttccaacagctcttaactttgaaaaagtgattaatgaagataat
aactacagtttcgcaacattagatcctacaactgtatatagtgatacgaatgattcatct
caagatgcaaatgagttgtatcctaatatctttactattgtaactctaccttctcatggt
atgttacatctaggagataatatagctctaggtgcagatacaaatgtaagcattacagag
ttaccaactcttgtatatactccaagtgaaaataacaacacagatgtaagcttcacatat
aaagcatatgatggtgaagcatggacagaagtgaagagtgcaactatacatgtgactccg
gtggatgatgcacctatactaagtactattcaaagccaacttttagatgaagacttcaat
gtggtaagtctgacacttatatcaagtgatgttgaaggagatgcgattagttacgtggca
acttcgagtaatggtgaaatagctactgtaactatcgttaatgataaagtagtaataaca
cctgtagaaaatgcaaacggaacagtgcgagtggatgtaaacgctacagcaaatggacaa
actacaacgcaaagctttgatgttgcaatttcagctgtaaatgatgaccctgcaatagac
acagtctttgcaaatctttcactcttagaagatagcgctacagccaactatgaacttaat
gtgtcagatatagacggcgatgcactaactgtaacaatgacctcaagtgactctggcatt
cttatggtttcaccaaactggacaaaccctttagatcaagcagcatggagtcaaacactt
gactacaacctaacaactgtagcagatgctaatggtgaagtgactattactgtaactgta
agagatgaaaatgatgcagcagtatctaaaacttttacagtagatgtaactcctgtaaat
gatgcaccagagtttgctatagctgagactaaaatcgtttataaaaactttgtagatgta
aatataactcttcttggtacagatgtagaggaagatcctcttacatacactgcagtaata
gaagatgattctcttgcaagcgtgtcatttactaataatgttcttatcttcgaagctata
gatggagcagtaggctctagtgatataaatattactctaagcgatggagatttaaatgta
tcaaatatacttcactttactgtcctaccactcgaagatggagaggatgtagagaaagtt
ggagttgtagattatgagtctgatgaaaatggtacaacgacaacactcagcattgacaat
aatcttacgatttctactaaagaagacacaaacggaacagtaacccacgagataacagtg
gctggaaaagttataacagctacttcagatctaaatggttcagaagtagcctttacagag
agtggagtaaaaacaacatactcagatgtaaatctatctctagaagtaaacgcaagcgta
acaggagaagcaagccatctattaacagttactggtaaaacaacaacagcaacttcagaa
aaagtaggcgcttcaactcgtattgctaaagatgcaaatggttctatagagattgtaact
tcagtagatgtaaatggaactcaagtatccgtaaaagcaaaagcagatggaacagcagag
catagtgttacaactccaagcggtagatctatcgctacctcaaaagtaaaaggcgcagct
acagttattaaagctacaggtgaagtacaaacagaagttggcgataacactccagatgca
gatggctatgtcataagagcagtagtagtgactaacacagatggaacaacccatacacag
tttgaaaaagtaagtactacagatgagaacgatagagaaattgtctcaagaacactcaaa
gagtcaacagaattcgatgctggaaacagtgttgaaatagatgaaattaatagtgtttta
tatattaaaacacaagcaaacctcactacagacttagtgatagagtaa
DBGET
integrated database retrieval system