Candidatus Shikimatogenerans bostrichidophilus: NHG07_01060
Help
Entry
NHG07_01060 CDS
T10143
Symbol
dnaB
Name
(GenBank) replicative DNA helicase
KO
K02314
replicative DNA helicase [EC:
5.6.2.3
]
Organism
sbos Candidatus Shikimatogenerans bostrichidophilus
Pathway
sbos03030
DNA replication
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
sbos00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03030 DNA replication
NHG07_01060 (dnaB)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03032 DNA replication proteins [BR:
sbos03032
]
NHG07_01060 (dnaB)
Enzymes [BR:
sbos01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.3 DNA 5'-3' helicase
NHG07_01060 (dnaB)
DNA replication proteins [BR:
sbos03032
]
Prokaryotic type
DNA Replication Initiation Factors
Initiation factors (bacterial)
NHG07_01060 (dnaB)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DnaB_C
DnaB
ATPase
AAA_25
DUF2115
NTPase_1
AAA_19
NPHP3_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WGH28203
LinkDB
All DBs
Position
complement(169484..170761)
Genome browser
AA seq
425 aa
AA seq
DB search
MVNRKSLEKVINILKSNYFYNKKNKIIFKYIKKIFYEYKRIDLSNLILYLKKDDKLNLIG
GEYYISYIIQKLTSFYNIKKYVKILINKYILRKLIKLSINIINNNYNNYNNYDIIKLLDY
IQIYIVNLSKKYVKNNIKNFKYLFIKTYKKIKNNYFEKKSLFIPSGFKKLDKIILGFQKS
DLIIIASRPGMGKTSFALSLIKNLIEKNIGVGFFTLEMSNTQIIIRLISLMTNITYDKLK
TFNLNKSEINYLKNNFKKFKNYNLFIDDSPTLSILDFKKKCKILINKNNVKIIIIDYLQL
INIKNDNFKFFNREQEISIISRSIKYIAKELKISIIALSQLSRAVEIRGGYKIPLLSDLR
ESGAIEQDSDIVLLLYRPEYYGFKYWYNDNTLCSGEAEIIIAKHRNGKLGNIKLKFIKEI
AMFKN
NT seq
1278 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
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gcaatgtttaaaaattaa
DBGET
integrated database retrieval system
