KEGG   Shewanella benthica: SHEWBE_2213
Entry
SHEWBE_2213       CDS       T06707                                 
Name
(GenBank) Sensory box protein
Organism
sbk  Shewanella benthica
SSDB
Motif
Pfam: EAL GGDEF PAS_3 Y_Y_Y PAS_9 PAS PAS_4 Reg_prop Beta-prop_HVO_0234 PAS_8 Beta-prop_EML
Other DBs
NCBI-ProteinID: SQH76179
UniProt: A0A330M0J4
LinkDB
Position
SHEWBE:complement(2072704..2077059)
AA seq 1451 aa
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NT seq 4356 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
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DBGET integrated database retrieval system