Shewanella baltica OS185: Shew185_2578
Help
Entry
Shew185_2578 CDS
T00571
Name
(GenBank) diguanylate cyclase
Organism
sbm
Shewanella baltica OS185
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
GGDEF
dCache_1
Tup_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABS08713
LinkDB
All DBs
Position
3070816..3073050
Genome browser
AA seq
744 aa
AA seq
DB search
MCHNHRQLTQANFQRDFSLHLPAFQTAHLRLAIILGVFGLVLNLFPIPLFANVQLILGNV
AVVIVAILLGPWYALITALFTATGLMIVWSSPHVYLLFLLEALWLGFARRRDIQILYASV
SYWVLLGIPLLAIYVAVIAKMPASHIPFTAIKQAVNGMIYAAIGELCVVAIPSLWHFKGK
LTNLNRRTFSSQLSYLFTLIITVSLLVSSLAFNHFFIDKQQVMINRNLDDTATHLSHATD
NYLAYNTQVIASTAKFLSLSNAGINEWQALLSSVHDSNQGFKTMLLANEQGNLLAASPMA
SIVEFDRLAEIPSVMDREYFTQAFYNHKTFVSPAFIGRGFGNDVIVAISAPIFSQNDPNQ
ARGIVEGSLDLRYFSSIDKQNLHHEQQSILLTDENNNLIYASEGLGLAPLTPLSFSKGSE
IYRAQLQLMNLHNLDSNTPEYIYAQHKLNNGWQLYVLEPFVPLLKLAERQYVNTVILLFC
SLVGAFFITKAISKLLTEPLSLLAQHFGPAKQEKASDEKFEHDLLDKSTPKEIYSLYESL
ASNQQALLEHQQELEQKVQQRTQDLEAANVKLKDLAERDPLTNLYNRRYTEHQFPLIQQM
CERGQDAMTLAILDLDHFKQINDTYGHLGGDECLKVVAELLTSLFKRDIDLISRYGGEEF
LLILPMCNALKVEAHLNEFKQQLAGTVIINPQDHRSFNVTASIGAVIANATYSDSLEYWL
KQADNNLYLAKEQGRDRVVCSLIV
NT seq
2235 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgtgccataatcacagacagttaacacaagcaaattttcaaagggacttttctttgcat
ttacccgccttccaaaccgcccatctcagactggccattattctgggggtattcggctta
gtcctgaatctttttcccatccctttattcgctaatgtgcaattgattctcggcaacgtg
gccgtggtgatagtggcaatactcttagggccttggtatgcattgatcaccgccctattt
accgcaacggggctcatgatcgtgtggtcgagcccccacgtgtatttactgtttttactg
gaagcattatggcttggttttgcaaggcgccgagacattcaaatactctatgccagtgtg
agttattgggtgttattggggatcccgctgttagccatttatgtggcagtcattgctaaa
atgcccgctagccacattccttttaccgcgatcaaacaagcagttaatggcatgatttac
gctgcaattggtgaactctgtgtggttgctattccaagcctatggcattttaaaggcaag
ctgaccaatcttaaccggcgtacttttagctcgcagctcagttacttgtttaccttaatt
attactgtgagcttattggtctcatccttagcttttaatcacttttttattgataaacaa
caagtgatgattaatcgcaatctggacgatacagcaactcatttgagccatgcaaccgac
aactacctcgcttacaacacgcaagtcatcgctagcacggccaagtttttgagtctgtcg
aacgctggtatcaatgagtggcaggcattactgtcgagcgtacacgatagtaatcaaggc
tttaaaaccatgttactagctaatgagcaaggcaacttactcgctgccagtccaatggcc
agtatagttgagtttgatcgcctagcagaaatcccttctgtgatggatagggagtacttt
acccaagcgttttataaccataaaacctttgtatcacccgcgtttatcggcagaggtttt
ggtaatgacgtaatcgttgccatcagtgccccgatttttagtcaaaatgaccccaatcaa
gccagagggatagtcgaaggcagcttagatttacgctatttttccagcatagataaacaa
aacctgcaccatgagcagcaatctattttactgacagatgagaacaataatctgatttat
gcctccgaagggttaggactagcaccgctcacccccttgtcattcagcaaaggcagtgag
atttatcgcgcccagcttcaactgatgaacctgcataacctagattcaaatactcctgag
tacatctatgcccagcataagttgaacaatggttggcaactctatgttttagaacctttt
gtgccgcttttaaaactggctgaacgccaatatgtcaacacggtaattttgctgttttgc
tccttagtcggtgccttttttattactaaagccatcagtaagttactgaccgaacctctg
tcgcttttagcgcagcatttcggtcccgctaagcaagaaaaagccagtgacgagaagttt
gagcatgatctactcgataaaagcacccctaaagaaatctatagcttgtatgaaagtttg
gcctcgaaccaacaagccttactcgaacaccaacaagaacttgaacaaaaagtacagcag
cgcacccaagatttagaagccgcaaatgtgaaattaaaggatttagccgagcgcgatccg
ctgacgaatctctataatcgccgctataccgagcatcaatttccacttatccaacagatg
tgcgaacggggtcaagatgccatgacgcttgccatattggatttagaccattttaagcaa
atcaatgatacttatggccatttgggcggcgacgagtgtttaaaagtggttgctgaactc
ttaacctcgctcttcaagcgagatattgatttgatctcgcgctacggcggcgaagaattt
ttgctgattttacctatgtgtaatgccttgaaagtcgaagcacatctcaatgagtttaaa
cagcaactcgcaggcactgtgatcatcaatccgcaggatcatcgaagctttaatgtcacc
gcgagtatcggcgctgtgattgccaatgccacctatagcgactccttagagtactggctt
aaacaggccgacaataacttgtatctggcaaaggaacaggggcgtgatcgggttgtttgc
agcctgattgtttaa
DBGET
integrated database retrieval system
