Shewanella bicestrii: CF168_20270
Help
Entry
CF168_20270 CDS
T05197
Name
(GenBank) two-component system sensor histidine kinase/response regulator
Organism
sbj
Shewanella bicestrii
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
CHASE
Response_reg
PAS_9
PAS_4
PAS
PAS_3
HATPase_c
HisKA
PAS_8
PAS_7
Hpt
PAS_10
PAS_11
HATPase_c_3
Response_reg_2
ACAS_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ASK71025
UniProt:
A0A220USC3
LinkDB
All DBs
Position
complement(4630809..4635692)
Genome browser
AA seq
1627 aa
AA seq
DB search
MTLSMSYKQASKWGFFVLLVGLFFSAVLAWQVSRINSQTISLALEASAQQISENVTNRIA
LYQYGLRGARGMILTAGEDHISRPMFQNYSLTRDVDEEFPGARGFGFIRRVSKENEAQFL
ARVKAVDWPDYHVRQLNPNEGEKYLIEYIEPLERNKAAVGLDIASEAHRKEAADRAMLSG
EVQISAPITLVQATGKPLQSFLILLPVYRTGIVPPTPEERLAQGFGWSYAPLVTTEILTG
LSLNQKMTKLMLSDVTDDKQPINFFETHANDLSPLSDYSYKLNKTIFGRHWQFEVMAYPG
FIKSLHLNKPSLVLLSGSLFSVLLAALIAMWSLTLQRKQQVLAEQARRASMLEHSLDGII
SYDLAGNITSWNQGAERLFGYTEQQALGLPSSELIIPPSIVLEEQALMADVLTGKTVLNR
VSRHQRADGSNLSTSTTTLPIYDEHGDIVGLSQTIRDITAQQDAERHILNLNASLERQVT
KRTHALQQALLENQALLDTINQQLHYSVTDLDGVILDVNEHFCLISGYAREELIGQTHSV
LKSGEHDAAFWQRMWQQIKAGKSWHGEICNQGKDQQLKWFDTVIGPVFDERGKVERFVAL
QTDITERKLAQLEKNRIATLLTNVLDAASEMTIIAADPQGIITIFNRGAERMLGYSAEEV
IGKTTPAPFHIADEIAARATELSVEYGQKIQGFDTFVHKAREEGSETRTWTYVRKDGSQL
PISLSVTAMRGNDGEILGYLGIGVDISQIVAQQEALLTASNHLSKAAEVAKLGIWTWNLL
DNSLQWNDRMFAMYDQPESLKQQGLSYEHWRMRVHPDDVEEAEEKLNRAVEYDEPYHPIF
RVLTTDGAVRYVQAGAQIERDRQGNVIRVIGINIDITAQRQIEANLRSAKLEADNANAAK
SAFLANMSHEIRTPMNAVLGMLQLMQYTSLSVQQQGYVNKAQTAAKSLLGLLNDILDFSK
IDAGKLKLDPHPCSIELLMRDLAVVLSASHNNTDVEVMFDLDAALPPWLLADQLRLQQIL
INLAGNALKFTPHGQVIVGLECIRHEADTVTVQFSIVDSGIGISEEQIERIFTGFEQAES
STSRRFGGTGLGLAISKRLVELMGGQLQVTSKVGVGSRFWFDLTFQVMEVEARARADLSQ
YRILVVDDNQITTEILSKILSDYGCLVETASGGYQAIEKVKQANAAGQQFDVVLMDWRMP
DIDGLQTAEMLKNAGTGSYTPLVVMLTAYGHEVIAESQHINNVPFVNFLTKPVTSQVLVE
AVLNAIEGKTMDSNPKPRSQRLLAGLTLLVVEDNQLNREVIEELLSYEGATVVLAGGGVE
GVAQVLESGDLYDAVIMDVQMPDIDGLEATRRIRADGRFAQLPILAMTANASQTDKQECL
EAGMNAHVGKPIDMQLLLPNILRLVGRDVTSLEQHESAHLDSQHNLEGETLLDDIRLILR
RFGGNQVFFEKMASSFAPEMTKQLSLFKQSTKTFDYATTAAISHAIKGIASNFGARRLAV
HAAFLEKQFKQEGLELLEIKRWTDTLESLIHQSIEQLAGFLPKGQLKQPQSIEPVNGTAV
DMQSVRPELDTLAALLQENNLEAVNLVDKLAKPLSQHPQWAELNGLVQSLAFTQALETLR
AMMLEDV
NT seq
4884 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaccctgtcgatgagttacaagcaagcctccaagtggggatttttcgtcttgctcgtg
ggacttttttttagtgccgtgctcgcttggcaggtgagtcgtatcaattcgcaaaccatt
tctttggcgctcgaagcgagcgcgcagcagattagtgagaatgtcaccaataggattgcc
ctctaccaatatggcttgaggggcgcccgaggcatgatcctcacggcgggtgaagaccat
atcagccgccccatgtttcaaaactatagtctgacgcgggatgtggatgaggagtttccc
ggcgcacgcggatttggctttattcggcgggtctccaaagaaaacgaagcgcagttttta
gcgcgggtaaaggcggtcgattggcctgactaccatgttcgtcagctcaaccccaacgag
ggggagaagtatcttattgaatatattgaaccgctcgagcgcaataaggcggcggttggt
ttagatatcgcctcagaggcccacagaaaagaggccgccgatcgcgccatgctgtcggga
gaagtgcaaatttccgcgccgattaccttagtgcaggccacgggtaagccgctgcaatcc
ttcttaattttattacctgtttaccgaacgggtattgtccctccaactccggaagagcga
ttggcccaagggtttggttggagttatgcgccgctggtgacgaccgaaattttaacggga
ttatcgctgaatcagaaaatgaccaagctgatgttaagcgacgtgacggacgataagcag
ccgatcaatttcttcgaaacccacgccaatgatttaagcccgctatcggattacagctac
aagttaaataagacgatttttggtaggcattggcagtttgaggtaatggcctatccaggt
tttatcaagtcattacatctcaataaacccagcttagtgttgctcagtggcagcttgttc
agtgtgttgctggcggcgttgattgctatgtggtccttaaccttgcaacgtaaacagcaa
gtgttagccgagcaagcgcgccgcgccagcatgttggagcattccctcgacggcattatc
agttatgacctcgctggcaatataaccagttggaaccaaggtgctgaacgactctttggt
tacacagagcagcaggcgctgggcttacccagtagcgaattgattattccacccagcata
gtgctggaggaacaggctcttatggccgatgtgttgaccggcaagacggtactcaatcga
gtatcgcgccatcaacgcgccgatggcagcaacctgtcgacctcgaccactaccttaccg
atttacgacgaacatggcgacatagtgggtttgagtcaaaccattcgggatatcacggcc
cagcaggatgccgagcgacatattctcaaccttaacgctagccttgaacgacaggtgacc
aagcgtacccatgctctgcagcaggctttactcgagaatcaggcactgctcgataccatc
aaccagcagctacattactcggtcaccgacttagacggggtgattttagatgtgaatgag
cacttctgtctgatcagtggctacgcgcgggaggagttaataggtcaaacccactcagtg
ctgaaatctggcgagcacgatgccgcgttttggcagcggatgtggcaacagattaaggcc
ggtaaatcttggcatggggaaatctgtaaccaagggaaagatcagcagctgaaatggttc
gatactgtgattggcccagtcttcgatgagcgtggcaaagtggaacgttttgtcgcgctg
caaaccgatattaccgagcgtaaattagcacagctcgaaaaaaatcggatagcgactctg
ctgaccaatgtgctggatgcggcctccgaaatgaccataattgccgccgatccacagggc
attatcactatcttcaaccgcggtgccgagcgcatgttagggtattccgccgaagaggtc
ataggcaaaaccaccccagcacctttccatattgccgatgaaattgccgcccgcgccacc
gagctttctgttgaatacggccaaaaaattcaaggttttgacacctttgtccacaaggcg
cgggaagagggctccgagactcgtacttggacctatgtgcgtaaggatggtagccagtta
ccaatctcactgtcagtaaccgcgatgcgtggtaatgacggtgaaatcctaggttacctt
gggattggtgtggatatttcgcaaattgtcgcccagcaagaggccttactcacggcgagt
aatcacctcagtaaggcggcggaagtggctaaactggggatttggacctggaacctgctc
gataactcgttgcagtggaacgaccgcatgtttgccatgtatgaccagcctgaaagcctt
aaacagcaaggtcttagctatgaacattggcggatgcgtgtccatcccgatgacgttgaa
gaggccgaagaaaagcttaaccgcgcggttgagtatgatgaaccttatcatccaattttc
cgcgtgttaaccacggatggtgcggtgcgctatgtgcaggcgggtgcccaaattgagcgc
gacaggcaagggaatgtgatccgagtgattgggatcaacatcgatattaccgcccagcgg
cagattgaggcgaatttaaggagtgccaagctggaggcggataacgccaatgccgctaag
tcggcgttcctagccaatatgagccacgaaatccgtacccccatgaatgcggtgttgggg
atgttgcagttgatgcaatatacctcgctctcggtgcagcagcagggctatgtgaacaag
gcgcaaacggcggctaagtcattgttagggctgcttaacgatattttagacttctcaaaa
atcgatgcgggcaaattaaaactcgatccacacccttgctcgattgagttattgatgcgg
gatctggctgtggtgttatcggcgagccacaacaataccgatgtggaagtgatgttcgat
ctcgacgcggcgttgcctccttggctgctggccgatcaattaaggctgcagcaaattctg
atcaacctcgcgggcaacgcactcaagtttacccctcacgggcaagtgattgtcggccta
gaatgtattcgccatgaggccgataccgtcactgtgcagttttcgattgtcgatagtggt
attggcatcagcgaagagcaaattgagcggattttcactgggtttgagcaggctgaatcc
tcaacctcacgccgttttgggggcacgggacttgggctggctatcagtaaacgtcttgtc
gagttaatgggcggacaactgcaagtcaccagtaaagtcggggttggtagtcgcttctgg
ttcgatttgaccttccaagtgatggaggttgaagcccgcgcccgcgccgatttgagccaa
tatcgcattctggtggtcgacgataatcaaatcacgaccgagatcttatcgaaaatcctc
agcgactatggctgtctggttgaaaccgcttctggcggttatcaggccattgaaaaggta
aaacaggccaatgcagccggacagcagtttgatgtggtgctaatggattggcgtatgccg
gatatcgacggtctacaaaccgctgaaatgctgaaaaacgccggaaccggcagttatacc
ccgctggtggtgatgttgacggcctacggccatgaagtgattgccgagagtcagcacatt
aacaacgttcccttcgtcaacttcttaactaaacctgtcacctcgcaagtgttggttgaa
gccgtgctcaatgccatcgaaggcaagaccatggactcgaatcctaagccgcgctcacag
cgtctgttagcggggctcactctgttagtggttgaggacaatcaattaaaccgtgaggtg
attgaggagctgttgagttatgaaggcgccaccgttgtgctcgcaggtggcggtgtggaa
ggggtggcacaggtactcgaaagcggtgatttatacgatgccgtgattatggatgtgcaa
atgcccgacatcgatgggttagaggcgacgcggcggatccgtgccgatggtcgattcgcc
cagttgcctatcctcgcgatgacggccaatgcctcgcaaaccgataaacaagaatgcctc
gaggcggggatgaatgcccacgtcggtaagcctatcgatatgcagctgctgttgccgaat
attctgcgtctagtggggcgtgatgtgacatccctcgagcagcatgagtctgcgcatctc
gactctcaacacaatctcgagggcgaaaccctgctcgacgatattcgtttgatcctgcgc
cgttttggtggcaaccaagtgtttttcgaaaaaatggcgagcagttttgcccccgaaatg
accaagcagcttagcttgttcaagcaatctaccaaaacctttgattacgccaccacagct
gcgatcagccatgcgattaaaggcattgccagcaactttggcgcgcggcgtttagccgtt
catgcggcgtttttagaaaaacaatttaaacaagaaggcctcgagctgctggaaataaaa
cgctggacggatacactggagtccttaatacatcaaagtattgaacagcttgcaggcttt
ttacctaaggggcagctcaaacagcctcaatcgattgaacctgtaaacggtaccgccgtg
gatatgcagagtgtgcgccccgagctggataccttggctgctctcttacaggaaaataat
ttagaagccgtgaatttagtcgacaaactcgcaaaaccgctatcacagcacccgcaatgg
gctgaactcaatggactggttcaatcactcgcatttacacaggctttggagactttgcgg
gcgatgatgttggaggatgtgtag
DBGET
integrated database retrieval system
