Sphingobacterium bambusae: SCB77_03195
Help
Entry
SCB77_03195 CDS
T09645
Name
(GenBank) VCBS repeat-containing protein
Organism
sbam
Sphingobacterium bambusae
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
FG-GAP_3
FG-GAP
DsbD_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WPL49456
LinkDB
All DBs
Position
complement(731834..733624)
Genome browser
AA seq
596 aa
AA seq
DB search
MASAQNEPRTYGIPVIPKPVNTAIAGAPVLGQPTLVNGTLQDIRTEKHGLAYPTLYDWNG
DGKLDLIVGEFETGETGSNIKVYLNIGTKKKPKFTGEYFYAKDTNGNTISNHQWCCMGIH
PRVVDINGDGYLDILSGQYNPGKVSLWAGSMDGFQKRVFVEQAGYEDGQMNENYDASDPR
SNDYWNYTSVSFADFNGDGLSDMFVGGFGELRVALNEGTKEHPKFGLRKNILGIDGFPIS
VIKPTKEQIDKAFAEYKAPHYAGVYKSFITPVDWDGDGILDLLVTHLYGNKKAKDPVVFF
RGVQTDKGLRFEDAKALFTLPDAYKTFPGCQPNISVVDYNNDGVNDLLIGISIPTVNGFE
VDSLTTWGYLNDFGIEAPGKDAGLAIAWSGGLDSLKLKVASNPLLKDYYMGKLTDQKYLT
LRHRGFIYVMLGERNKSTAIPIRGVIAHEEIMPPQRELKQKGGHEQVSYEVTTPTYIHSL
DTFDVRVMVTFERDWYGYASTDANLKAGWIPTVINLQLPKEFEKVGPLQTPASHRKGPSD
VYTGQVSFVQRVRAIDTNVKAGEYNFAVDIEYQSCNSMQCLPPQQAHIDLSINYLK
NT seq
1791 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcctcagctcaaaacgaacctcggacatacggaatcccagtgattccaaagcctgtc
aacaccgctatcgcgggagctccggtacttggtcagccaactttggtaaacggaacctta
caagatattcgtaccgagaaacatggtctagcatacccgacgctttatgattggaatggt
gatggaaagctcgatttgatcgtaggcgagtttgagactggcgagactggatctaatatt
aaagtgtacctaaatattggtactaagaagaagcccaagttcacaggtgaatatttctat
gcaaaagataccaacgggaatacgattagcaaccaccaatggtgctgtatgggaatacat
ccccgtgttgtcgatatcaatggagatggatatttggatatcttaagtggtcagtacaat
cctggaaaggtatcgctttgggcaggatctatggatggattccaaaagcgggtatttgtg
gagcaagcggggtacgaggatgggcaaatgaacgaaaattatgacgcatccgatccacgt
agcaacgactactggaactatacctccgttagtttcgcagatttcaatggtgatggtcta
tcagatatgtttgtcggtggatttggcgaattgcgtgttgcactgaacgaagggacgaaa
gagcatcctaagtttggtcttcgtaaaaatattttaggtatcgacggctttcctatatct
gtaatcaagcctacgaaagagcaaattgataaagcttttgccgaatataaagctccacac
tacgctggagtatacaaaagttttattacgccagtagattgggatggtgacggaattttg
gacttattggtcacgcatctttatggaaacaaaaaggccaaagatccagtggtgttcttt
cgtggggtacaaaccgacaaaggtctgcgttttgaagatgcgaaagccttatttacactc
ccggacgcttacaaaacatttcctggttgccaacctaatatatcagtggtggattacaac
aacgatggtgttaatgatctattaataggcatatctattcctactgttaatggttttgag
gtagattccttgaccacatgggggtatttaaacgattttggtatagaggcacccggcaaa
gacgcaggtttggccattgcttggtcaggtgggttagacagtttaaagttgaaagttgct
tccaatcctttattgaaagattattatatgggcaagctgacagaccaaaaatatttaaca
cttcgtcaccgaggctttatctatgtgatgcttggtgagcgaaataagtcaactgcaata
cccattcgtggagttattgcgcacgaggagattatgcctcctcagagggaattgaagcaa
aaaggaggtcacgaacaagtgtcgtatgaggtaacaactcccacctatattcattccttg
gatacatttgatgtccgtgttatggtgacgttcgaaagggattggtacggatatgcaagt
acggatgccaatttaaaagctggatggattcctacagttatcaatttacagttacccaaa
gagtttgaaaaggtaggtccattacaaactccagcatcacaccgtaaaggaccaagcgac
gtatatactgggcaagtgtctttcgtgcagcgcgtccgtgctattgatactaatgtaaag
gcaggagaatacaactttgctgttgatattgagtatcagagctgtaatagtatgcagtgc
ttgcctccacaacaagcacacatcgatctttcaatcaattacctaaagtaa
DBGET
integrated database retrieval system