Candidatus Shikimatogenerans bostrichidophilus: NHG07_00965
Help
Entry
NHG07_00965 CDS
T10143
Symbol
dnaE
Name
(GenBank) DNA polymerase III subunit alpha
KO
K02337
DNA polymerase III subunit alpha [EC:
2.7.7.7
]
Organism
sbos Candidatus Shikimatogenerans bostrichidophilus
Pathway
sbos03030
DNA replication
sbos03430
Mismatch repair
sbos03440
Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
sbos00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03030 DNA replication
NHG07_00965 (dnaE)
03430 Mismatch repair
NHG07_00965 (dnaE)
03440 Homologous recombination
NHG07_00965 (dnaE)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03032 DNA replication proteins [BR:
sbos03032
]
NHG07_00965 (dnaE)
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
sbos03400
]
NHG07_00965 (dnaE)
Enzymes [BR:
sbos01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.7 DNA-directed DNA polymerase
NHG07_00965 (dnaE)
DNA replication proteins [BR:
sbos03032
]
Prokaryotic type
DNA Replication Elongation Factors
Elongation factors (bacterial)
DNA polymerase III holoenzyme
NHG07_00965 (dnaE)
DNA repair and recombination proteins [BR:
sbos03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
MMR (mismatch excision repair)
DNA polymerase III holoenzyme
NHG07_00965 (dnaE)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DNA_pol3_alpha
DNA_pol3_finger
HHH_6
DUF2161
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WGH28198
LinkDB
All DBs
Position
151671..153599
Genome browser
AA seq
642 aa
AA seq
DB search
MKKKNIIIKNKNKKKDNYYLFNKDFYFKKYSEIKKKFKDLKKGFINLNKIYKKIKFFNIK
KKNLLPNFKLPEKFKKKIKLKNKNYYYLKYITFKGAKKKYLILNNKIKKRIKKELNIIKK
KNFENYFLIVYDIINQAKKKKIFIGPGRGSVAGSIIAYCIDITKIDPLKYNLIFERFLNI
DRVKMPDIDIDLENKDRNKIILYLKKKYGFFNVSNIITYGKIGSKLAIKDTARVLNLSLN
KVNKLSKNLIKKFTLKEMLDNNLNFFYNKLSYKDINKLIILKKIYNNKNSLESKVLYNAK
FLEGIIRNTSIHACGIIISKEKLINNIPIMYNKKNNILLTQYDTYSIEKIGLLKIDLLSL
KILTIIKNTIKKIKKKEKFNINDKKTLNLFRKGNTIGIFQYDSLGMRKYLKNLKPNNFND
LISLNALYRPGTIKYINNFILRKNGKEKILYDLPVMKKYLKETYGITVYQEQVILIARKL
SGISKIKADNIREAIGKKKINKLKNLKKLFFKNSIKKGYLLKILKKIWKDWENFALYAFN
KSHATCYTYISFQTAFLKTHYKIEYMCSLLSNNIYKYKNLKIFLKESKNLNIKFLKPDIN
ISKKNFLIENNKIRFGMGGIKGIGNITINYIINERKKKFYLL
NT seq
1929 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
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cttttatag
DBGET
integrated database retrieval system
