Fluviispira sanaruensis: JCM31447_23340
Help
Entry
JCM31447_23340 CDS
T05949
Name
(GenBank) epimerase
KO
K20534
polyisoprenyl-phosphate glycosyltransferase [EC:2.4.-.-]
Organism
sbf
Fluviispira sanaruensis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
sbf00001
]
09180 Brite Hierarchies
09181 Protein families: metabolism
01005 Lipopolysaccharide biosynthesis proteins [BR:
sbf01005
]
JCM31447_23340
Lipopolysaccharide biosynthesis proteins [BR:
sbf01005
]
O-antigen repeat unit
JCM31447_23340
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Epimerase
GDP_Man_Dehyd
Glycos_transf_2
3Beta_HSD
RmlD_sub_bind
Glyco_tranf_2_2
Glyco_tranf_2_3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BBH53881
UniProt:
A0A4P2VLV5
LinkDB
All DBs
Position
complement(2716224..2718167)
Genome browser
AA seq
647 aa
AA seq
DB search
MLDLMKLRGPILILGASGFIGANLFKRLNALRNDVYGTSSKENPWRLSDVQNKENILIFN
LRINENLFELFEKTQPQTIFNCIAYGAYHFENNPELIYETNFLITLRILNYLEKNKFSAY
IHSGSSSEYGDNSAGPSENDFPLPNSHYAVSKVACSNLILFYGKKKKLPIANLRLYSVYG
PLEDPSRLIPNIVHKALENSYPPFVNKDISRDFIYIDDVCNAFISAALNLEEDSYGESFN
IGFGQEVTIEKIAHEAKIAFSIPTDPIFGNTESRHWDNVNWFANIEKTKLKLNWQPKTSL
QQGLLKTADWLKTVENWENLEKKSKKYLLNKTYSTSVIIACYKDNLAIPLMYARLTETLS
QLNIEYEIIFVNDGSPDNTEEVIRNISAKDPNVMGITHSRNFGSQAAFQSGMKIARMNSC
ILMDGDLQDPPEIIPQFIEKWREGFDVVFGIRVKREAPFFMQIAYKLFYRIFSYFSYVYI
PKDAGDFSLIDKKVVSWILKFSERDVFLRGIRAFVGFKQTGICYLRPERAFGKSTNNLLK
NLNWAKKGILSFSYVPLSFLTFCSIIIFSASLLVSLVHIFLKLIFPEIAPQGITTVMILV
IFFGSSILISVAFIGEYIAKIFEEVKARPKYIRKSIIQNGSVKNISE
NT seq
1944 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgttagatctaatgaaattgagaggacctattttaattttaggagcaagtggtttcatt
ggtgcaaatctttttaaaagattaaatgcattgagaaatgacgtctacggcacttcaagc
aaagaaaatccatggagactttctgatgttcaaaataaagaaaatattttaatatttaac
ttgcggataaatgaaaatttatttgaattatttgagaaaactcagccgcaaacaatattt
aattgcattgcatatggtgcgtatcattttgaaaataatcctgaacttatttatgaaacg
aattttttaataactcttagaattttaaattatttagaaaaaaataaattttctgcatat
attcactcaggaagctcttccgaatatggagataattcagcagggcccagtgaaaatgat
tttccgctaccgaatagtcattacgcagtttctaaagttgcgtgctctaatcttattttg
ttctatggaaaaaagaaaaaacttccaattgcaaatttaagattgtactctgtctatggt
cctttggaagacccctctcgattaattccaaatattgtccataaagcgcttgaaaattca
taccccccttttgtgaataaagatatctcaagagattttatttatatagatgatgtctgt
aatgcgtttatatccgcagcattgaatttagaagaagattcttatggagaatcttttaat
ataggttttggccaagaagtgacaatagaaaaaatagcgcatgaagcaaaaatcgctttt
tcaattccaaccgatcctatctttggcaatactgagagtaggcattgggacaatgtaaat
tggtttgctaatattgaaaaaacaaagcttaaactcaattggcagcccaaaacttcttta
caacaaggtttattaaaaacagctgattggctgaaaactgtagagaattgggaaaactta
gaaaaaaaatctaaaaaatatttgctgaataaaacgtatagtacttctgttataattgct
tgttataaagataatttagctatcccattgatgtacgcaagattaacagaaacacttagt
caattgaatattgaatatgaaatcatttttgttaatgatggaagtcctgataacactgaa
gaagtaattcgaaatatatcagctaaagatccaaatgttatgggaataacgcattctcga
aattttggttcacaagcagcatttcagagtgggatgaaaattgctcgaatgaattcatgt
attttgatggatggtgatttacaagatccacctgaaattatcccccaattcatagaaaaa
tggagagaaggattcgacgtggtttttggcattcgagtgaagagagaagcgccttttttc
atgcaaattgcttataaattattttatagaatttttagttatttttcatatgtatacatt
ccaaaagatgcaggggattttagtcttatagataaaaaagttgtgagttggatattaaaa
ttttctgaacgcgatgtttttttacggggcataagagcatttgttggttttaaacaaaca
ggtatttgttatttaaggccagaaagagcatttggcaaatcgaccaataatctattaaaa
aatttgaattgggctaaaaaaggtattctctcatttagctatgtcccactcagcttttta
accttttgctcgataattattttttcagcttcattattagtatctcttgtgcatatattt
ttaaaattaatatttccagaaattgctcctcaaggaataacaacagtcatgatattggtg
atattttttggctcttctattttaatttctgttgctttcattggtgaatatattgcaaaa
atatttgaagaagttaaggcaagacctaagtatataagaaaatcaattattcaaaatggc
agtgtaaaaaatataagtgaataa
DBGET
integrated database retrieval system
