Shewanella baltica OS117: Sbal117_1345
Help
Entry
Sbal117_1345 CDS
T02013
Name
(GenBank) Carotenoid oxygenase
Organism
sbs
Shewanella baltica OS117
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RPE65
TAT_signal
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AEH13107
UniProt:
A0A7U4E0D1
LinkDB
All DBs
Position
1531871..1533541
Genome browser
AA seq
556 aa
AA seq
DB search
MDRRQFLAGSAALMTTAVWASSVDKLLALDNAQAVAREPWAIGFSGAEGDYQPLTMQVSG
EWPAQLSGNLYRNGPAKMSRAGKAYQHWFDGDGMVQQFSVANGQIQHQAKFIQTKKFKVE
EAAGAFKYTTAGTVIPNALPIRNNDDLNVANTSLLPRHGELLALWEAGSPYRLDAQTLTT
LGVKSFGDKFKGLPFSAHPLDDGQGGLWNFGVWYVGGEKQLLVYQVAADDSIARMEVIEL
PQASYLHAFAQSENKLVFYISSCVYEEGETYIDAFKWRPELPSQLLVIDKADFKARQLHP
LPAGFVFHFGQAIEKNDELSVQLCLYPNSAILTQGMKGLLTGARKTKTPHAELVTITVPL
TAPLTAASKTQFAETLSSSARINRSGVMMEFPQFAQHTMSNKESAQQTSNAENLTEKMGG
ASEFVPLFGVGARSDSVANSGANSNFKYEAESESGLSNTLYCIHNTKDSSQHGTDELGDA
SYSAFYLGKGKIAEEPLYIPATEQHEAYLLMTWLDYHNAQSGLSLFRASDISAGPIASAQ
MNRVLPLGFHGCFINA
NT seq
1671 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggatagacgtcaatttctagcaggctctgccgccctaatgacgactgctgtttgggcg
agttcagtggataaattactggcactggataacgcacaagcggtcgcccgtgagccatgg
gccataggttttagcggggcggaaggcgactatcagccactcactatgcaggtttcgggc
gaatggccagcgcaattgagcggtaatttatatcgtaatgggccagcgaaaatgtctcgg
gcaggtaaggcatatcagcattggttcgatggcgatggcatggtgcagcagtttagtgtg
gctaatgggcaaattcagcatcaggctaagtttatccaaacaaagaagtttaaagtggag
gaggccgctggcgcgtttaagtacaccaccgcaggcacagtgatccccaatgctttacct
attcgaaataacgatgacttgaatgtggctaacaccagtttattaccgcgccacggtgag
ttgcttgccttgtgggaagcgggttcaccctatcgactcgatgcgcagaccttaaccacg
ctcggcgttaaaagctttggcgacaagtttaagggcttacccttttccgcccatccactc
gatgatggacaaggtggactgtggaattttggcgtctggtatgtcggcggcgagaagcaa
ttacttgtgtatcaagtggcagccgatgacagcattgccagaatggaagtgattgaatta
ccgcaggcgagttacttacatgccttcgcgcagagtgagaataagctagtgttttatatt
tcatcctgcgtgtatgaagagggcgaaacctatatcgatgcttttaaatggcgacccgaa
ttgccatcgcaattactggttatcgacaaagccgactttaaagcgcgccagttacacccg
ctgcctgctggatttgtgtttcactttggtcaagccattgagaagaatgacgaactgtca
gtgcaactttgcctctatcccaattcggcgattttaactcaagggatgaaggggctactg
acgggcgcccgaaaaacaaaaacaccccatgccgagttagtgacgatcacagtacctctc
acagcaccacttacagcagctagcaaaacgcagtttgcggagaccttgtcctcctctgca
cgtattaaccgcagcggcgtgatgatggagtttccccagtttgcgcagcacactatgagt
aacaaagagtctgcacagcaaacgagcaatgctgaaaatcttacagagaaaatgggtggg
gcatcagagtttgtcccgttatttggcgtcggagcaagatcagactctgttgctaattct
ggtgctaattctaactttaaatatgaagccgaatctgaatcaggactgagtaatactctg
tattgtattcataatacaaaagacagcagccagcacggtacggatgaacttggcgacgcg
agctatagcgcgttttatcttggcaaaggcaagattgccgaagagccgctctatatcccc
gccactgagcagcatgaagcctatttgttgatgacttggctcgattaccacaatgcacaa
tctggcttgtctttgtttcgtgccagtgacatcagtgcgggacccattgcttcggctcag
atgaacagggtattgccgttaggatttcacggttgtttcattaacgcttaa
DBGET
integrated database retrieval system
