Candidatus Shikimatogenerans bostrichidophilus: NHG07_00620
Help
Entry
NHG07_00620 CDS
T10143
Name
(GenBank) glutamate--tRNA ligase family protein
KO
K01886
glutaminyl-tRNA synthetase [EC:
6.1.1.18
]
Organism
sbos Candidatus Shikimatogenerans bostrichidophilus
Pathway
sbos00970
Aminoacyl-tRNA biosynthesis
sbos01100
Metabolic pathways
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
sbos00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
00970 Aminoacyl-tRNA biosynthesis
NHG07_00620
09180 Brite Hierarchies
09181 Protein families: metabolism
01007 Amino acid related enzymes [BR:
sbos01007
]
NHG07_00620
09182 Protein families: genetic information processing
03016 Transfer RNA biogenesis [BR:
sbos03016
]
NHG07_00620
Enzymes [BR:
sbos01000
]
6. Ligases
6.1 Forming carbon-oxygen bonds
6.1.1 Ligases forming aminoacyl-tRNA and related compounds
6.1.1.18 glutamine---tRNA ligase
NHG07_00620
Amino acid related enzymes [BR:
sbos01007
]
Aminoacyl-tRNA synthetase
Class I (A)
NHG07_00620
Transfer RNA biogenesis [BR:
sbos03016
]
Eukaryotic type
Aminoacyl-tRNA synthetases (AARSs)
Multi-aminoacyl-tRNA synthetase complex (MSC)
NHG07_00620
Prokaryotic type
Other AARSs
NHG07_00620
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
tRNA-synt_1c
tRNA-synt_1c_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WGH28185
LinkDB
All DBs
Position
complement(92285..93646)
Genome browser
AA seq
453 aa
AA seq
DB search
MKNFITKIIDNDIKNGLPKKKLKFRFSPEPNGILHIGHIKAIYINFKLAKIYKTKINLRF
DDTNPKNENYKFIKKIINDIKWLGFKYNKITFTSDYFSILYKWSKNLIKKGKAYIQKKTN
NKIYNIININDNLHLFKNMKKGKYKENNYILRAKINIKSKNYYLKDPIMYRIINKPHFKT
NNKWYIYPTYDWAHGQSDYIEKISHSLCSIEFQNHKKLYNWFLNKIYNKKYNKIKPKQIE
FSRLNIIDSITSKRKLYILKKKKIINNYNDPRLCTINSFKKRGYKKKFLINFIKKIGYSK
RENNISINVLETNIKKYLIKKSPKLMVIFNPIKITIINLPKKSIKWIYIKDKKIKNRIIP
LTRKIYIEKNDFKKNKNNNFYRLNLINYVRLKYYNIIKIVKIINNKIYCKLYNNNKILNK
KIKSTIQWISTKYYKKINILLYNYIYYKIIIYF
NT seq
1362 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaattttattactaaaattattgataatgatataaaaaatggtttaccaaaaaaa
aaattaaaatttagattttcacctgaacctaatggtatattacatataggacatataaaa
gctatatatataaattttaaattagcaaaaatatataaaactaaaataaatttaagattt
gatgatactaatccaaaaaatgaaaattataaatttataaaaaaaataataaatgatatt
aaatggttaggttttaaatataataaaataacttttacttcagattatttttcaatttta
tataaatggtcaaaaaatttaattaaaaaaggtaaagcttatatacaaaaaaaaacaaat
aataaaatatataatattattaatataaatgataatttacatttatttaaaaatatgaaa
aaaggtaaatataaagaaaataattatattttaagagctaaaataaatattaaatcaaaa
aattattatttaaaagatcctattatgtatagaattattaataaacctcattttaaaact
aataataaatggtatatatatcctacttatgattgggcacatggacaatctgattatata
gaaaaaatatcacattcattatgttctattgaatttcaaaatcataaaaaattatataat
tggtttttaaataaaatatataataaaaaatataataaaattaaacctaaacaaattgaa
ttttcaagattaaatattatagattcaataactagtaaaagaaaattatatattttaaaa
aaaaaaaaaattataaataattataatgatccaagattatgtactataaattcttttaaa
aaaagaggatataaaaaaaaatttttaataaattttataaaaaaaataggttattcaaaa
agagaaaataatataagtataaatgttttagaaacaaatataaaaaaatatttaattaaa
aaatcaccaaaattaatggtaatttttaatcctataaaaataacaataattaatttacct
aaaaaatcaataaaatggatatatattaaagataaaaaaataaaaaatagaataatacca
ttaactagaaaaatatatatagaaaaaaatgattttaaaaaaaataaaaacaataatttt
tatagattaaatttaataaattatgtaagattaaaatattataatattataaaaattgtt
aaaataataaataataaaatttattgtaaattatataataataataaaattttaaataaa
aaaattaaatcaactattcaatggatatcaactaaatattataaaaaaataaatatatta
ttatataattatatttattataaaataataatttatttttaa
DBGET
integrated database retrieval system