Segatella baroniae: L6469_08590
Help
Entry
L6469_08590 CDS
T09580
Name
(GenBank) SusC/RagA family TonB-linked outer membrane protein
Organism
sbao
Segatella baroniae
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Plug
CarbopepD_reg_2
CooC_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UKK77810
LinkDB
All DBs
Position
1:complement(2002243..2005404)
Genome browser
AA seq
1053 aa
AA seq
DB search
MEKRLMTFFACLFLSLGMALAQTQASGTVLSSEDGEPVVGASLKIVGTKIGAVTDIDGHF
SVVVPTGSKLEVSYLGMITKVVSASSNMTIKLDPDNKVLDEVVVTAMGVSRDKKALGYAA
QSLNASELNKAGTSSLASAMQGKLTGVDIRTSSGAPGASAQITIRGARSFDGNNTPLYVV
DGMPISSQADYSTGNSVTGADQASRTIDINPEDIESINILKGQAASALYGIRASNGVVLI
TTKRGHKQSNKPVITFSTDLSAQTVSRKFKHQDVYAQGNSIDAYNPNASMTWGPKISELA
NDPTYGGNTNNKYTNGDLTSHAGQYYNPKYASAGLDGWTTPQTYDNVSDFFRTGFTQNST
FNISQMKNDVSYSFSISDTYQNGIIPSTGMTRTGARGAVDWKVNDQWKTGFSANYSAVKI
TSAPGANNGIMNVVYSAPAEYNLKGTPYSVPGDPTSQVLFRSTTFNNPYWWADNDEFSQH
TNRVFGNAYAEYRPKFNWDTDKYNLVFREQAGIDVYTTNNSTVAEIGSAYNNKGEVENYG
VQVNIFNNLFTANFTAKWGADKEWDFGFLLGNEFNHESKRYWDYDGSGLAFYGQPVIGNT
TSIDIHSEYNHQERTVGTFGQLSLSWKNMLFFTTTGRNDIVSTMPRGNRSFFYPSVSLGW
IFTEIPALKSDFLSYGKLRTSYAQVGQAGQFYSNYMYVPSYGSGMYIYTPISYPLGGATA
YSPYYVKFDENLKPQNTSNWEMGLDLGLLKNRVKVEYTLSYQDVKDQIFDVPTAGSTGYQ
YLRTNAGRMTTWAHELSVKAAIVESKDWNVDLGVNFTSVNNKVKELAEGVESIMLGGFVE
PQIRAQAGYTYPNIYGYAFKRAEDGQLLLVDGLPQATSASVNLGECTPDFNMGFNLNVNY
KRLNLAATLDWQKGGRMYNGTILTMNYFGATEESLPYHEGTMVAEGIDEATGQKNTVEVS
KQEYYQAYNDVTEAGIFDTSYLKLRDLTLSYNLPKFAGIDMSVYAFARNILLWSKMPNLD
PESSQGNGNMSGYFERFSVPNTSSFGGGFRITF
NT seq
3162 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaaaaaagactcatgacttttttcgcctgcttattccttagtttaggaatggctttg
gctcagacacaagcctcaggtaccgtactttctagtgaagatggagaacccgttgttggt
gcttcactgaagattgtgggtactaaaataggtgcagtgaccgatatcgatggtcacttc
tcagttgttgtgcctacaggtagcaaacttgaagtatcttacttaggtatgattactaag
gtggtttctgcttctagtaacatgaccatcaaacttgatccagacaataaagtgttggat
gaagttgtagttacagctatgggtgtttcacgcgacaagaaagccttaggctatgctgct
cagtcattgaatgccagcgaattgaacaaggctggtacatcttctttggcaagtgccatg
caaggtaaacttactggtgttgatattcgtacttcatcaggtgcacctggtgcttctgcc
cagattacaattcgtggtgcacgttctttcgatggtaacaatactccattgtatgtagtt
gatggtatgcctatttcttctcaggctgactatagtactggtaactctgtaaccggtgct
gaccaggcaagtcgaactattgatatcaacccagaggatatagagtctatcaatatcttg
aagggtcaggcagcttctgctctttatggtattcgtgcttctaatggtgttgttttgatt
actactaagcgtggtcacaagcagtctaacaagccagtgattactttctctacagatttg
agtgctcagactgttagccgtaagttcaaacatcaggatgtttatgctcagggtaacagt
atagatgcatataatccaaacgcttcaatgacatggggacctaagattagcgaattggct
aatgacccaacttatggtggtaatactaataataagtataccaatggtgatttgacttca
catgctggtcagtactataatcctaaatatgcatctgccggtttagatggttggactact
cctcagacttatgataatgtaagtgatttcttcagaactggtttcacccagaactctacc
ttcaacatctctcaaatgaaaaatgatgtaagctactcatttagtatcagcgatacttat
cagaatggtatcatcccttctacaggtatgacccgtactggtgctcgtggtgctgtagac
tggaaggtgaacgatcagtggaagacgggtttctcagctaactatagtgcagtgaagatt
acctctgctcctggtgctaacaatggtattatgaacgtggtttactctgctcctgctgag
tataatttgaagggtactccttacagtgttcctggtgaccctaccagtcaggtcttattc
cgtagtactacatttaataacccatactggtgggctgacaatgatgagttctctcagcac
accaaccgtgtatttggtaatgcatacgcagagtatcgccctaagttcaattgggataca
gataaatataacctcgttttccgtgagcaggctggtattgatgtctatactaccaacaac
agtacagtagctgaaatcggttctgcttataacaataagggtgaagtagagaactatggt
gttcaagttaatatcttcaacaacttgtttactgctaatttcacagctaagtggggtgca
gataaagaatgggatttcggtttcttgctcggtaacgagttcaaccacgaaagcaagcgc
tattgggattacgatggttcaggtttggctttctatggtcagccagttattggtaacacc
acttctatcgatattcattcagaatacaaccatcaggaacgtaccgttggtacttttggt
caactctctttatcttggaagaatatgttgttcttcacaacaacaggacgtaacgatatt
gtttctactatgccacgtggcaaccgttctttcttctatccatctgtatcattgggttgg
attttcacagagattcctgctttaaagagtgatttcctctcttatggtaaattgcgtacc
tcttatgctcaggtaggccaggctggtcagttctacagtaactatatgtatgtaccttct
tatggtagtggtatgtatatctatactcctatttcttatcctcttggtggtgcaacggct
tattctccttactatgtcaagtttgatgagaatttgaagccacagaatacttctaactgg
gaaatgggcctcgacttaggtctcctcaagaatagagtaaaggtagaatacaccttgagt
tatcaggatgtaaaagaccagatctttgatgttcctactgctggttctacaggctatcag
tatcttcgtaccaatgctggtcgtatgacaacatgggctcacgagctttctgttaaggct
gctattgtagaaagtaaggactggaatgttgacttaggtgttaactttacttcagtaaac
aacaaggttaaggaactcgctgagggtgtagaaagtatcatgttaggtggtttcgtagag
ccacagatacgtgctcaggcaggttacacctatcctaatatctatggttacgcattcaag
cgtgcagaagatggtcagttgctcctcgtagatggtcttccacaggctacttctgccagt
gtaaacctgggtgaatgtactccagactttaacatgggcttcaacctgaatgtaaactac
aagcgtttgaatcttgctgctacattggattggcagaaaggtggtcgcatgtacaacggt
actatcttgaccatgaattatttcggtgcaacagaagaatctcttccttaccatgaaggt
actatggtagctgagggtatcgatgaggcaactggtcagaagaataccgtggaggtaagc
aaacaggaatactaccaggcttacaacgatgttactgaagcaggtatcttcgatacaagt
tatttgaaacttcgcgacttaaccttgtcatacaatttgcctaagttcgctggtattgat
atgtctgtatatgctttcgcaagaaacattctgttgtggtctaagatgcctaaccttgat
cctgaaagttcacagggtaatggtaacatgagtggttatttcgagcgtttctctgtacct
aacacttcaagctttggtggtggtttcagaattacattctaa
DBGET
integrated database retrieval system