Shewanella baltica OS678: Sbal678_1346
Help
Entry
Sbal678_1346 CDS
T01725
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
KO
K02014
iron complex outermembrane recepter protein
Organism
sbt
Shewanella baltica OS678
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
sbt00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
sbt02000
]
Sbal678_1346
Transporters [BR:
sbt02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
Sbal678_1346
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ADT93523
LinkDB
All DBs
Position
1558601..1561567
Genome browser
AA seq
988 aa
AA seq
DB search
MRHCKLSVLTMALATAGFSVVYTPQLAFAAETTPTQQEAKQAQDDNIKNDTNTNTKSVET
NKKASDEAANIERIEVKGYSKSLIDSLDAKRYGDTVSEQLSADDLGALPDVSMADALTRL
PGISAVRTGGQAAEINIRGMSGGFVFSTLNGREQVSTSGTRSIEFDQYPSELISSAAVYK
SPKASLIEGGVAGTVELQTVSPLQSDKDHSFLVNARGMYNDRASEVYGADEYGHRLSMSY
QGKFFDDTLGVALGYARLKQPSVATQFIGLAYNDSKEVDGLANDSNGPIDAPANEYISEG
FELQHLGGVEIRNGYMGAIEWAPRDNFKLKADAFLSRFDSESFARGFRVKFGGSGAAIAN
PVLDGNSVIGGTFNRTSKSYTRVETVNDDNQDFDEVNSFGLNADWQVTDRLNVAADISYS
SAKSNFRNGLLWANVAVDANADTPVFDDNVSISYQLNGLNLPDVGFNQADAFTDLDRVMV
SKYGIYPYENEDAVKAYRLDFKYDLENDYISSVEFGVRYSDRNYSNRRSVFEYGNDGAFS
SAEPPLKLTSDMASVVDWQGEFSYFPSYLAIDLDAALAAWFPEGIPQPVQTWGNADGVLD
AKGYTTNYSWTVLQSGEVFEKVFAAYAMVNFDTEIGGIPVTGNLGLRRVETDQSATVLEN
VGAHPELGAQYIVDDLGIVNNYYAPKIKGIDYVDYLPSLNLSFKITEDSQIRLAAAKVMS
RPPINRLAGDASATANSDGVINGSSTNNPYLKPFYADQYDISYEKYFDEGAFVAALFYKN
IDSFIDTVAITNFDFKGNGFNVPDYIVDPVTGVQTSTSNGTYTTAMNNAEGGYIRGLELA
YTQVFASLPDLFSGLGFNASYSYTESEVQSITSLGGDSATQSLPGLSNNVFSATLFYGYE
GFETRISARYRDAFVSEQVAINDQVVNFDSETVMDYQASYQVTDGLNVLFQVNNLTDEPT
KSYFGTEQKTGTLQYFGREFFLGFTYAL
NT seq
2967 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcgtcattgtaaactcagcgtcttgaccatggctctcgcgacagcaggctttagtgtg
gtgtatacaccgcagttagcctttgcagcagagactacgccaactcaacaggaggccaaa
caagctcaagacgacaatataaaaaacgataccaacacgaataccaagagtgtcgaaacc
aacaaaaaagccagcgatgaagcggcaaatatcgaacgtattgaggttaaaggttacagc
aaaagtctgattgattccctcgatgctaagcgttacggcgacacagtttcagagcaatta
tcggcagatgatcttggcgccttacccgatgtatcaatggcggatgcgctgacccgctta
cccggtatttcagcggtacgtaccggtggacaagcggcggaaattaacattcgcggtatg
tctggcggttttgttttttcaaccttaaatggccgtgaacaggtatcgacgagtggtact
cgcagtatcgagttcgatcaatacccgtctgaactgatttcatccgccgctgtgtataaa
tcccctaaagcctcactcattgaagggggcgttgcaggcacagttgaactgcaaacagtc
agcccactgcaatccgataaagaccatagttttctggtcaatgcccgtggtatgtacaac
gacagagccagtgaagtgtatggtgctgacgagtatggccacagattgagtatgtcttat
cagggtaagttcttcgacgataccttaggcgtggcgttaggttatgcccgtctaaaacaa
cccagtgttgcgacccaatttatcggtttggcttataacgacagcaaagaagttgatgga
ctggctaatgatagcaacggtcctattgatgcccctgcgaatgagtacatcagcgagggt
tttgagctacagcaccttggtggcgttgaaattcgtaacggttatatgggcgcgattgag
tgggctcctagagataattttaagctcaaggccgatgcatttttatcgcgtttcgatagc
gaatcgtttgcccgaggattcagggttaagtttggtggctcaggcgctgcgattgccaat
cctgtactcgatggcaattctgttattggcggaacttttaatcgtacctcaaaaagctat
acccgagttgagactgtaaacgacgataaccaagattttgatgaagtgaatagctttggc
ttaaatgctgactggcaagtgacagacagactgaatgtcgccgccgatatttcctattcc
tcagccaaaagtaactttaggaatggcctgttatgggcgaacgttgctgtcgatgctaat
gctgacaccccagttttcgatgataatgtctcgattagttatcaacttaacgggcttaat
ctgcccgatgtgggctttaatcaagccgatgctttcaccgatctggatcgggtgatggtg
agtaagtacggcatctatccctatgagaatgaagatgcggtaaaggcttatcgccttgat
tttaaatatgaccttgagaatgattacatcagctcagtagagtttggtgtacgttactct
gatcgcaattactccaatcgccgctcggtatttgaatatggcaatgatggcgctttctct
agcgctgagccaccactcaagctgacgtctgatatggcctcggtcgtcgattggcagggt
gagttcagttatttcccctcttatctcgccattgatctcgacgctgcgctagcggcttgg
ttccctgaaggtatcccacaaccagtacaaacctggggaaatgccgatggtgtactcgat
gctaagggctataccactaactattcttggaccgtattgcaaagtggggaggtgttcgaa
aaggtgtttgcggcttatgccatggttaattttgataccgagattggtggtattccagtc
acaggaaatctcggtttacgccgtgttgaaacagaccaatccgcaactgtcttagagaat
gtcggtgcacatccagagcttggcgctcagtacattgtcgatgatttaggcatagtaaat
aactactatgcacctaaaatcaaagggatagattatgttgattatctaccgtcccttaac
cttagttttaagatcactgaagattctcaaatccgtttagctgccgctaaagtaatgtcg
cgtccgcccattaaccgcttggcgggagatgcgagcgcaacggctaatagcgatggggtc
atcaatggttccagtactaataacccttatttaaaacctttctatgcggatcaatatgat
atttcctacgagaaatactttgatgaaggcgcctttgtcgcggcgctattctacaaaaat
attgattcttttattgatactgtggctatcaccaatttcgattttaaggggaatggcttc
aacgtgccggattacatcgtcgatcctgttactggggtgcaaacctcaacaagtaatggc
acttacactactgcaatgaataatgctgagggtggatacattcgcggtttagagttggct
tatacccaagtgtttgcttccttgcccgatttattttccggtttaggttttaacgccagt
tattcttataccgagagtgaggtgcagtccattaccagcctaggcggtgatagtgctact
caatctttacctgggttatcgaataatgtgttcagtgcaaccttgttttatggctatgag
ggctttgaaacccgtatcagcgctcgttaccgtgatgcttttgtctctgaacaggtggcg
attaacgatcaagtggtgaacttcgattccgaaaccgtgatggactatcaagcctcctac
caagtaacggacggtttaaacgtactgttccaagtcaataacctcacagatgaaccgact
aagagttacttcggcaccgagcagaaaaccggcaccctacagtactttggccgcgaattt
ttcttggggttcacctatgccctgtaa
DBGET
integrated database retrieval system
