Candidatus Shikimatogenerans bostrichidophilus: NHG07_01120
Help
Entry
NHG07_01120 CDS
T10143
Symbol
gyrA
Name
(GenBank) DNA gyrase subunit A
KO
K02469
DNA gyrase subunit A [EC:
5.6.2.2
]
Organism
sbos Candidatus Shikimatogenerans bostrichidophilus
Brite
Enzymes [BR:
sbos01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.2 DNA topoisomerase (ATP-hydrolysing)
NHG07_01120 (gyrA)
DNA replication proteins [BR:
sbos03032
]
Prokaryotic type
DNA Topoisomerases
NHG07_01120 (gyrA)
DNA repair and recombination proteins [BR:
sbos03400
]
Prokaryotic type
DSBR (double strand breaks repair)
NHEJ (non-homologous end-joining)
SHIIR (short-homology-independent illegitimate recombination)
Facilitator
NHG07_01120 (gyrA)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WGH28101
LinkDB
All DBs
Position
181968..184445
Genome browser
AA seq
825 aa
AA seq
DB search
MIKNKIINIDINDEIKSSYIDYAMSVIISRALPDVRDGLKPVHRRILYAMYKLKIFYNKN
YKKSARIVGEVLGKYHPHGDKSVYDSIVRMSQSWNLRYKLISGQGNFGSIDNDPPAAMRY
TEIKLEKITENMLDDINKNTVDMKNNFDYSLKEPVILPSKIPNLLINGIYGIAVGMATNM
PPHNLKDTIKTICKYIDNPKISTKKLIKCIKAPDFPTGGIILNYKGVKKSYKKGKGKIII
RSKFYIKEDKNNKYIIINEIPYQVIKSNLIKKIYFLIKNGKIDEIINIKDESNKNGIRII
LIIKKESINEIVINKLLKYSDLQINYHINNIALVKGKPKRLNLKKLIFYFIEHRNEIIIR
KAKYYLSFLKDKIHLLKGFLKISYSIENLFKIIKKSSSYIDSFNIIKNKFKLSKKQIKYI
LNIKLYKLTNKEIKNLLKKYKYYIEKKNINKKIISSKKRRMEIIKKELLLINKIYGDKRK
TLINITNNEFLNYKNNKKNNNNKYLLIISNKGYIKKTLLKDYKTQNRGGKGNKGIIIEKK
DFIKQIIIAYNNYYILFFTKKGKCYWLKVKDIPQCNKKYKGRAIQNLIKINKNDNFKTYI
LIKNINNKEYLNNNYLVLVTSKGLIKKTILKKYSKPRINGIKAIKIKKNDYLFKAKLTKN
NNQILIAINSGKIIRFNENKIKLTNRNSIGVKGIKIKGKKDKVVGMINIKKNKYKYILVV
SYNGYGKLSNLDNYRITNRGCIGIKTINITKKTGKLISIKSVLNNNEDILIIKKSGIIIR
IPINTIRITGRNSQGVKLIKLNKNDKIADITITKVKKIINNDKNN
NT seq
2478 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgataaaaaataaaataataaatattgatataaatgatgaaataaaatcatcttatatt
gattatgctatgtctgttataatttctagagctttaccagatgtaagagatggattaaaa
ccagtacatagaagaatattatatgctatgtataaattaaaaattttttataataaaaat
tataaaaaatcagcacgtatagtaggtgaagtattaggtaaatatcatccacatggtgat
aaatctgtttatgatagtatagtaagaatgtcacaatcatggaatttaagatataaatta
ataagtggacaaggtaattttggatctatagataatgatccaccagcagctatgagatat
acagaaattaaattagaaaaaataacagaaaatatgttagatgatattaataaaaatact
gttgatatgaagaataattttgattattcattaaaagaacctgttatattaccttctaaa
atacctaatttattaataaatggtatatatggtatagctgttggtatggctactaatatg
ccacctcataatttaaaagatactattaaaacaatatgtaaatatattgataatcctaaa
ataagtacaaaaaaattaataaaatgtataaaagcacctgattttcctactggaggtata
atattaaattataaaggtgtaaaaaagtcatataaaaaaggtaaaggtaaaattattata
cgttctaaattttatattaaagaagataaaaataataaatatattattattaatgaaata
ccatatcaagtaataaaaagtaacttaataaaaaaaatttattttttaataaaaaatggt
aaaattgatgaaattattaatataaaagatgaatcaaataaaaatggtataagaataata
ttaataataaaaaaagaaagtattaatgaaatagtaataaataaattattaaaatatagt
gatttacaaattaattatcatattaataatatagctttagtaaaaggtaaaccaaaaaga
ttaaatttaaaaaaattaattttttattttattgaacatagaaatgaaataataattaga
aaagctaaatattatttatcttttttaaaagataaaatacatttattaaaaggtttttta
aaaatatcatatagtatagaaaatttatttaaaattattaaaaaatcttcatcatatatt
gattcatttaatataataaaaaataaatttaaattatctaaaaaacaaattaaatatatt
ttaaatattaaattatataaattaactaataaagaaattaaaaatttattaaaaaaatat
aaatattatatagaaaaaaaaaatattaataaaaaaattatttcttctaaaaaaagaaga
atggaaattattaaaaaagaattattattaataaataaaatatatggagataaaagaaaa
acattaataaatattactaataatgaatttttaaattataaaaataataaaaaaaataat
aataataaatatttattaataatttctaataaaggttatataaaaaaaacattattaaaa
gattataaaacacaaaatagaggaggtaaaggtaataaaggaataataatagaaaaaaaa
gattttattaaacaaataataatagcatataataattattatattcttttctttactaaa
aaaggtaaatgttattggttaaaagtaaaagatataccacaatgtaataaaaaatataaa
gggagagcaatacaaaatttaataaaaattaataaaaatgataattttaaaacttatatt
ttaataaaaaatataaataataaagaatatttaaataataattatttagttttagttact
tctaaaggattaataaaaaaaacaatattaaaaaaatattctaaacctagaataaatggt
ataaaagcaataaaaataaaaaaaaatgattatttatttaaagcaaaattaacaaaaaat
aataatcaaatattgatagctataaatagtggtaaaattattagatttaatgaaaataaa
ataaaattaacaaatagaaattctataggtgttaaaggtataaaaataaaaggtaaaaaa
gataaagtagtaggtatgataaatataaaaaaaaataaatataaatatattttagtagtt
tcttataatggatatggtaaattatctaatttagataattatagaataactaatagagga
tgcataggaataaaaacaataaatataacaaaaaaaactggtaaattaatatctattaaa
agtgttttaaataataatgaagatatattaattattaaaaaatcaggtataattattaga
ataccaataaatactattagaataacaggtagaaattcacaaggtgttaaattaataaaa
ttaaataaaaatgataaaatagctgatataactataacaaaagtaaaaaaaattataaat
aatgataaaaataattaa
DBGET
integrated database retrieval system
