Sphingobacteriaceae bacterium GW460-11-11-14-LB5: CA265_21805
Help
Entry
CA265_21805 CDS
T05546
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K20276
large repetitive protein
Organism
sbx
Sphingobacteriaceae bacterium GW460-11-11-14-LB5
Pathway
sbx02024
Quorum sensing
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
sbx00001
]
09140 Cellular Processes
09145 Cellular community - prokaryotes
02024 Quorum sensing
CA265_21805
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PKD_4
PKD
PKD_5
K319L-like_PKD
CHU_C
Y_Y_Y
InlK_D3
PKD_3
ChitinaseA_N
Ig_7
fn3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ARS42148
UniProt:
A0A1X9ZA82
LinkDB
All DBs
Position
complement(5356463..5362417)
Genome browser
AA seq
1984 aa
AA seq
DB search
MKIRCTRKWLSFVLFFGAFLFTSNVFAQITIGSVDAGPFTPGSTIAVPFSISAGCAAQGN
QFQLYLSDQNGNFGAETLIGNYTGFYTTYINGKLPASLTPGTGYKVRIKSTAPAFTSTAS
TAFEIKAGPAVEAKLTSTLLNPANDETFGTCTSKANNAFFLTNASTANSTVTASITDEVN
GGSPTLINFPTAIQPFTAQQTHYTIYTKAVMPDGSVATKAYLLINNKAITAFANSGNTVV
CLPLGALTFSVDVSSSAGIQNNFPGDIYTITWGDQTTSTYTLCEIIADGGKVTHAYTRSS
CGSVSTSSAGTIYNAFDVSINVSNAFCTTMGTPVSSSAKVVVKPINSFAFNTPGCTNANI
TFVNTSILGENPNTNTAACTPNNVTYNWYVDGVIKEVDKPKSYNFVYKFPSHGEYTIRLE
SKNITGECDADPVEMKICIQDPPKPDFSLPSTTICAGTTLKATDLSVLDNICNAANNYSW
SVTPAVAFTGGTNAASKEPEFNFTSPGTYTITLSISTPSCGVITSLPQTVVVNANPVATL
SPDITLCNLATYDFNNTTTGPTKTLITGTTKDLPDSYTWTVVPSGTGTYSFTGGTTANSK
YPSIKFDSYDTYTVTVVHKNNCGTASDTQILTFSTAPVISAGPDQNICFNDPGFTLSGTI
TGATATQAWIGGLGTFTPSRNDLNATYTPTAAEKAAGTVTLRLRVTTALAAPCNQIDDDI
ILKIKPNISLTSAAAKTICTGNNVAYTPASAVAGVTYTWTATGTASATGYTASGSGAIND
ILSNTDPSADANVTYIITPHFDGCDGTPFNLVVTIKPNPIVTPTAANASICNATSSAITL
TANLTGVNYTYTSAITGAITGNSNRAIPSAGTQINDILTNTGTTAGTVTYTITPVSTNGC
PGTPGSITITVLPGATLPNAGPDEAICNASAYTLKGNIPVVGTGKWTIVTAPTAITFADD
TQGNTTITGLQAGNSYTLRWTISDTNCATSGDDVRITVNPLSVGGTTTGDVSVCAGANGG
NISLSGQVGNIIRWERSIDNGTNWSTLTSTANPYVFSNLTITTLYRAVIQSGSCAEALST
VTTITVNPGTVAANAGADQNLCSGNGITLNGNNPSPNSGAWTLTSAQTGITITDPTLYNT
TVTGLVPGQTYTFRWTISGFNGCPPSVDDVTVTYYSPVTNNITASTAPVCAGQSINITGD
TPTGGTGTFAYQWQSSADGNTWSNVPSAINKDLTLIVNSSTYFRRLVNSTICTSISNSLQ
VIVLPGLTNNVITADQNICIGTSAAALTGTTPSGGSGTYVYQWQSSLNGTAWSDVLGANG
VNFTPPTPTVSIYYRRSLSSGACSNNLSNQVKITVNPHAKAEITYNKNVGCAPFILDANN
IAATLYPDRNSIYTWFANNVQIGVGPTFPGYTIMNGNESVTIKLIVTSSLGCNTDEKSEV
FSTLPVVTPSFTPSISEGCGPLNVTFTNTTTPLTGAAFKWIFGNGQTSTLAQPPAQTFLA
DPTGKDIVYEVTLETTTPCGPPIIKNAKVIVHAEPVSMFSPDKTTGCSNLLVNFSNTSPE
SVGTTYTYDFGDGTTPEPYPDRRTVSHTFKTLIVKDFIVTMTAKNACGISTSNSTIVVSP
NNVIAELVVNGNEKKGCAPFLVNFVNNTSGASRFLYTFTNEDTGEINTAFSSSTGVYPYT
FTKPGKYTIRLDAENDCSHSFTTETVTILAQPTVGFTADKTSGCSNLAVKFKNTSVGAVG
YLWDFGDGSPTSTEFEPQHTYTGSDVSYTVTLTAINALGCSNPTTKTDFIHIVAPPVATF
TVSPGNELSIPNYSFAFKDISTNAVSWEWTFSDGSGSTLQNPNHTYANEGTYNVTLKVLN
KEGCSSSTFQSVRIIGVPGYLNIPNSFMPASAKNEIKVFKAKGRGIKEWQMSVFNKWGQL
LWETTKLDDGAPLEGWDGTYKGQEQPQGVYYWKVDIKFINGSDWKGMTYDSSPPRKTGVI
YLIR
NT seq
5955 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagattcgttgtacgaggaaatggctttcttttgtcctgttttttggggcatttttg
ttcacgtcaaatgttttcgcccaaattaccataggctcagtagatgcagggccttttacc
ccgggcagtaccattgcagttccttttagcattagcgcaggctgtgcggctcaaggaaat
caatttcagctctatttatccgatcagaacggaaattttggcgccgaaacactcataggc
aactacacgggtttttatacgacttatataaacggtaaacttcctgcaagccttacaccc
ggcacaggttacaaggtcaggataaaatcaactgctccggccttcacaagcactgcctct
acggcgtttgaaataaaggccggacctgcagtagaagcaaaattaacctcaacgttatta
aaccccgcaaacgacgaaacttttggtacctgcaccagcaaagccaataatgcttttttc
cttacaaatgcttctacagcaaacagcacggttaccgctagcataaccgatgaggtaaat
ggagggagcccaactttaatcaatttccctacagccatacagccttttacggcccagcag
acacattataccatttataccaaagccgtaatgcccgatgggtctgtagcaaccaaggct
tatctgctcatcaacaataaagcaataaccgcttttgccaattcgggcaataccgtggtt
tgtttgccactgggcgccttaacatttagtgtagatgtaagttcgagcgcaggtattcaa
aataacttccccggagacatttatacgattacctggggagatcaaacgacatccacctac
accctttgtgagattattgccgatggcggtaaggttacacatgcttatacccgatcctct
tgcggaagtgtttccacctccagtgcgggcacaatctacaacgcttttgatgtatctatt
aatgtatcgaatgcattctgtaccaccatgggcacgcctgtttcttcttcggctaaagtg
gtggtaaaaccgataaattcgtttgcctttaatacccccgggtgtacaaatgccaacatc
acctttgtgaacacctctattctgggcgaaaatccgaacaccaataccgcagcctgtaca
cccaataacgtaacctataactggtatgttgatggggtgattaaagaagttgataaacca
aaatcatacaattttgtatacaagtttccaagccatggagaatatactatccgcctagaa
tctaaaaacattacaggcgagtgtgatgccgatcccgtagaaatgaaaatctgtatccag
gatccgcccaaacccgattttagtttaccttcaacaaccatttgtgccggaacaacatta
aaagcgaccgatctttctgttttagataatatctgcaatgcagccaataactattcatgg
tcagttacacctgctgtggcttttacaggtggtacaaatgcagcaagcaaagaaccggag
ttcaattttaccagtccgggcacctataccatcactttaagcatcagtacgccgtcgtgt
ggagtaattaccagcttaccacaaactgttgtggttaatgcgaatcccgtagctacacta
tcgcccgatattacgttgtgtaacctggccacttacgattttaacaataccacaacaggg
ccaaccaaaacattaattaccggcactacaaaagatttaccagacagttatacctggaca
gttgttccatcaggcacaggaacttatagttttaccggaggtacaaccgccaattctaaa
tatccatccatcaagtttgatagttatgatacctataccgtaacggttgtgcacaaaaac
aattgcggtaccgcaagcgatacccaaatcctaaccttcagtactgcaccggtgattagc
gctggacctgatcaaaacatttgttttaacgacccgggctttacgcttagcggaaccata
accggcgctactgccacacaagcctggattggcggactgggaacctttacccccagcaga
aacgatttgaatgcgacttacacgccaaccgcagctgaaaaagcagcgggtacggtgacc
ttacgattaagggttaccaccgcactggcggcaccctgcaaccagattgacgacgatatt
attcttaaaataaaacccaatatcagtttaacgagcgcagcagctaaaaccatctgtacg
ggtaataatgttgcctatacacctgcttctgcggtcgcgggtgtaacctacacctggacc
gctaccggaaccgcgtcagcaactggctatactgccagcggaagcggagccattaacgat
atccttagcaataccgatccaagtgccgacgcaaacgtaacttatatcatcactcctcat
ttcgatggctgcgatggaacgccctttaatttggtggtgaccattaaacccaatcctatt
gtaacacctactgccgccaatgcaagcatctgtaatgccacttcatcggccattacctta
acagcaaacctaacgggtgtaaattatacttataccagtgcgatcaccggagcaataacc
ggaaacagcaatagagcaatcccatctgcaggaacacaaattaacgatatcttaaccaat
acaggcaccactgcaggtacggtaacttataccattacacctgtctctacaaatggctgc
cctggcacaccaggcagcattaccattacggttttgccaggtgcaacactgccaaatgcc
gggccggatgaagccatttgtaacgcaagcgcttacaccttaaaaggaaatataccagta
gttggcacaggcaaatggacaatcgttacagcacctacggccataacttttgctgatgat
acgcagggcaatacaacaatcactggtctgcaggcggggaatagctatactttaaggtgg
accataagcgacaccaactgcgctacttcgggtgatgatgtcaggatcacggttaacccg
ctcagtgttggcggcacaaccacaggcgatgtgagtgtatgtgcaggtgcaaatggcgga
aacatcagtttaagcgggcaggttggaaatattatccgttgggaaagatctatcgataac
ggtacaaactggtctacccttacctctacagcaaatccatatgtattttcaaaccttacc
ataaccaccctgtaccgtgcggtaattcaaagtggtagttgtgcagaggccctatcaacc
gtaaccaccatcacggtaaatccgggcactgttgcggccaatgcaggggcagatcaaaac
ctttgcagtggaaacggtattactttaaatggcaataatccttcgccgaacagtggtgcg
tggactttaacttcagcacaaaccggcattaccatcaccgatcctacgctttacaacacc
acggttactggtctggtaccaggacaaacttacactttccggtggaccatttctggcttc
aatggctgtccaccatctgtagatgatgtaaccgtcacctattattcgcctgttaccaat
aatattaccgcatcaacagcgccggtttgtgccggacaaagcatcaacattaccggcgat
accccaacaggcggaaccggaacttttgcctatcaatggcagagcagtgcggatggaaat
acctggagcaatgttccttcggccattaataaggatttaaccctaatcgtaaactcctca
acttatttcagaagactggtaaacagcaccatctgcacttcaatcagtaattcgctacag
gttattgttttaccaggcttaacgaacaatgttattacagccgatcaaaacatctgtatt
ggtacatcggcagcagctttaaccggtactacgccaagtggtggcagcggaacttatgtg
tatcaatggcaatcgagcttaaacggaacagcctggagcgatgtgctgggggcaaatggt
gtaaactttacgcctccgacaccaactgtaagcatttattaccgccgatcgttaagcagc
ggagcttgcagcaacaacttaagcaaccaggttaagataacagttaatccacatgctaag
gcagaaattacctataataaaaatgttggctgtgccccttttattctagatgcaaacaat
attgccgcaactttatatcccgataggaacagtatttatacctggtttgccaacaatgta
cagatcggcgtaggaccaacatttccgggttataccatcatgaatggaaatgaaagcgta
accataaaactgattgttacaagtagtttgggctgtaatacggatgaaaaaagtgaggta
tttagcacgcttcccgtagttacgccttcttttactccaagtatatctgaaggttgcggc
ccacttaatgttacttttacaaataccacgaccccacttaccggcgcagcatttaaatgg
atttttggcaatggacaaacatcaactttagcccaaccaccagctcaaacttttttggca
gacccaaccggaaaagacattgtttatgaagttaccctagaaaccaccacaccatgtggt
cctccaattataaaaaacgcaaaagttatcgtgcatgcagaacctgtttctatgttttcg
cccgataaaacaacaggatgttctaatctgcttgtaaactttagcaatacttctccagaa
agtgtgggcacaacctatacctacgattttggtgatggcactaccccagaaccctatcca
gatagaagaacggtaagccatacctttaaaacgcttatcgttaaggattttatagtaacg
atgactgcaaaaaatgcttgcggaataagcacttctaatagcactattgtagtttcacca
aacaatgttattgcagaactggtggtaaatggaaatgagaaaaaaggctgcgcccctttc
cttgttaattttgtaaacaataccagtggagcgagcagatttctttacacttttaccaat
gaagataccggtgaaatcaataccgcattctccagctctacaggtgtttatccgtacacc
tttaccaaacctggaaaatataccatcaggttagacgcggaaaacgactgttcacatagt
ttcacgacagaaactgttaccatcttagctcagccaacagtaggctttactgcagataaa
acctctggctgcagcaatctagcagttaagtttaaaaacaccagtgttggtgcagtaggc
tatctatgggattttggcgatggttctccaacctcaactgagtttgagccacagcatact
tacaccggatcagatgtaagttatactgtaaccttaacagcaatcaatgcattgggttgt
tctaaccctacaacaaaaaccgattttatccacattgttgcgccaccagtggccacattc
accgttagccccgggaatgaattatccattcccaactattcatttgcctttaaagatatc
agtaccaatgccgtaagctgggaatggacttttagtgatggatcgggatcaaccctacaa
aacccaaaccacacctatgccaacgaaggcacttataatgtaacgctaaaagtgctgaac
aaagaaggttgttcttcgagcactttccaatcagtaaggattatcggcgtaccgggctac
ttaaacatccccaattcatttatgcctgcaagtgcgaagaacgaaatcaaagtttttaaa
gcaaaaggccgtggcattaaagaatggcagatgtctgtttttaacaaatgggggcaatta
ctttgggaaaccaccaaactcgacgatggcgcaccgctggagggctgggacggtacttat
aaaggacaggaacaaccacaaggtgtttattactggaaagtagatataaaatttattaat
ggcagcgattggaaaggaatgacttacgattcatctcctccaaggaaaacgggtgtaata
tatttaataagatga
DBGET
integrated database retrieval system