KEGG   Shewanella benthica: SHEWBE_3316
Entry
SHEWBE_3316       CDS       T06707                                 
Name
(GenBank) YD repeat protein (fragment)
Organism
sbk  Shewanella benthica
SSDB
Motif
Pfam: RHS_repeat TEN_YD-shell
Other DBs
NCBI-ProteinID: SQH77279
UniProt: A0A330M3J0
LinkDB
Position
SHEWBE:complement(3186517..3189366)
AA seq 949 aa
MTHPEGALGRFDIKEQCHNQTEVPKIRRLSINNYSSVFDDYFVLPGSVLYSLSRKTLTFQ
NQQTYVWNYNYSQTRHAFKGEELTSSHRLDVDFYGNDNAHLKSTTVTNPDGSQKSMYFER
RYAHGHDLLFSEWYSSNGSLKMRESYKYIDGYNPGQTGIYFYAGSARDPYTMADLVSAKT
PQSLTTEIKKELFDELGDSTTYQEKRTDFNQYDIYRQTEIFNSFSSNKRYIKTEFKHDTS
QWLLNFPTKHYASTSSSFDAPYKETIYNSKLQPYQEKTMGKLISTKTYHIDGTLKKRTYN
GSSRYEQFDDYYRGKARKVTLPCAITNGCNTANGSGANTMIAKLEVNGDSSTKSVTDFNG
YKTSYSYNPIGWLTKVDYADGKWSDKVISYATVTTANDGIAGSGIVAGQLKQTITQGNFE
QKIYHDDLLRPTFTRTHDNADSSTISYQRTDYDHDNRPTLQTFPSSSASNTIGMTTEYDA
LGRVITSTRLSDNAFTTVEYLSGNKKRVTDAEHNATTTTYLAYGSPSYDKPTLIEAPDTS
NTAIAYNTFGQVTSITQGSVTEKRLYDSYQQLCKTYRPETGVTAYGYNAQRQPLWHAEGT
NGGSSSCAASSVPESHKVHLGYDNLGQLRTQNFPDSSPDNTYGYDANGNLASLVSGSGSG
AISWSYLYNSLNLIEKETLSIDSKNFVLDWAYNNLGAVSSLKYPTGRTISYSPNALGQPT
KASEGSGSATVNYASNVKYYPNGQLKQMTYGNGIVRDISLDTSGRIAAIMDVKSGSQRLD
LDPRYDKNDNLVGLIDWRDRSNDIDNMSYDGLDRLKSANGKWGSGNYTYDGLGNIKTRSI
SGSSITYHYNSANRLNNLTGAYAYSYGYDPRGNVTHNGRYSLSFNRANQLTAAKGLAYRY
DGHNRRVKKQGDYSVYSQAGQLLNRISAINVNTDVIYLSDKIIAEIDKN
NT seq 2850 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgactcacccagaaggagcgctgggtagatttgatattaaagagcagtgtcataatcaa
accgaggttcctaaaattaggcgtttgagtattaataattattctagtgttttcgatgat
tattttgtacttcctggttctgttttgtactcactcagtagaaaaacgctaacgtttcaa
aatcaacaaacttatgtatggaattataattactcacaaacacggcatgcgtttaaaggt
gaagaattaacctcttcacacaggttagatgttgatttttatggtaatgataatgcccac
ttaaaatctacaactgtaaccaaccctgatggttcccaaaagagtatgtattttgaacgt
cgttatgcgcatggacatgatttgctatttagcgaatggtattctagtaatggtagttta
aaaatgagagagagttataagtatattgatgggtataatcctggtcaaacagggatctat
ttttatgcaggaagtgctcgtgacccatatacgatggctgatttggtttcggctaaaact
ccacaaagtttaacaacggaaattaaaaaagaactatttgatgaactcggtgatagtaca
acctatcaagaaaaacgcactgattttaatcaatatgatatttatcgacagacagaaata
tttaatagttttagtagcaacaagaggtatattaaaactgagttcaaacatgatacaagt
caatggctgcttaacttcccaactaagcattatgctagtacttcatcaagcttcgacgcc
ccctataaagaaactatttacaatagtaagttgcagccctaccaagaaaaaacaatgggc
aagttaatatctacaaagacttatcacatcgatggaactcttaaaaaaagaacttataat
ggctctagtcgctatgagcagtttgatgactactatcgcggtaaggcccgtaaagtaacc
ctaccttgtgctatcactaatggctgtaataccgcaaatggtagtggcgctaatactatg
attgccaagcttgaggtgaatggtgatagtagcactaaaagtgttactgactttaatggt
tacaaaaccagttacagctataatccaatcggttggttaacgaaggttgattatgctgat
ggtaaatggtcagacaaagtgatcagttatgccacggtaacaaccgccaatgatggtata
gcaggcagtggtattgtggcgggacaattaaaacaaactattacgcaaggtaattttgag
cagaagatatatcatgatgatttattgcgccctacgtttacaaggacgcacgataatgca
gatagctcaaccattagttatcagcgtactgattatgaccatgacaatcgcccaacgctg
caaaccttccctagcagtagtgccagtaataccattggtatgactactgaatacgatgca
cttggacgagttataactagcacgcgcctaagtgataacgctttcactacagtagagtat
ttaagtggtaataagaaaagagtcacagatgctgagcataatgccaccacaacgacctat
cttgcctacggtagtcctagctacgataaacctacgctcattgaggctcctgacacaagt
aacacggcgattgcctataatacgttcgggcaagtaacatccattactcaaggtagtgtc
actgaaaagcgtctatatgatagttatcagcaactgtgtaaaacctaccgccctgaaacg
ggcgtaacggcctatgggtacaatgctcagcgtcagcctctttggcatgcagaaggaact
aatggtggcagtagtagttgcgccgcatcttcagtgcctgaatcccacaaggtgcattta
ggctatgacaatttaggccaacttagaacccaaaacttcccagattcaagccccgataat
acctatggctatgatgccaatggtaatttagcttcgttggtctctggcagtggtagtggt
gcgattagctggagttacctgtataactcactcaacctaatagagaaagaaacgctatct
attgacagtaaaaacttcgtgcttgattgggcttataacaatctaggcgctgtctcgtca
ctgaaatacccaacaggaagaaccatcagttattcgcctaatgcactaggccaacccaca
aaagcgagtgaagggagtggtagtgcgacggtgaattatgccagtaacgtgaagtactac
ccaaatgggcagttaaagcagatgacctatggtaatgggattgtccgtgacattagctta
gacaccagtggtcgcattgctgccatcatggatgtaaaaagtggcagtcaaaggttagac
ctagacccacgctatgacaaaaatgataacctagtcggtttaatcgactggcgtgaccgc
agtaatgacattgataacatgagttatgacggactagatcgtctaaaatctgctaacggt
aaatgggggagtggtaattatacctatgacggtttaggtaacattaaaacccgcagtatc
agcggttcatctatcacttatcactataatagcgctaaccgtttgaataaccttacggga
gcatatgcctacagctatggttatgaccctcgaggtaatgttacccacaatggtcgctat
agtttgagctttaaccgtgccaatcagttaacggcagccaaaggattagcttatcgctat
gacggtcataatcgtcgagtgaaaaagcaaggtgattacagcgtttacagtcaagcaggg
caattactaaatagaatttcagcaataaacgttaacacggatgtcatatacctgtctgac
aaaataatagctgaaatagataagaattaa

DBGET integrated database retrieval system