Segatella baroniae: L6469_12420
Help
Entry
L6469_12420 CDS
T09580
Name
(GenBank) pectinesterase family protein
Organism
sbao
Segatella baroniae
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Pectinesterase
Pectate_lyase_4
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UKK79945
LinkDB
All DBs
Position
2:complement(563063..566413)
Genome browser
AA seq
1116 aa
AA seq
DB search
MKHFTRINTLVLFLLCLFVNTVHASTITALWDFQNMNPSSLSGIKIEGTETHVASSNSSI
NMFVIAKSGKFAVRTSDVQMNANTYLRIPVQSTKDVITIVSYPGYHNYTINGTAATANTT
THTATASEVTQGYVQVQATSTTYLYSIKLVQTVSNTTTATWDFQNVNPSALSGLTIEGTS
GHIPSTLSDVNIYCIGAYGKFAQRTSDAQVNAKTTLRIPVTSTSDVVTVTSYPGYHNYAL
GGTAVSSDKVTHTATATEVSQGYVVLYTSATSYLYSIQVAMQNYTGSGTATSSTSSNSSS
SSSSTGSTDNTTTASGNFTAVSQEYYVVTAGSASSFLSALSKANSSTSSSRKYIFLPNGT
YDLGTTCLTAITGSNISIIGQSMEGTIIKNTPAVANEGISTTATIINKGNNNYFQDLTLK
NALDYYNAGSAGRAVALQDKGTGTICKNVCLDSYQDTYYSNNTNGQYYFEGSTIYGTVDF
ICGSGDAFFNNCTLGVRKRTSNGSGSCVIAAPYTSTSWGYVFNNCTISNAAASYSLGRAW
GGSPKLAYINTVLTDPTNILSTRFTTAGMNVVANKFVEYNSKNTSGTTVSPSSNIVSFTY
GSTTNKMETILSDSKAAGYALSKVFTSWTPNEDAAQLTVNKVSQSGSKISWSAVSGASSY
AIFKDDKYVAIVGSGTTSYTISATGTYSVRASNPMGGFGTAASVKVTSISSSSTSGSSTT
TSGMSSYDQNAPIGWATYGGSVTGSSDKNTVTVTTADELVSALAGTSATTIYVKGTLTFT
GQLTVNGAKNKTVYGLPGSALSNPTHTSTVSKTGILFLKNCSNIILRNLTFKGAGAYDID
GNDNLTLQNCQYIWVDHCDFQDGVDGNFDANNGSNNIAVTWCRFRYLITPWAGGSGGSDK
HCFSNLWGGSDKNASKDEGKLNTTFANCWWDEGCIERMPRVRFGKIHIVNCLYSSSVASY
CIGAAYKSNIYVENTAFTSSKAQKNPWANKATSSGYTDYNITLTGCSGATNTQSRSGSNS
YFNPSSYYSYSAYDVSKVESQVSTYAGATLSISVNAKSNLLNATITAINSVEGDATATAV
EYYNANGIKSNNLQPGLNIIRTTYSDGTITIKKVMQ
NT seq
3351 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaacattttacgcgaatcaacactttggtgttatttttgctgtgcctgtttgttaac
acggtacacgcctcaactatcacggcgctctgggattttcagaacatgaatccatcctcg
ctctccgggattaaaatcgagggcacagagacccacgtggcttcttctaattcatcgatt
aacatgtttgttatcgccaaaagcggtaagtttgcagtccgcacgagtgatgtacagatg
aatgctaacacgtatctgcgcatacctgtacagagtaccaaagacgtcatcactatcgta
agttacccaggttatcacaactatactattaatggtacagcagctactgctaacacaaca
acccatactgcgactgccagcgaagtaacacagggatatgtgcaggtacaagctacttct
accacctatttgtatagtatcaaactggtacagacggtatccaataccaccacagcaaca
tgggatttccaaaatgtaaacccttcggcactaagtggactaaccatcgaaggaacaagc
ggacatataccatctactttgagcgatgtgaatatctactgcataggtgcttacggtaag
tttgcccagcgcacaagcgatgctcaggttaatgccaagacaaccctccgtattccagtt
accagcaccagcgatgtcgttaccgttacaagctatccaggctatcacaactatgcactt
ggcggaacagcagtaagcagcgataaagttactcacactgctaccgctacagaagtatct
caaggctatgtcgtactctatacttcagctaccagctatctgtatagcattcaggtagcc
atgcaaaactataccggttcgggtacagcaacatcttccacttcatcaaacagctctagc
agcagttcaagcacaggatcaacagacaacacgacaacagccagtggcaacttcaccgca
gtaagtcaagaatattatgtagtaacagctggtagcgcaagcagttttctgtcagcactg
agcaaggctaacagcagtacctcttcatcacgtaagtatatcttcctgcctaatggcacc
tacgatctcggtaccacctgccttaccgctatcaccggtagcaacatctctattatcggc
cagagtatggaaggtaccattatcaagaatacacccgcagtagccaatgagggtatcagc
accactgccaccattatcaataaaggtaacaacaactatttccaagatcttaccctcaag
aatgcactcgattactataatgccggcagtgccggtagagctgtagccttacaagataaa
ggtacaggtaccatctgtaagaatgtatgtctcgattcttatcaagatacctattattct
aacaacaccaacggacagtattatttcgaaggcagtaccatttacggtacagtagacttt
atctgcggtagcggtgatgccttcttcaataattgtacccttggcgttcgcaaacgtacc
tctaatggttccggtagttgtgttatcgcagctccttacacttctacctcatggggatac
gtattcaataattgtaccatcagcaatgctgctgccagttatagtctggggcgtgcctgg
gggggcagtcctaaactcgcctatatcaacaccgtattgacagaccctaccaatattctc
tctacccgattcacaacagcaggtatgaatgtggtagctaataagtttgtagaatacaac
tccaagaataccagcggtaccaccgtttctccttcttctaatatcgtcagctttacctat
gggtctaccaccaacaagatggaaacgatactctctgatagcaaagcagcaggctatgcc
ctaagcaaggtatttaccagttggactcctaatgaggatgcagcacaacttacggtgaac
aaagtatcacagagtggcagcaaaatcagctggagtgccgtcagcggtgccagttcgtat
gccatcttcaaggatgacaaatatgtagctatcgtaggcagcggaacgacctcatacacg
atttcagctaccggtacttattccgtacgcgcttctaatccgatgggaggattcggtaca
gcagccagtgtcaaggttaccagcatcagcagtagttctacgagcggttcatctaccact
acctcaggaatgagcagctatgatcagaatgcacctataggatgggccacttatggcggc
agcgtgaccggttcaagcgataagaataccgtaaccgttacaacagcagacgaattggtt
tcggctttagcaggcacatctgcaacaacaatctatgtgaaaggcacccttacctttacc
ggccagcttactgtaaatggtgccaagaacaaaaccgtatatggtcttccaggcagtgca
ttgagcaaccctactcatacttctactgtgagtaaaaccggtattctcttcctcaaaaac
tgttctaacatcatacttcgcaaccttacattcaagggggcaggtgcctatgatatcgat
ggtaatgacaaccttaccctacaaaactgtcagtatatctgggtagaccactgtgatttt
caggatggtgtagacggcaacttcgatgccaataatggaagtaataatatcgctgttacc
tggtgccgtttccgttatcttatcacaccatgggccggaggttcaggcggttcagacaag
cactgcttctctaatctttggggaggaagcgataagaatgcatctaaagacgaaggtaaa
ctcaataccacattcgctaactgttggtgggatgaaggttgtatcgagcgcatgcctcgc
gtacgatttggcaagattcacatcgtcaactgtctttactccagcagtgtagcatcttac
tgtatcggtgcagcctacaagagcaatatctacgtggaaaatacagcctttaccagcagt
aaggctcagaagaatccatgggctaacaaagctacctctagtggttataccgactataac
attacgttaacaggatgtagcggtgctaccaatacccagagccgttcgggcagcaatagc
tactttaatccttccagctattatagttatagtgcttacgatgtcagcaaggttgaatca
caggtaagtacctatgcaggtgccaccctgtctatttcagtcaatgccaagagcaatctg
ctgaacgcaaccatcacagcaatcaactctgtagaaggcgatgcaacagctaccgctgta
gaatattacaatgccaacggcatcaagagtaataaccttcagcctggtcttaacattatt
cgcacaacctatagcgatggtaccatcactatcaagaaggttatgcaataa
DBGET
integrated database retrieval system