Candidatus Tachikawaea gelatinosa: TGUWTKB_1520
Help
Entry
TGUWTKB_1520 CDS
T03624
Symbol
dnaE
Name
(GenBank) DNA polymerase III alpha subunit
KO
K02337
DNA polymerase III subunit alpha [EC:
2.7.7.7
]
Organism
sbw
Candidatus Tachikawaea gelatinosa
Pathway
sbw03030
DNA replication
sbw03430
Mismatch repair
sbw03440
Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
sbw00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03030 DNA replication
TGUWTKB_1520 (dnaE)
03430 Mismatch repair
TGUWTKB_1520 (dnaE)
03440 Homologous recombination
TGUWTKB_1520 (dnaE)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03032 DNA replication proteins [BR:
sbw03032
]
TGUWTKB_1520 (dnaE)
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
sbw03400
]
TGUWTKB_1520 (dnaE)
Enzymes [BR:
sbw01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.7 DNA-directed DNA polymerase
TGUWTKB_1520 (dnaE)
DNA replication proteins [BR:
sbw03032
]
Prokaryotic type
DNA Replication Elongation Factors
Elongation factors (bacterial)
DNA polymerase III holoenzyme
TGUWTKB_1520 (dnaE)
DNA repair and recombination proteins [BR:
sbw03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
MMR (mismatch excision repair)
DNA polymerase III holoenzyme
TGUWTKB_1520 (dnaE)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DNA_pol3_alpha
DNA_pol3_finger
PHP
HHH_6
tRNA_anti-codon
DNA_pol_IIIA_C
DUF655
SSB
HAUS2
DUF4447
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BAP58406
UniProt:
A0A090BWD3
LinkDB
All DBs
Position
145821..149318
Genome browser
AA seq
1165 aa
AA seq
DB search
MINPRFIHLNLHSDYSITKGLPKINSIIKKLVELNMPAVALTDFTNLFGVIKFYKLAYHF
GIKSIIGAEFSLNNDIFNIQPTKLTILAINKVGYHNLIMLISYAYQYGYTIKGPTINRDW
LIKFKSGLIILSGGRKGDLGKALLSNNLQLLDKYLLFYKKYFFEHYYLELIRTNRKNEEK
YLQMALEISASENIPVVATNDVCFLNMEDFSIHEIRIAINYGYTINDKRKSNFSCQQYLR
NEKEMCKLFSDIPTALENSVEIAKRCNVIMQFNEYFLPKFIDQTVTEKELLINKSRAGLE
NILKVLFPNANIRSRQRLKYDQRLKKELNVINQMGFPGYFLIVMEFIQWAKENGIPVGPG
RGSGAGSLVAYVLKITDIDPLKFDLIFERFLNPDRISMPDFDIDFCMDKRDKVIDHVAHV
YGRDSVSQIITFGTMTAKAVIRDVGRALGYPYGFVNNISKLIPSDLGITLKKIFSTDSKI
SQIYERDEEIKVLIDIARKLEGVTRNASKHAGGLVISPSKITDFTPLYRDENHKNTVTQF
DKNDIEHIGLVKFDFLGLRTLTIIQNALDMINLRLKKSNSDKINILDISLNDKKSFDLLK
STKTIAVFQLESTGIRKLIKRLQPDCFEDIIALLALFRPGPLQSGMVDNFINRKRGYEKI
AYPDIRWEHKILKPILAPTYGIILYQEQVMQIAQSFAGYTLGSADLLRRAMGKKKPEEME
QHRSIFKNGAKKKGIDTILAMKIFDLVEKFAGYGFNKSHSVAYAFLSYQTLWLKANYPAE
FMAAVINADIDNTEKIVRLIDECKNIGIKILPPNINISMYFFHAKKNNEIFYGMGAIKGI
GKSVIETILNIRKKQSFQDIFDFCQRIDQKKITNKIIEKLIKSGCMDTLGLHRAALISVY
PHALKAAYQNAKRQEVKQVDLFDFISPDKFQQIKGFYSNVALWSDETRLKGEHETLGLYI
TGHPFTQYIQEINTYINHIPLKDINASFIRSTKNIVVVGLVKSIRFLETKFGKRISILIL
DDYSAHLEVVVFSKNLEKYQKFLEKNKILVIQGKIDFDTYNNIKMKAYEIVDIEKARERY
IKSISINCSTKKINAYILNQFYHIIKPYNIGSVPIKFFYKKNNMKQEFFLKNIFNVVPSN
LLIDDLRLLFGHTKIEFTFNPKGQL
NT seq
3498 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgattaatcctcgttttatacatttaaatttacatagtgattattcaatcactaagggt
ttacctaaaataaattctataatcaaaaaattagtagaattaaatatgcctgcagtagct
cttacagatttcacaaatctttttggggtaataaaattttataaattagcttatcatttt
ggaattaaatctattattggtgcagaatttagtttaaacaatgatatatttaatatacaa
ccaacaaaattgactatattagcaattaataaagttggttatcataacttaatcatgtta
atttcatatgcatatcaatatggatatactataaaaggtccaacaattaatcgcgattgg
ttaataaaatttaaaagcggtttaattattttatctggtggtagaaaaggagatttagga
aaagcactgttatctaataatttacaattattagataaatatttacttttttataaaaaa
tatttttttgaacattattatcttgagttaatacgtacgaatcgtaaaaatgaagaaaaa
tatttacagatggctttagaaatttctgcttcggaaaatattcctgtagtggcaactaat
gatgtttgttttttaaatatggaagatttttcaattcatgaaatacgtatagcaataaat
tatggttatactatcaatgataaaagaaaatctaattttagttgtcaacaatatctacgt
aatgaaaaagaaatgtgtaaattgttttcagatattcctacagctttagaaaatagtgta
gaaattgctaaaaggtgtaacgttattatgcaatttaatgaatattttttacctaaattt
attgatcaaacagttactgaaaaagaactattgataaataaatctcgtgcagggttagaa
aatattcttaaggttttatttccaaatgctaatatcagatcgcgtcaacgtttaaaatat
gatcaaagattaaaaaaagaattaaacgttattaatcaaatgggtttcccaggatatttc
cttattgttatggaatttattcaatgggcaaaagaaaatggaatccctgtaggtccagga
agaggttctggtgctggttctttagtagcttatgtattaaaaattactgatattgatcct
ttaaaatttgatttaatttttgaacgttttttaaatcccgatagaatatcaatgcccgat
tttgatattgatttttgtatggataaacgtgataaagttattgatcatgttgcacatgta
tatggtcgtgattctgtatcacaaataataacttttggaactatgacagctaaagctgta
atacgtgacgtaggacgagcattaggctacccttatggttttgttaataatatttcaaaa
ctgattccttctgatttaggtattactttaaaaaaaattttttctacagattccaaaata
tcacaaatctatgaaagagatgaagaaataaaagtattaattgatatagcacgcaaacta
gaaggcgtgactagaaatgcaagcaaacatgcaggaggacttgtaatttcgcctagcaaa
attactgattttacacctctttatcgtgatgagaatcacaagaatactgtaactcagttt
gataaaaatgatattgaacatataggcttagttaaatttgattttcttggattacgtacg
ttaacaattattcaaaacgcattagatatgattaatttacgtctaaaaaaatcaaatagc
gataaaattaatattttagatatttcattaaatgataaaaaaagttttgatttattaaaa
agcactaaaactatcgctgtttttcaattagaatctacagggataagaaaacttataaag
cgattacaaccagactgttttgaagatattatagcattattagcacttttcagacctgga
ccattacaatctggaatggtagataactttattaatagaaaacgtggttatgaaaaaatt
gcttatcccgatataagatgggaacataaaatattaaaaccaattttagcgccgacttat
ggtatcattctttatcaagaacaagtcatgcaaatagctcaatcttttgctggttatacg
ctaggaagcgctgatttacttcgtcgtgcaatgggtaaaaaaaaaccagaagaaatggaa
caacatagatctatttttaaaaatggtgcaaaaaaaaaggggattgatactattttagca
atgaaaatttttgatttagttgaaaaatttgcaggctacggatttaataagtcacattct
gttgcttatgcatttctctcttatcaaacattatggttaaaagcaaattatcctgctgaa
tttatggcagcagttattaatgcagatattgataatactgaaaaaatagtacgtttaatt
gatgaatgtaaaaatattggaataaaaatattacctccaaatattaatatcagtatgtat
ttttttcatgcaaaaaaaaataatgaaattttttatggaatgggagcaataaaaggaata
ggaaaaagtgttattgaaactattttaaatattagaaaaaaacaatcttttcaagatatt
tttgatttttgtcaacgtatcgatcaaaaaaaaataacaaataaaataatagaaaaatta
attaaatcaggatgcatggatactttaggtttacaccgtgctgccttaataagcgtttat
ccccatgctttaaaagcagcttatcaaaacgctaaaagacaagaagtaaaacaagttgat
ttatttgattttatttctccagataaatttcaacaaataaaaggtttctatagtaacgtt
gcattatggtctgatgaaactcgattaaaaggagaacacgaaacacttggtttatatatt
actggacatccctttacgcaatatatacaagaaattaacacttatattaatcatattcct
ttaaaagatattaatgcttcttttataagaagtacaaaaaatatcgttgtagtagggtta
gtaaaatctatacgttttttagagacaaagtttggtaaaagaattagtatattaatactt
gacgactattcagctcatttagaagtagtagttttttcaaaaaatttagaaaaatatcaa
aaatttttagaaaaaaataaaatactagtaatacaaggtaaaattgattttgacacatat
aataatattaaaatgaaagcatacgagatagttgatattgaaaaagctcgtgaacgttat
ataaaaagcatttctattaattgttctacaaaaaaaattaatgcttacattttaaaccaa
ttttatcatattataaaaccttataatattggaagtgttccaataaaatttttttataaa
aaaaataacatgaaacaagagttttttttaaaaaatatttttaatgtagttccaagtaat
ctattaattgatgatttacgtttgttatttggacatacaaaaatagagtttacatttaat
ccaaaaggacaattatga
DBGET
integrated database retrieval system